[Stampede 19] Back to Rosetta@Home

[KuuKe]

Nee, Rosetta@Home is CPU-only.

[BlueTooth76]

jaapstobbe schreef op dinsdag 24 maart 2020 @ 18:01:
Ik heb een 1080Ti maar ik heb niet de indruk dat mn GPU uberhaupt gebruikt wordt voor Rosetta. Is dit een instelling of is het CPU only?

CPU only.

De GPU kan je dan wel weer inzetten voor Folding@home
Bij Folding@home zou ik dan wel het CPU-slot weghalen.

[ Voor 8% gewijzigd door BlueTooth76 op 24-03-2020 18:05 ]

[r_j]

Kan de client niet downloaden...
Wat nu?

[Suicyder]

r_j schreef op dinsdag 24 maart 2020 @ 19:12:
Kan de client niet downloaden...
Wat nu?

Als je geluk hebt heeft iemand hier de installer nog ergens staan die je nodig hebt. Ik niet in ieder geval.

Even geduld dan tot Boinc Berkeley weer up is, zal niet zo heel lang duren vermoed ik.

[mrdemc]

r_j schreef op dinsdag 24 maart 2020 @ 19:12:
Kan de client niet downloaden...
Wat nu?

Ik heb vandaag de Windows client gedownload. Via WeTransfer even geupload en 7 dagen beschikbaar vanaf nu (de installer is digitaal ondertekend door de universiteit dus daarmee kun je de bron bevestigen):
https://we.tl/t-DmSGitoZVH

Mocht je de windows client zoeken. Als je de linux client zoekt, deze staat ook in de repositories.

[ Voor 3% gewijzigd door mrdemc op 24-03-2020 19:23 ]

[lxh]

Mooi om weer eens m'n kachel hiervoor in te zetten. Heeft hyperthreading aanzetten nog zin voor deze software? (2 CPU's, elk 4 Cores, 24 GB ram)

[Bubbles]

lxh schreef op dinsdag 24 maart 2020 @ 19:27:
Mooi om weer eens m'n kachel hiervoor in te zetten. Heeft hyperthreading aanzetten nog zin voor deze software? (2 CPU's, elk 4 Cores, 24 GB ram)

Het heeft wel nut, maar verwacht niet twee keer zoveel output. Met die hoeveelheid geheugen zou je het wel moeten kunnen redden, maar veel ga je niet meer over houden.

[Theadalus]

Voor mensen die (tijdelijk) wat extra power willen hebben; het huren van een dedicated server (geen gecapte VPS o.i.d.) hoeft niet zo duur te zijn.
Voor geïnteresseerden weet ik wel een club waar je bv een AMD 1700X Pro kunt huren voor nog geen 50 euro per maand (incl. BTW).

Ik heb zelf ook een paar.

[kipni]

Enkele vraagjes,

- Wat is een stampede?
- Ik heb een 3-tal machines draaien en ik zie op 1 van mijn machines de cpu niet over de 50% gaan. Zie computer 10.0.2.104 in de screenshot
- Waarom heb ik 2 types applicaties draaien? Rosetta en Rosetta mini, wat is het verschil welke draait het best en hoe manipuleer je dit?

[Damic]

@kipni dat kun je niet aanpassen, weet niet wat het verschil tussen de 2 is maar heeft wrs met het type werk te maken. Anderzijds staat je cpu wel op 100% core gebruik?

[aliencowfarm]

KuuKe schreef op dinsdag 24 maart 2020 @ 09:05:
Je krijgt vanzelf je COVID-units binnen zag ik.

Kun je eigenlijk überhaupt zien aan welk project je werkt?

10v3nmgb_c14108_10mer_gb_000301_SAVE_ALL_OUT_896872_372_0 zegt zo weinig.

rb_03_16_18637_18451_ab_t000__h001_robetta_IGNORE_THE_REST_10_07_902202_9_1

Schijnt dit te wezen maar ook dat zegt me niet veel

[Suicyder]

@aliencowfarm
Aan die namen inderdaad, 75% van de taken die ik heb draaien nu hebben COVID in de naam staan.

[aliencowfarm]

Suicyder schreef op dinsdag 24 maart 2020 @ 21:17:
@aliencowfarm
Aan die namen inderdaad, 75% van de taken die ik heb draaien nu hebben COVID in de naam staan.

Nog niet voorbij zien komen. Maar dat maakt me niet zoveel uit. Ander projecten zijn ook nuttig

[L0g0ff]

Gisteren voor het eerst folding@home geïnstalleerd via docker op mijn synology. Maar na de nieuwspost van gisteravond toch besloten om in met jullie actie mee over te stappen naar rosetta@home.

Uiteindelijk heb ik best wel een paar uurtjes zitten prutsen om alles aan de gang te krijgen. Maar ik vind het een behoorlijk onduidelijk geheel. Zeker omdat de officiële wiki heel de avond plat ligt, daardoor goede documentatie niet beschikbaar was en ook de download pagina stuk was. Dat helpt allemaal niet mee

Wat goed is om te weten (misschien goed om de startpost wat te verrijken met extra info):

1. De docker container is niet een op zichzelf staand geheel met web interface. Je installeert feitelijk een client die je daarna met een desktop manager moet configureren en koppelen aan het rosetta@home project.

2. Voor synology kun je het beste even met putty inloggen en op deze manier de docker aftrappen

Maak eerst een directory aan in je home folder: boinc
Vervang in onderstaand script de <username> met je username van je nas.

Trap dit script af:

code:

docker run -d \
  --name boinc \
  --net=host \
  --pid=host \
  -v /var/services/homes/<username>/boinc:/var/lib/boinc \
  -e BOINC_GUI_RPC_PASSWORD="123" \
  -e BOINC_CMD_LINE_OPTIONS="--allow_remote_gui_rpc" \
  boinc/client

3. De standaard TCP poort is: 31416. Je krijgt een Access denied als je die met een webinterface probeert te benaderen. Dit is normaal dus Maar een nettere melding was geweest: Please use a Boinc manager oid.

4. Na het installeren van de officiële boinc client moet je even switchen naar advanced modus en daar kun je de docker container koppelen.

5. Vergeet niet je CPU verbruik iets wat terug te schroeven zodat je NAS nog een beetje adem ruimte over houdt voor andere zaken

De rest was redelijk straight forward als je de startpost heb gelezen.

Ik heb niet een hele zware NAS maar alle beetjes helpen

Succes met de Stampede en laten we hopen dat het wat bijdraagt aan een Corona oplossing!

[ Voor 3% gewijzigd door L0g0ff op 25-03-2020 00:18 ]

[lasermen]

ari2asem schreef op dinsdag 24 maart 2020 @ 14:45:
[...]

hier kun je niks aan doen. boinc helemaal afsluiten (manager en client), computer rerstart en weer boinc starten. blijf je alsnog berekeningsfouten zien, dan kun je beter er niet aan mee doen. klinkt hard, maar dit soort fouten is niet te corrigeren. want het is heel astig om oorzaak van te vinden.
is het je memory? is het je cpu? lastig dus


[...]
jeez...per taak 500-600mb werkgeheugen nodig, er zitten ook paar van 200-300mb...ik heb nu 80gb aan ram, dat is dus niet genoeg voor mij, want heb paar taken in boinc staan op: WAITING FOR MEMORY


[...]

mijn systeem is 128 threads, 80gb ecc-reg (dual socket epyc 7551) ....hij heeft het zwaar met rosetta.

Met 80GB ram heb je niet gebalanceerde geheugen configuratie voor zo'n systeem. Gezien je 16 kanalen dient te vullen. Loopt het systeem ook een stuk vlotter door.
Verder is de 7551(P) een erg leuke CPU. We hebben zelf een stuk of 100 in gebruik.

[ Voor 6% gewijzigd door lasermen op 25-03-2020 00:45 ]

[hrothberht]

pindamaster schreef op dinsdag 24 maart 2020 @ 12:48:
Ook maar van de partij met paar pc's krijg alleen wel op een bakkie allemaal berekeningsfouten, hoe los ik dat op?
[Afbeelding]

ari2asem schreef op dinsdag 24 maart 2020 @ 14:45:
[...]

hier kun je niks aan doen. boinc helemaal afsluiten (manager en client), computer rerstart en weer boinc starten. blijf je alsnog berekeningsfouten zien, dan kun je beter er niet aan mee doen. klinkt hard, maar dit soort fouten is niet te corrigeren. want het is heel astig om oorzaak van te vinden.
is het je memory? is het je cpu? lastig dus

Als je inlogt op je account en je naar Taken gaat, dan kun je daar op de ID van de gefaalde Task klikken voor de STDERR output. Daar kun je dan zien of er bijvoorbeeld een out of memory exception was. Maar soms ligt het ook gewoon aan een foute work unit.

Reason: Out Of Memory (C++ Exception)

Omdat ik zelf zag dat ongeveer de helft van mijn taken faalde op mijn oude laptop met maar 4GB RAM, wilde ik instellen dat er maar twee taken tegelijkertijd kunnen runnen. Het kostte wat moeite om te vinden hoe ik dat in kon stellen, dus ik plemp het ook maar even hier. Maak een file app_config.xml aan in de data folder van het project (bijvoorbeeld C:\ProgramData\BOINC\projects\boinc.bakerlab.org_rosetta) en plak hierin:

XML:

<app_config>
   <project_max_concurrent>2</project_max_concurrent>
</app_config>

Hier in de wiki staan nog meer instellingen die je client-side kunt configureren.
Ook is er het bestand global_prefs.xml in de BOINC data folder waar je dingen eventueel handmatig kunt instellen als het met de GUI niet zo makkelijk lukt.

[Xfade]

kipni schreef op dinsdag 24 maart 2020 @ 20:39:
Enkele vraagjes,

- Wat is een stampede?

Stampede is waar in iedereen switched van andere vouwtaken naar puur rosetta ipv andere taken/clients en alleen maar crunched voor die tijd. Geen pauzes. Denk dat heel veel dat niet doen omdat nieuwe mensen, zoals ik, het op hun main pc doen.

[ari2asem]

lasermen schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 00:39:
[...]


Met 80GB ram heb je niet gebalanceerde geheugen configuratie voor zo'n systeem. Gezien je 16 kanalen dient te vullen. Loopt het systeem ook een stuk vlotter door.
Verder is de 7551(P) een erg leuke CPU. We hebben zelf een stuk of 100 in gebruik.

je hebt helemaal gelijk. het beste is per cpu 4 dimms of 8 dimms.

ik heb nu per cpu 5 dimms...ik ga morgen 1 dimm per cpu verwijderen om te kijken wat voor gevolgen dit op R@H heeft. dan heb ik in totaal dus 64gb voor 2 cpu's.

mijn meeste taken lopen nu op rond 6-8uur @ 2500mhz van cpu full load

[Damic]

Dat is hetzelfde als hier, ook rond de 8 a 9h per taak op 3.7GHz, wel full load / thread maar cpu word amper warm = niet echt aan't werken.

[ZBB]

Hi, voor het eerst weer sinds 3 jaar boinc erop gezet, project rosetta toegevoegd, account gemaakt, account gekoppeld aan DPC, nu zie ik in project view -> Rosetta staan, maar geen team, en hij lijkt ook niks binnen te halen aan werk. (in de eerste 20 min)
(status is: communication deferred [timer])

Ben ik gewoon ongeduldig of moet ik nog iets specifieks doen?

[Suicyder]

@ZBB
Team duurt soms even voor het gesynchroniseert is, geef het een uurtje. Eerste werk zou vrij snel moeten kunnen eigenlijk. Als je het project aanklikt en zegt bijwerken?

[BdK9001]

Ik heb nog een extra pc aangeslingerd vanmorgen, maar die krijgt maar mondjesmaat downloads aangeboden (lees: 2-15kb/s per download). Toegegeven, hij krijgt z'n internet via 'verbinding delen' van een machine die weer aan de wifi hangt, dus de max download voor deze bak is ook maar 3Mbit...

Voordeel is wel dat de studeerkamer nu 's nachts niet meer afkoelt

[djvdorp]

Zojuist het DPC team gejoined bij zowel R@H als F@H voor nu. Ik weet niet of ik hier de link mag delen, maar als er meer casual mensen willen joinen, het is deze post (niet van mij of collega's) die het vrij makkelijk maakt om zowel R@H als F@H te joinen middels hun Docker images: https://blog.linuxserver..../covid-19-a-quick-update/

Kijk uit naar de Stampede!

[hrothberht]

ZBB schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 08:21:
Hi, voor het eerst weer sinds 3 jaar boinc erop gezet, project rosetta toegevoegd, account gemaakt, account gekoppeld aan DPC, nu zie ik in project view -> Rosetta staan, maar geen team, en hij lijkt ook niks binnen te halen aan werk. (in de eerste 20 min)
(status is: communication deferred [timer])

Ben ik gewoon ongeduldig of moet ik nog iets specifieks doen?

Ik denk dat hun servers overbelast zijn. Ik heb dit in m'n event log nadat het uploaden van een geëindigde taak meermaals niet lukte:

3/25/2020 9:26:41 AM | Rosetta@home | Temporarily failed upload of rep26_0041_symB_reordered_0002_propagated_0001_0001_0003_A_fold_SAVE_ALL_OUT_903232_68_0_r1517980480_0: transient HTTP error
3/25/2020 9:26:41 AM | Rosetta@home | Backing off 00:15:18 on upload of rep26_0041_symB_reordered_0002_propagated_0001_0001_0003_A_fold_SAVE_ALL_OUT_903232_68_0_r1517980480_0
3/25/2020 9:23:18 AM |              | Internet access OK - project servers may be temporarily down.

En op twitter meldden ze vanochtend dat het aantal gebruikers in de afgelopen maand verdubbeld is en dat de afgelopen 4 dagen in hun top 10 van meeste rekenkracht stonden.

[ Voor 22% gewijzigd door hrothberht op 25-03-2020 09:29 ]

[kipni]

Website Rosetta zwaar te verduren?

[clannad]

@hrothberht Hier hetzelfde probleem. Maar ik werk met NordVPN. Ik dacht eerst dat daar het probleem lag.

[Verwijderd]

hrothberht schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 09:27:
[...]
Ik denk dat hun servers overbelast zijn. Ik heb dit in m'n event log nadat het uploaden van een geëindigde taak meermaals niet lukte
[...]

Komt bij mij eens per dag voor met 1 te uploaden taak. Die is dan wel 10 minuten later (na 3 a 4 back-offs) succesvol geupload. Zolang je transferlijst leeg is (en niet opspaart) is er niets aan de hand.

Het kan zijn dat er op een moment heel veel systemen tegelijk de taken uploaden, maar volgens mij is er geen sprake van een structurele overload.

Voor wie geinteresseerd is in een stukje terugkoppeling van het team wat dagelijks hard aan het werk is om nieuwe taken op te zetten en de voltooide taken te analyseren.

[ Voor 4% gewijzigd door Verwijderd op 25-03-2020 09:55 ]

[termination]

Voor wie op linux draait en zelf ook wat monitoring wil inrichten, Netdata ondersteund out-of-the-box het scrapen van BOINC.

Netdata heeft zelf al een aardig uitgebreid dashboard maar deze kun je vervolgens ook weer uitlezen met Prometheus en de boel visualiseren in Grafana om zo je eigen dashboards in elkaar te sleutelen.

[hrothberht]

Verwijderd schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 09:52:
[...]
Voor wie geinteresseerd is in een stukje terugkoppeling van het team wat dagelijks hard aan het werk is om nieuwe taken op te zetten en de voltooide taken te analyseren.

Goed om te weten dat het belangrijk is om de nieuwste versie van de software te hebben. Ik zal regelmatig in de gaten houden of er een nieuwere versie is

[ZBB]

hrothberht schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 09:27:
[...]


Ik denk dat hun servers overbelast zijn. Ik heb dit in m'n event log nadat het uploaden van een geëindigde taak meermaals niet lukte:

3/25/2020 9:26:41 AM | Rosetta@home | Temporarily failed upload of rep26_0041_symB_reordered_0002_propagated_0001_0001_0003_A_fold_SAVE_ALL_OUT_903232_68_0_r1517980480_0: transient HTTP error
3/25/2020 9:26:41 AM | Rosetta@home | Backing off 00:15:18 on upload of rep26_0041_symB_reordered_0002_propagated_0001_0001_0003_A_fold_SAVE_ALL_OUT_903232_68_0_r1517980480_0
3/25/2020 9:23:18 AM |              | Internet access OK - project servers may be temporarily down.

En op twitter meldden ze vanochtend dat het aantal gebruikers in de afgelopen maand verdubbeld is en dat de afgelopen 4 dagen in hun top 10 van meeste rekenkracht stonden.

Thanks, ik heb inderdaad mijn log gevonden, en daar lijkt ook in te staan dat de servers niet bereikbaar zijn. Maar dat lijkt in lijn met jouw log. Thanks, dan wacht ik nog even rustig af.

[A-Jay]

Super blij met alle enthousiasten mensen....

Moet nu mijn RML generator gaan aanpassen want die kan niet meer in 1 keer gepost worden met de stats erin

Kleine toenamen in de afgelopen dagen

20-3 -> 82 flushers
21-3 -> 82 flushers
22-3 -> 94 flushers
23-3 -> 165 flushers
24-3 -> 535 flushers

Lekker bezig met zijn allen

[A-Jay]

En aangezien we van stats houden

2015 - 66 deelnemers
2016 - 395 deelnemers
2017 - 161 deelnemers
2018 - 71 deelnemers
2019 - 55 deelnemers
2020 nu al 535 deelnemers

[Verwijderd]

A-Jay schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 10:58:
Super blij met alle enthousiasten mensen....

Ps. Kan je ook gelijk je avatar aanpassen naar XIX (19e)

[Benjamin1987]

Zo, heb mijn machine ook maar weer eens aangeslingerd. Mijn eerste stampede. Ik neem aan dat als ik bij de Powercows hoor en Rosetta heb ingesteld als project ik automatisch meedoe met de stampede? Anyhow, ik zit nu op 80k punten, eens kijken of we de miljoen kunnen halen ;D!

[enthernal]

vandaag ook een paar koetjes aan het werk gezet. Wel jammer dat Rosetta zoveel geheugen nodig heeft, nu draait mijn ryzen 1700X maar op halve kracht.

[Suicyder]

@Benjamin1987
Op de pagina -> https://boinc.bakerlab.org/rosetta/home.php
Rechts staan de teaminstellingen, als daar staat "Lid van team Dutch Power Cows · Verlaat team" dan zit je er in. Anders moet je nog even het team toevoegen.

@enthernal
Standaard bij een machine licht in gebruik zet hij het maximum geheugengebruik op 50% van het beschikbare geheugen, dit kan je naar 90-95% brengen als je wil in de computer voorkeuren, zoals velen onder ons al gedaan hebben,

[ Voor 33% gewijzigd door Suicyder op 25-03-2020 11:57 ]

[enthernal]

Ja het staat al op 90%. Ik heb helaas maar 8GB in die koe, normaal ruim voldoende gezien het linux draait. Op zich geen probleem, zolang ik maar aan de verleiding kan weerstaan om de geldbuidel open te trekken

[Verwijderd]

enthernal schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 12:03:
Ja het staat al op 90%. Ik heb helaas maar 8GB in die koe, normaal ruim voldoende gezien het linux draait. Op zich geen probleem, zolang ik maar aan de verleiding kan weerstaan om de geldbuidel open te trekken

Of een Tweaker lief aankijken of hij nog 8GB voor je heeft tbv de Corona bestrijding.

Kan je daarna ook nog wat VM's, Docker containers of Kubernetes op je machine draaien. Heb je ineens een heus vitueel machinepark op je Ryzen

[ Voor 13% gewijzigd door Verwijderd op 25-03-2020 12:31 ]

[PeGys]

Ik heb dan weer 32GB en maar 4 cores/8 threads.

Nooit meer dan 12GB gebruikt

[L0g0ff]

Ik heb Rosetta op mijn Nas (docker) draaien maar heb best wel een herrie van Rosetta/boinc client ipv folding@home. Folding was lekker stil omdat die echt alleen maar CPU cycles nodig leek te hebben. Die Nas staat in mijn woonkamer onder mijn tv dus die staat continue te rammelen.

Ik heb geen ethernet boven dus even mijn NAS verplaatsen is helaas geen optie.

Is daar nog iets aan te doen? Bijvoorbeeld andere type minder disk intensieve taken aanpakken ofzo?

[Ken G]

Ook begonnen met Rosetta@Home, mijn eerste 9 taken zijn al af :-)
Mijn Ryzen 3600 draait mooi op 90% en 12GB (van de 16GB beschikbaar) in gebruik.

[Verwijderd]

Makkelijke vuistregel is idd 1GB per task (per core) voor Rosetta@home

[Bumpy_NL]

Ook ik ben begonnen op 2 cores van een i5 6600. Alle beetjes helpen .

[Cid Highwind]

Ook hier nog een koe die zich voor de kudde aanmeldt. Heb me de afgelopen weken met F@H bezig gehouden, althans, voor zover er werk beschikbaar was. Dat viel helaas wat tegen. Wel was het leuk te zien hoe een ooit door mij opgericht team nog altijd in de top 200 stond en hoe we destijds zelfs nog een tijdje om en nabij de DPC stonden.

Ik heb me nog niet helemaal ingelezen over wat nu werkelijk goede hardware is, dat komt nog wel. Ook hier gaat er in ieder geval een i5 6600k aan de bak, op krachtvoer (4.5GHz), en als het even kan wordt de R9 Fury ook aan het werk gezet. (Edit) Maar die laatste dus voorlopig mag nog in de F@H weide gaan grazen.

Zijn er nog belangrijke zaken die ik als Rosetta n00b moet weten?

[ Voor 5% gewijzigd door Cid Highwind op 25-03-2020 14:28 ]

[The_Worst]

Gewoon aanzetten en laten lopen. Hou er rekening mee dat je per core/taak wel 1gB aan geheugen moet hebben.

[Cid Highwind]

Dank! Inmiddels staan er 4 projecten te torren, de synchronisatie van het team is ook gelukt. Over geheugen zit ik niet in, als het 2GB was dan was er nog steeds genoeg over. En de temperaturen blijven ook netjes binnen de marge.

[filthymushroom]

Cid Highwind schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 14:27:

Zijn er nog belangrijke zaken die ik als Rosetta n00b moet weten?

Meer computers is meer beter?

[filthymushroom]

Panzer_V schreef op maandag 23 maart 2020 @ 19:08:
@KuuKe , de link [Meld je aan voor de stampede.] is dood. Kijk jij hier nog even naar?

@KuuKe Moeten we ons nog aanmelden voor de Stampede of is lid zijn van DPC genoeg? Ik dacht al meegekregen te hebben dat er geen sub-teams worden gemaakt dit jaar?

[Compizfox]

Ik doe ook mee met het Threadripper-systeem (3970X) van mijn vakgroep! (op momenten dat ik hem niet gebruik voor m'n eigen MD-simulaties, in elk geval )

[D_Jeff]

@Compizfox Howdi Partner!
(Nog een gebuikert met een TR 3970x hiero)

Tipje: Als je het aantal werktaken onder de 33 houdt, zal je CPU alle taken op 4 GHz draaien. 63 taken houdt de boel op slechts 3.8 GHz waardoor het iets langer duurt om een taak af te ronden.

[KuuKe]

filthymushroom schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 15:11:
[...]


@KuuKe Moeten we ons nog aanmelden voor de Stampede of is lid zijn van DPC genoeg? Ik dacht al meegekregen te hebben dat er geen sub-teams worden gemaakt dit jaar?

Klopt, lid zijn van DPC is voldoende. We doen niks meer met stampedeteams. DPC is één grote stampedeteam

[ZBB]

zucht.. bij mij nog steeds geen verbinding en dus geen taken binnengehaald.. ik zie dat andere dat wel lukt? is het een windows/linux probleem? (ik zit op windows 10)

[filthymushroom]

ZBB schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 15:31:
zucht.. bij mij nog steeds geen verbinding en dus geen taken binnengehaald.. ik zie dat andere dat wel lukt? is het een windows/linux probleem? (ik zit op windows 10)

Nee, doorgaans gewoon wachten. Desnoods even kijken of er een taak is vastgelopen en die er even uitgooien en de cliënt opnieuw starten.

Meestal duurt t de eerste keer wel een half uurtje.

[Compizfox]

D_Jeff schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 15:19:
@Compizfox Howdi Partner!
(Nog een gebuikert met een TR 3970x hiero)

Tipje: Als je het aantal werktaken onder de 33 houdt, zal je CPU alle taken op 4 GHz draaien. 63 taken houdt de boel op slechts 3.8 GHz waardoor het iets langer duurt om een taak af te ronden.

Hoe stel je dat in? In BOINC manager heb ik hem gewoon op 100% CPU staan.

Hij draait nu wel significant minder taken, 18 tegelijk of zo. Er staat een hele wachtrij, maar de status van die taken is "Ready to start".

[luigi87]

Ik doe ook mee, met een simpele thuis server met een vrij simpele CPU.
Ik draag ook graag mijn steentje bij, ook als is het een lego steentje tenopzichte van de bakstenen hier.

Alle beetjes helpen zeggen ze

[filthymushroom]

Compizfox schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 15:36:
[...]

Hoe stel je dat in? In BOINC manager heb ik hem gewoon op 100% CPU staan.

Hij draait nu wel significant minder taken, 18 tegelijk of zo. Er staat een hele wachtrij, maar de status van die taken is "Ready to start".

In de verwerkingsvoorkeuren kun je dat instellen, let even op wat hij doet bij activiteit. Anders kan het zijn dat hij minder gaat doen zodra je de muis aanraakt. Let ook even goed op de geheugen tab.

Overigens doet hij maar 1 taak per cpu thread, de rest staat in de wachtrij voor als er een klaar is.

[Compizfox]

filthymushroom schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 15:43:
[...]
In de verwerkingsvoorkeuren kun je dat instellen, let even op wat hij doet bij activiteit. Anders kan het zijn dat hij minder gaat doen zodra je de muis aanraakt. Let ook even goed op de geheugen tab.

Hij heeft geen muis

In de "computing preferences" heb ik ingesteld dat hij gewoon 100% CPU mag gebruiken, maar alleen als hij verder idle is: "suspend when non-BOINC CPU usage is above" staat op 12.5%.

Overigens doet hij maar 1 taak per cpu thread, de rest staat in de wachtrij voor als er een klaar is.

De CPU heeft dus 64 threads

[filthymushroom]

Compizfox schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 15:45:
[...]

Hij heeft geen muis

In de "computing preferences" heb ik ingesteld dat hij gewoon 100% CPU mag gebruiken, maar alleen als hij verder idle is: "suspend when non-BOINC CPU usage is above" staat op 12.5%.

[...]

De CPU heeft dus 64 threads

Dat is vreemd, als ie namelijk niet genoeg geheugen heeft dan zou hij een andere melding moeten geven...

Misschien heeft iemand anders nog een goed idee?

[Theadalus]

D_Jeff schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 15:19:
Tipje: Als je het aantal werktaken onder de 33 houdt, zal je CPU alle taken op 4 GHz draaien. 63 taken houdt de boel op slechts 3.8 GHz waardoor het iets langer duurt om een taak af te ronden.

Ja, dat is standaard-gedrag wanneer je de HT/SMT "cores" ook aan het werk zet, maar je cpu verwerkt dan wel meer taken tegelijk.
Wanneer je van non-SMT (n taken tegelijk) naar SMT (2x n taken tegelijk) gaat en de looptijd per taak verdubbelt niet, dan geeft SMT dus een performance-verbetering, je cpu verwerkt dan nl. per tijdseenheid (bv. een dag) meer taken.

[uray]

Kan iemand mij uitleggen hoe BOINC precies omgaat met Cores / Mem ?
Of hoe je de Performance van verschillende hardware kunt vergelijken ?

Ik vraag dit omdat ik nog wat oudere Hardware heb staan die niets staat te doen.
Maar het moet natuurlijk wel enig rendement opleveren per geinvesteerde Watt.

Heb er nu al wel een paar draaien, maar ze geven allemaal globaal dezelfde Tijdsduur aan per Opdracht.
En dat lijkt mij dan weer onwaarschijnlijk, aangezien de Hardware wel degelijk verschilt.

Thx alvast.

[BlueTooth76]

uray schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 17:22:
Kan iemand mij uitleggen hoe BOINC precies omgaat met Cores / Mem ?
Of hoe je de Performance van verschillende hardware kunt vergelijken ?

Ik vraag dit omdat ik nog wat oudere Hardware heb staan die niets staat te doen.
Maar het moet natuurlijk wel enig rendement opleveren per geinvesteerde Watt.

Heb er nu al wel een paar draaien, maar ze geven allemaal globaal dezelfde Tijdsduur aan per Opdracht.
En dat lijkt mij dan weer onwaarschijnlijk, aangezien de Hardware wel degelijk verschilt.

Thx alvast.

Heb hier iig een overzicht van CPU's onderling:

https://boinc.bakerlab.org/rosetta/cpu_list.php

[Verwijderd]

BlueTooth76 schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 17:23:
[...]
Heb hier iig een overzicht van CPU's onderling:

https://boinc.bakerlab.org/rosetta/cpu_list.php

Jammer dat ze je niet laten sorteren in die lijst.

[Cid Highwind]

De tabel laat zich redelijk makkelijk in een Excel spreadsheet kopiëren.

[Bubbles]

Hou er verder rekening mee dat je minstens 1 GB geheugen per core beschikbaar hebt. Rosetta wil nogal eens hongerig zijn.

[Damic]

Mmmh heb hier nog een X399 bordje liggen zou daar een cpu kunnen in proppen en GOAN GOAN xD maar moet het wel >=16c moeten zijn maar meer output dan een 1950x

Edit: sorry for my sins I just bought a 2990WX on amazon.de (staan er nog voor 600€ op)

[ Voor 39% gewijzigd door Damic op 25-03-2020 20:40 ]

[DaMoUsYs]

@Damic special gekocht om me te vouwen ?

[Compizfox]

filthymushroom schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 15:50:
[...]

Dat is vreemd, als ie namelijk niet genoeg geheugen heeft dan zou hij een andere melding moeten geven...

Misschien heeft iemand anders nog een goed idee?

Klopt, momenteel heb ik er iets van 30 tegelijk draaien en staan er een paar tasks op "Waiting for memory". Waarom dat net niet zo was, weet ik niet.

Dat betekent overigens wel dat ik gewoon bottlenecked ben door de hoeveelheid RAM (16 GB). Mijn eigen use-case (MD) heeft echte luttele MBs per task nodig, vandaar dat er niet meer inzit...

[filthymushroom]

Compizfox schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 21:53:
[...]

Klopt, momenteel heb ik er iets van 30 tegelijk draaien en staan er een paar tasks op "Waiting for memory". Waarom dat net niet zo was, weet ik niet.

Dat betekent overigens wel dat ik gewoon bottlenecked ben door de hoeveelheid RAM (16 GB). Mijn eigen use-case (MD) heeft echte luttele MBs per task nodig, vandaar dat er niet meer inzit...

Haha, ja met 16gb op 64 cores gaat het niet lukken, ik denk dat je hem het beste kan cappen op 20 cores o.i.d..

[Compizfox]

filthymushroom schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 22:02:
[...]


Haha, ja met 16gb op 64 cores gaat het niet lukken, ik denk dat je hem het beste kan cappen op 20 cores o.i.d..

Nou ja, 32 tasks was het doel. Hij heeft 32 cores met SMT, maar ik gok niet dat SMT gebruiken hier enig nut zal hebben.

[filthymushroom]

Compizfox schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 22:03:
[...]

Nou ja, 32 tasks was het doel. Hij heeft 32 cores met SMT, maar ik gok niet dat SMT gebruiken hier enig nut zal hebben.

Tenzij je meer geheugen bijprikt klopt die aanname behoorlijk zou ik zeggen

[Compizfox]

filthymushroom schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 22:22:
[...]
Tenzij je meer geheugen bijprikt klopt die aanname behoorlijk zou ik zeggen

Die aanname was zelfs los van de RAM-bottleneck die ik nu heb.

SMT gebruiken zorgt ervoor dat de CPU minder hard boost (zoals @D_Jeff al aangaf), en bij een workload die de pipelines volledig gevuld houdt is SMT sowieso van nauwelijks toegevoegde waarde.

Bij mijn eigen simulaties (MD) zie ik dat SMT gebruiken de effectieve performance verlaagt (m.a.w. een speedup van lager dan 1, het werkt averechts).

[filthymushroom]

Compizfox schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 23:06:
[...]

Die aanname was zelfs los van de RAM-bottleneck die ik nu heb.

SMT gebruiken zorgt ervoor dat de CPU minder hard boost (zoals @D_Jeff al aangaf), en bij een workload die de pipelines volledig gevuld houdt is SMT sowieso van nauwelijks toegevoegde waarde.

Bij mijn eigen simulaties (MD) zie ik dat SMT gebruiken de effectieve performance verlaagt (m.a.w. een speedup van lager dan 1, het werkt averechts).

Geld dat dat ook voor mijn 3700X? Zou ik misschien toch eens moeten testen dan...

[Compizfox]

filthymushroom schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 23:23:
[...]

Geld dat dat ook voor mijn 3700X? Zou ik misschien toch eens moeten testen dan...

Durf ik niet te zeggen, maar het is mogelijk. Meten is weten

[scworld]

Ik zie nergens hoe je het aantal slots kan aanpassen. Hier een eerste generatie Threadripper (16 core, 32 thread) met 48 GB RAM. Heeft iemand een screenshot ter verduidelijking? (+ F@H op de graphics card (nieuwe 5700 XT ).

Voorlopig loopt alles als een zonnetje dus ik weet niet of aanpassingen nodig zijn.

[Bubbles]

scworld schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 23:25:
Ik zie nergens hoe je het aantal slots kan aanpassen. Hier een eerste generatie Threadripper (16 core, 32 thread) met 48 GB RAM. Heeft iemand een screenshot ter verduidelijking? (+ F@H op de graphics card (nieuwe 5700 XT ).

Voorlopig loopt alles als een zonnetje dus ik weet niet of aanpassingen nodig zijn.

In advanced view: Options > Computing preferences ... > kopje "use at most x % of CPUs"
Vul bij x het gewenste % van je totale hoeveelheid logische/virtuele cores.

[yvesg]

Zijn er nog mensen die van mening zijn dat we de naam [Stampede 19] moeten omdopen tot 'Project Alen' ?

[ Voor 4% gewijzigd door yvesg op 25-03-2020 23:50 . Reden: typo ]

[UK223]

Zou een core2 quad Q9400 zin hebben om te laten draaien?
Ik heb zo en zo m'n R7 1700X laten draaien maar ik dacht alle beetjes helpen.

[geenwindows]

UK223 schreef op donderdag 26 maart 2020 @ 00:35:
Zou een core2 quad Q9400 zin hebben om te laten draaien?
Ik heb zo en zo m'n R7 1700X laten draaien maar ik dacht alle beetjes helpen.

alle beetjes helpen, al is het een Lego steentje tussen de bakstenen.

[lasermen]

yvesg schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 23:49:
Zijn er nog mensen die van mening zijn dat we de naam [Stampede 19] moeten omdopen tot 'Project Alen' ?

Liever niet als je het mij vraagt.

[warmbakkertje62]

ik krijg geen nieuw werk aangeleverd?
2 taken staan al dagen in overdracht. 81,87% van 3,21kb..
wat is er aan de hand of is er iets bij mij aan de hand?
Ik heb het eigenlijk altijd op de achtergrond draaien en let er verder nooit op, maar nu met Corona kijk ik af en toe en heb ook wel werk ingeleverd afgelopen week, is er geen werk? Meestal rekent ie een taak of 6 tegelijk uit. nu ff niks...

[Xfade]

warmbakkertje62 schreef op donderdag 26 maart 2020 @ 01:48:
ik krijg geen nieuw werk aangeleverd?
2 taken staan al dagen in overdracht. 81,87% van 3,21kb..
wat is er aan de hand of is er iets bij mij aan de hand?
Ik heb het eigenlijk altijd op de achtergrond draaien en let er verder nooit op, maar nu met Corona kijk ik af en toe en heb ook wel werk ingeleverd afgelopen week, is er geen werk? Meestal rekent ie een taak of 6 tegelijk uit. nu ff niks...

Hier geen probleem. Kreeg gelijk weer nieuw werk bij het starten van de client.
Kijk in de client bij Projecten tab of je niet toevallig "geen nieuw werk/nieuw werk toestaan" hebt ingedrukt. En wellicht kan je die 2 die vast zitten opnieuw starten of gewoon verwijderen.

[warmbakkertje62]

dank, project gereset, werk komt binnen. Jammer van die 2 taken die moesten worden gerapporteerd..
8 taken weer aan het rekenen :-)

[ Voor 14% gewijzigd door warmbakkertje62 op 26-03-2020 02:21 ]

[Damic]

DaMoUsYs schreef op woensdag 25 maart 2020 @ 21:12:
@Damic special gekocht om me te vouwen ?

ja en nee, wil wat gaan spelen met server 2019 enzo en vermits ik hier nog een x399 bord heb liggen en wat meer cores wil die iets beter presteren dan de 1950x

[jeroenathome]

@warmbakkertje62 : Je kan ook alleen de downloadtaak afbreken. De laatste tijd heb ik hier ook vaak last van. Nog niet kunnen ontdekken waar het probleem zit. Gek genoeg nog niet weer gehad nu de F@H client uitstaat. Ik heb ook nog last van een instabiel systeem. Zonder F@H lijkt beide problemen opgelost.

[Verwijderd]

Coming Soon ... on a system near you ...

[AceAceAce]

zo, ik doe ook weer mee, voor het eerst in 15 jaar ofzo.
bijna 7 uur per taak

[Xanquezer]

Wat een drukte dit jaar voor stampede!

[ApC_IcE]

ook aangemeld om per april te beginnen.
Dan is mijn Ryzen 9 3900X aan de beurt.

[ Voor 36% gewijzigd door ApC_IcE op 26-03-2020 09:50 ]

[BasTijs]

Ik ook weer na 8 jaar met mijn oude xeon X5675 omdat de PC toch aan staat voor thuiswerken. De GPU gaat naar Folding@home

[Breezers]

Hier sinds gisteren ook bezig om op de achtergrond de taken te draaien

[kr4t0s]

Doe ook maar weer mee sinds jaren! Gebruikt lekker veel ram +35gb nu van de 128gb.

[hrothberht]

warmbakkertje62 schreef op donderdag 26 maart 2020 @ 01:48:
ik krijg geen nieuw werk aangeleverd?
2 taken staan al dagen in overdracht. 81,87% van 3,21kb..
wat is er aan de hand of is er iets bij mij aan de hand?
Ik heb het eigenlijk altijd op de achtergrond draaien en let er verder nooit op, maar nu met Corona kijk ik af en toe en heb ook wel werk ingeleverd afgelopen week, is er geen werk? Meestal rekent ie een taak of 6 tegelijk uit. nu ff niks...

Het is ook belangrijk om de nieuwste versie van de software te gebruiken:

bron
[...] With that in mind, step 1 right now is to update the version of Rosetta on Rosetta @ Home to use the latest and greatest version. The structure prediction side of things is rather mature and doesn't need new features, whereas the interface design is brand new, unpublished, and rapidly being developed. We need new code that I and others have written in order to perform these calculations. [...]

Met interface bedoelen ze hier niet een GUI ofzo, maar de code die simuleert hoe proteïnen met elkaar interfacen.

[ Voor 4% gewijzigd door hrothberht op 26-03-2020 11:27 ]

[filthymushroom]

Wat chill om mensen terug te zien komen voor het eerst in jaren. Ik ben ook heel wat jaartjes niet aanwezig geweest, maar blijkbaar dus niet de enige. Echt top!

Liggen we al op schema om de grootste stampede ooit te worden? Dat lijkt mij toch wel een mooi streven

[PeGys]

Denk dat het feit dat er op corona gefocust wordt er best wat mee te maken heeft.

Maar, ik ben er met plezier bij

[kr4t0s]

Rosetta is nu alles Covid?
Zie dat Name: 9ko7bj4a_jhr_design1_COVID-19_SAVE_ALL_OUT_903185_1 is.


Zie bij folding@home: (voor GPU)
Project Description
Projects 11759-11764

Cause: covid

CORONAVIRUS PROJECT

Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease - potential drug target

Je kunt Corona niet kiezen in drop down menu maar lijkt erop dat die nu wel high prio is.

[Verwijderd]

filthymushroom schreef op donderdag 26 maart 2020 @ 12:21:
Liggen we al op schema om de grootste stampede ooit te worden? Dat lijkt mij toch wel een mooi streven

We gaan aardig de goede kant op. Nog wat meer nieuwe Tweakers erbij en we worden met onze dagelijkse bijdrage groter dan GridCoin, als we doorstomen ook groter dan UnRaid en hopelijk uiteindelijk /r/Covid19

Stats: https://roarnet.nl/iis/dp...aspx?project=Rosetta@Home

[saxx07]

Ik ben voor eerst begonnen met Rosetta. Nu was het even zoeken naar de juiste instelling maar die heb ik nu wel gevonden...denk ik.

Nu starten ik vanmorgen op en vroeg me af waarom hij niet ging loeien...(eerst een temp van rond de 60 graden). Nu bleek dat hij het energieschema van windows op energiebesparing stond..dus had temp van rond 40 graden...maar Rosetta draaide wel gewoon. Als ik nu een beetje speel met de energieschema's merk ik in Rosetta geen verschil in de tijden hoe lang het nog duurt.

Dus mijn vraag is..Welk invloed heeft het energieschema van windows?

[geenwindows]

Verwijderd schreef op donderdag 26 maart 2020 @ 12:30:
[...]


We gaan aardig de goede kant op. Nog wat meer nieuwe Tweakers erbij en we worden met onze dagelijkse bijdrage groter dan GridCoin, als we doorstomen ook groter dan UnRaid en hopelijk uiteindelijk /r/Covid19

Stats: https://roarnet.nl/iis/dp...aspx?project=Rosetta@Home

ik heb er een hard hoofd in, Team unRAID heeft een achterban die best wel wat stevig spul hebben, zou me ook niks verbazen als LTT een video maakt over Rosetta dat we dan helemaal kansloos zijn. (check de stats bij Fah maar eens)... valt me trouwens op dat de techtubers tot nu toe enkel 'reclame' maken voor FaH en niet Rosetta...

[ApC_IcE]

Is het de bedoeling om nu na het testen rosetta nog even op hold te zetten voor we allen tegelijk starten?

[PeGys]

geenwindows schreef op donderdag 26 maart 2020 @ 13:07:
[...]


ik heb er een hard hoofd in, Team unRAID heeft een achterban die best wel wat stevig spul hebben, zou me ook niks verbazen als LTT een video maakt over Rosetta dat we dan helemaal kansloos zijn. (check de stats bij Fah maar eens)... valt me trouwens op dat de techtubers tot nu toe enkel 'reclame' maken voor FaH en niet Rosetta...

Ach, probleem bij een LTT is dat als ze vandaag reclame maken voor F@H en morgen voor Rosetta dat velen zoiets hebben van "wat moet ik nu" waardoor er wel een deel afhaakt.