DPC is door de 10K !
Even wat misvattingen wegwerken (of een poging daartoe)
Geen enkel DC project is er al in geslaagd een cure te vinden voor eender welke ziekte of plaag. Er is de voorbije jaren wel enorm veel vooruitgang geboekt in het onderzoek hoe computers en software modellen kunnen helpen. Hoe meer projecten in die zin, hoe sneller dat onderzoek vordert.
Elk medisch getint DC project heeft zo z'n eigen insteek, en da's maar goed ook. Die diversiteit is de beste garantie op vooruitgang.
Wat is nu Rosetta@Home, hoe past dit project in dat plaatje, wie zit erachter, wat zoeken ze, ... en vooral: waarom zou DPC hier aan meedoen ?
Heel simplistisch gezegd: Rosetta is de naam van een methode om proteinen te vouwen. Die methode wordt ondermeer gebruikt in het Boinc project Rosetta@Home voor 2 gelijktijdige doelen:
- het verbeteren van de methode (het algoritme zeg maar)
- het zoeken naar de laagste energie structuur van synthetische proteinen
Rosetta (de methode) bestaat al vrij lang, Rosetta@Home (de boinc toepassing) is er nog maar recent. Rosetta heeft z'n deugdelijkheid (en superioriteit tov andere vouw methodes) al uitvoerig bewezen. Dat neemt niet weg dat die andere methodes evenzo een bestaansreden hebben, er is immers niet slechts 1 manier om de "500-dimensionele" proteine puzzel te doorgronden.
Rosetta wordt overigens ook gebruikt als de basis software voor
Robetta. Robetta is een publiek toegangkelijke server infrastructuur waarop wetenschappers en academici proteine structuren kunnen laten uitrekenen en voorspellen. Het is evident dat verbeteringen aan de Rosetta methode en software, een immense impact hebben op het onderzoek dat academici uitvoeren via de Robetta infrastructuur.
Op dit ogenblik is er nog geen directe (computer) link tussen onderzoek dat gebeurt op de Robetta infrastructuur, en het Rosetta@Home project, maar er zijn wel
plannen in die richting:
If there are enough Rosetta@home participants, we also plan to use Rosetta@home to provide computational resources that will reduce the long wait period for structure predictions on the Robetta server and will enable us to add more functionality, such as design and docking, that we currently cannot provide because of limited computing resources. By integrating Robetta and Rosetta@home, volunteers, like you, will not only help our efforts, but will directly help the efforts of scientists from around the world doing critical research on biomedical issues such as cancer, SARS, HIV/AIDS, malaria, and much more.
De redenen waarom
ik ben overgestapt op R@H zijn:
- Find-a-Drug stopt ermee omdat ze hun doel ruimschoots gehaald hebben. Waarom dan nog langer daar crunchen?
- het project hangt af van een universiteit (UW) en de vooruitgang is vrij beschikbaar voor alle onderzoekers
- R@H is gebaseerd op een methode die al langer bestaat, die bewezen heeft erg goede resultaten neer te zetten en die bovendien dmv het project voortdurend geperfectioneerd wordt
- het is een startend project, ik heb een zwak voor underdogs ;à
- de anderen (F@H, P@H, ...) hebben al een immense user-base, ik wil mijn cpu-cycles spenderen aan het verhogen van de diversiteit

edit: hoofdreden vergeten te vermelden ...
[
Voor 3% gewijzigd door
ColdRain op 06-11-2005 20:39
]