Lijkt me een prima tutorial. Zou goed moeten komen. Ik verwacht niet dat je een probleem met de bootloader hoeft te verwachten. Je hebt die Philz kernel immers ook probleemloos geflasht.
Backup terugzetten zoals je beschrijft gaat uiteraard niet werken. Is ook best logisch als je erover nadenkt: je maakt een backup van android 4.1, dan kan je die dus niet terugzetten op android 4.4. Dat zijn 2 verschillende systemen.
In principe blijft alle media op je sd-card onaangetast (tenzij je deze bewust geheel formateert). Bij de wipes van system (factory reset), cache en dalvik worden alleen de partities gedaan waar het besturingssysteem en je apps op staan. De 'System', 'Cache' en 'Data' partities.
Zodra je aan sdcard en/of external sdcard gaat zitten ben je echt alles kwijt. Media, zoals foto's, muziek, etc. blijft dus in principe onaangetast. Je bent dus wel al je apps kwijt, evenals sms-berichten en contacten.
Neem echter altijd het zekere voor het onzekere (zeker als het de eerste keer is dat je flasht).
Contacten kan je backuppen met je gmail-account, sms-jes met de app 'sms backup & restore'. Je apps worden gesynced met je gmail, dus die gaan (als het goed is) allemaal weer vanzelf downloaden via de playstore na de upgrade (nogmaals, je bent dan wel alle app-instellingen en voorkeuren kwijt).
Foto's, muziek en al het andere wat je perse niet kwijt wil op je computer (of met een cloud dienst) backuppen.
En als je dan kitkat 4.4 erop hebt staan kan je je telefoon weer helemaal opnieuw gaan instellen.

(Maar als je een beetje handig bent heb je dat in een kwartiertje gedaan hoor).
Hopelijk schrikt dit je niet af, want de upgrade naar 4.4 is echt de moeite waard!
Succes!
(P.s. draai zelf al jaren uitstluitend custom-roms en sinds een paar maanden met veel genoegen de CM11 build van Infected. Zie een van mn post hierboven voor de link naar het forum op xda.)