Stampede editie 5 - Rosetta@Home - het maken van teams

[Verwijderd]

Frentik schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 00:21:
[...]

Ik stem voor pyrus, er stond nog niet heel veel op jagernet dus wat mij betreft mag je ook een nieuw forum starten. Maar ik denk dat dutch maar even de beslissing moet nemen aangezien jagernet zijn forum is.....

de url is jagernet.com maar als iemand anders en forum heeft dan vind ik dat prima, want ik heb weinig tijd om me ermee te bemoeien deze stampede.

[Verwijderd]

Ook de stampertjes kunnen nog wel een paar leden gebruiken
Het oudste stampede team is nog lang niet vastgeroest en zal dus ook eens laten zien wat we kunnen

[My]

Mijn pc-tje heeft nog geen autoput ' veroorzaakt', dus ik kan me niet aanmelden op die aanmeldpagina, maar ik wil me toch graag aanmelden bij FDC.

Dus [DPC]Team Switch~My wil bij FDC.

[Dogooder]

ik ben zo vrij geweest om de tekst die AES gepost heeft uit te breiden. Ik probeer namelijk de mensen op verschillende kantoren te bereiken en mee te laten doen. (totall n00bs, maar met pentium IV). Ik post de tekst hier ter review, en ik weet niet hoe het zit op met copyright en plagiaat, ik hoop dat ik er gebruik van mag maken.

De vijfde Stampede van Dutch Power Cows komt in april op het project Rosetta.

Rosetta is een medisch onderzoeksproject van de Universiteit van Washington en het Howard Hughes Medical Insitute op het gebied van proteïnen (eiwitten die in aantallen gemeten de belangrijkste bouwstof van de mens vormen) en hoe de driedimensionale vormen daarvan zich ontwikkelen. Het doel is medicijnen te vinden tegen ziektes als kanker, Alzheimer, HIV en malaria.
Er is heel veel rekenkracht nodig en daartoe is er een gedistribueerd BOINC computerproject Rosetta@Home, waarbij de niet gebruikte capaciteit van honderdduizenden PC’s wereldwijd wordt ingezet. Hierbij draait als je PC aanstaat een programma op de achtergrond mee met een lage prioriteit, zodat je het niet merkt.

De Stampede is sinds augustus 2003 een terugkerend verschijnsel bij Dutch Power Cows (DPC). Eén of twee keer per jaar worden de krachten van deelnemers aan de elf projecten waaraan DPC meedoet, gebundeld op één project om de positie ten opzichte van de buitenlandse “concurrentie” te verstevigen. Want hoewel de eerste gedachte is om belangrijke en goede doelen te ondersteunen, is er via allerlei standenlijsten een ware competitie aan de gang. Nu is het door een echte verkiezing Rosetta@Home geworden.

Wereldwijd staat DPC nu nog op de tweede plaats, maar dreigt binnenkort te worden ingehaald door Xtreme Systems (XS).
XS heeft DPC eerder al eens op D2OL (onderzoek naar medicijnen tegen onder andere Ebola, SARS en pokken) verslagen. En als de Stampede een daverend succes wordt, dan kan zelfs de achterstand op de nummer één Free-DC grotendeels worden ingelopen.

Het helpen bij het vinden van medicijnen tegen ernstige menselijke ziektes, en meebouwen aan een geweldig succes van DPC is voor iedereen mogelijk. Het helpen bij het ontwikkelen van nieuwe medicijnen voor kanker, HIV, malaria, enz. D.m.v. het uitrekenen van de drie-dimensionale structuren van complexe biologische moleculen (eiwitten) klinkt ingewikkeld, en dat is het ook. Gelukkig hoef je hier als gebruiker niet over na te denken, en is meedoen zo simpel als een programma installeren.

Hoe doe ik mee?
Uitgebreide instructies over hoe je mee kunt doen kun je hier vinden. Daar staat alles netjes uitgelegd. In het kort komt het op het volgende neer:

1. Meld je aan bij Rosetta@home door op de link te klikken.
2. Download de zogenaamde 'Boinc' client; het programma dat de berekeningen gaat uitvoeren.
3. Installeer het Boinc-programma, en zorg voor de goede instellingen.
4. Meld je aan voor de stampede.

TE INGEWIKKELD?
Daarvoor is een automatische installatie ontwikkeld. Deze is meegestuurd, door deze te installeren en gewoon uit te voeren doet je pc automatisch mee op mijn account waardoor alle instellingen automatisch geregeld zijn. Je pc gaat zich in de tijd dat jij hem niet gebruikt inzetten voor de medische wetenschap.

Nu komt misschien de vraag of dit allemaal wel echt is en geen virus of spam. Het Rosetta project is al in verschillende media verschenen. Zoals de Daily Telegraph http://www.telegraph.co.u...d/2005/09/21/ecfori21.xml

Of de nieuwssite FOK.
http://frontpage.fok.nl/nieuws/63365

innovations report schreef:
Computers Make Big Strides in Predicting Protein Structure; the current state of computer-predicted protein-folding and a mention of the new Rosetta@home project.

Science Daily:
'Rosetta' Software To Unlock Secrets Of Many Human Proteins; an overview of the Rosetta software used by the Human Proteome Folding project.

Ook de vorige stampedes van DPC op andere projecten zijn in de media geweest. Bijvoorbeeld op de nieuwssite van Tweakers
nieuws: Stampede brengt DPC richting de top bij Find-a-Drug
nieuws: DPC: Tweakers vechten tegen kinderziekte

Meer informatie en natuurlijk de resultaten van de onderzoeken die geholpen worden de vele thuis/kantoor computers zijn te vinden op de officieele site van Rosetta. http://boinc.bakerlab.org/rosetta/

Maar hoe werkt dat programma nu precies?
De hedendaagse computers, thuis en op kantoor, zijn snel. Sneller dan men kan lezen en schrijven. Een computer met een 1 GHz processor doet ongeveer 1 miljard (1.000.000.000) bewerkingen per seconden. Veelal staat de computer niets te doen omdat de computer vele malen sneller is als de mens, bv bij het schrijven van een document, het lezen van een document. In zo’n geval is de gebruiker bezig, maar de computer staat te wachten tot de gebruiker klaar is met het lezen van de pagina of het bedenken van de volgende zin.
Wat doet dit programma nu? Het programma gebruikt alle tijd die niet door de gebruiker gebruikt wordt voor zoeken naar medicijnen. Dus als de gebruiker aan het lezen is, in vergadering zit of iets anders doet, gaat de pc wat nuttigs doen in de tijd die normaal ongebruikt zal zijn en bevorderd de onderzoeken naar complexe medicijnen.

Waarom mijn computer?
Gedistribueerde computerprojecten zijn gebaseerd op het principe van vele handen maken licht werk. Het onderzoeken van eiwitten voor medicijnen is een gigantische complexe taak. Zouden onderzoekers dat op hun eigen computer doen dan zou het misschien wel honderden jaren duren voordat er een resultaat bereikt wordt. Dit kan opgelost worden door hele grote supercomputers het werk laten doen, maar deze zijn zeer kostbaar en alleen weggelegd voor overheden en niet haalbaar voor unversiteiten of onderzoeks instituten. Bij gedistribueerde computerprojecten wordt de complexe taak verdeelt over duizende computers die allemaal een beetje doen. Het vele handen maken licht werk. Alle resultaten worden door de wetenschappers weer aan elkaar geknoopt en hebben zo hetzelfde resultaat als wanneer 1 enkele pc honderden jaren zou rekenen. Dus hoe meer mensen er mee doen, hoe meer rekenkracht de wetenschappers tot hun beschikking hebben, en hoe sneller er resultaten worden geboekt.

[Frentik]

Ik zou punt 4 (meld je aan voor de stampede) veranderen in: meld je aan bij DPC....

[AES]

Om te proberen dit draadje leesbaar te houden stond de link naar FDC er bij

Nu het toch hier staat, graag commentaar op FDC

Het is nooit te laat

[Dogooder]

AES schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 13:37:
Om te proberen dit draadje leesbaar te houden stond de link naar FDC er bij


[...]

oops, iets te enthousiast in dit draadje geweest

[AES]

@Dogooder. Niets mis met enthousiasme
We willen toch allen dat de Stampede een succes wordt. En vele graantjes maken een brood, dus spam je rot in jouw omgeving. Het stukje van Megaflix en mij is bedoeld voor "buitenstaanders" en is juist kort gehouden met slechts twee links. Anders krijg je het nergens geplaatst

[Verwijderd]

My schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 13:30:
Mijn pc-tje heeft nog geen autoput ' veroorzaakt', dus ik kan me niet aanmelden op die aanmeldpagina, maar ik wil me toch graag aanmelden bij FDC.

Dus [DPC]Team Switch~My wil bij FDC.

Even hier ingeven>>>>>>>> http://tadah.mine.nu/stampede/signup.php

dan hier >>>>>>>>> http://furiousdc.7.forumer.com
thx

[iisschots]

Er is al een post gemaakt op WDO. Deze staat er al sinds 27 maart.

http://www.dutchpowercows.org/doc.php?id=484

[Verwijderd]

Verwijderd schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 14:03:
[...]


Even hier ingeven>>>>>>>> http://tadah.mine.nu/stampede/signup.php

dan hier >>>>>>>>> http://furiousdc.7.forumer.com
thx

Je leest niet goed (as usual )

Hij heeft nog geen output dus hij kan zich daar nog niet opgeven

[AES]

Tussenstand met de virtuele stats van 14:00 uur

Team	Leden	Virtuele daily
The Fok! Flock	55	3
Furious Dutch Cows	35	1
eXtreme Stampers	32	6
Lucky Angel: Stampede Chicken	31	4
Joint Forces	27	5
Stampertjes	24	2
Bearhunters	21	7

[Pyrus]

Verwijderd schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 10:31:
[...]


de url is jagernet.com maar als iemand anders en forum heeft dan vind ik dat prima, want ik heb weinig tijd om me ermee te bemoeien deze stampede.

Ok, in dat geval
* Pyrus klust wat links
* Pyrus klust wat rechts
* Pyrus gooit wat bits om

Forum! \o/
berenmansjes, tot snel op deze webstek

[Verwijderd]

AES schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 14:30:

Tussenstand met de virtuele stats van 14:00 uur

Team	Leden	Virtuele daily
The Fok! Flock	55	3
Furious Dutch Cows	35	1
eXtreme Stampers	32	6
Lucky Angel: Stampede Chicken	31	4
Joint Forces	27	5
Stampertjes	24	2
Bearhunters	21	7

Een na kleinste team en toch nog tweede

[Mobster]

Pyrus schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 15:00:
[...]


Ok, in dat geval
* Pyrus klust wat links
* Pyrus klust wat rechts
* Pyrus gooit wat bits om

Forum! \o/
berenmansjes, tot snel op deze webstek

Oe. Ik ben er al. Doe mij in die speciale groep.

Ik zal even op het oude forum vermelden dat we verhuisd zijn

[Verwijderd]

Verwijderd schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 14:24:
[...]


Je leest niet goed (as usual )

Hij heeft nog geen output dus hij kan zich daar nog niet opgeven

Ja.......koekje bij de koffie voor mij?

[uwmoeder]

eXtreme Stampers doet het wat zwak vandaag, alhoewel we wel de overall 1 hebben

[ Voor 13% gewijzigd door uwmoeder op 30-03-2006 17:44 ]

[iH8]

Verwijderd schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 15:01:
[...]

Een na kleinste team en toch nog tweede

* iH8 ziet geen 2de plaats

[archetta]

eXtreme Stampers laten iedereen gewoon nog even in de waan dat ze kunnen winnen

[AES]

Iedereen heeft de Stampede-FAQ gelezen, dus hier staat niets nieuws. Maar net zoals je best vaker kunt lachen om dezelfde mop, kan het ook geen kwaad om nog een keer te lezen dat het niet is toegestaan om gespaarde buffers tijdens de Stampede te flushen. Ook het geliefde spelletje van sparen voor mini- of Megaflushes hoort niet bij een Stampede.
Over het inschrijfformulier is vorige week veel angst voor "geintjes" uitgesproken. Dat is gelukkig allemaal goed gegaan. Dus mochten er nog wat volle Rosetta-uiers zijn: melken die koeien, en dan is ook dat weer geregeld.

[iH8]

ok. dit post ik even voor [DPC]FOKschaap~Fjolle. ze heeft zich eerst aangemeld als zijnde fokflock maar is geswitched naar stampertjes. nu staat ze al twee dagen op de aanmeldpagina onder stampertjes onderverdeeld maar in de stats staat ze nogsteeds bij de fokflock.

iemand die daar even naar kan kijken aub? dank!

sorcery.net #stampertjes kun je haar bereiken mochten er vragen zijn.

[Frentik]

Pyrus schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 15:00:
[...]


Ok, in dat geval
* Pyrus klust wat links
* Pyrus klust wat rechts
* Pyrus gooit wat bits om

Forum! \o/
berenmansjes, tot snel op deze webstek

registered & bookmarked

[Verwijderd]

Nog iets over het inschrijfformulier...

Een van de Fokschapen had zich aangemeld bij Rosetta zonder [dpc]FOKschaap voor zijn naam.
Dat heeft hij nu dus veranderd, maar nu staat hij dus 2 keer onder The Fok! Flock.

Een keer als ATOG2074 en één keer met de fokschaap naam ervoor...
Voor de punten maakt dat niet uit volgens mij, maar het staat wat raar ...

Kan em ook niet op 'no team' zetten omdat de naam ATOG 2074 niet meer voorkomt in het rijtje...

[MarcyDarcy]

De Bearhunters hebben er een nieuw stampedelid bij. Ik heb vernomen dat ze wel wat hulp kunnen gebruiken, ook al is het maar 1 pctje

[Blue_man]

Ik las met plezier de thread @ XS, we mogen natuurlijk niet overmoedig worden (ja hier spreekt mr. Zwartkijker) maar laat gewoon die spierballen rollen!

De olympische spelen draaien toch ook niet rond wie het meest over zijn prestatie praat?

Wie weet moeten we uit puur medelijden nog XS joinen omdat ze zo schaamteloos voorbijgestoken worden

[AES]

Tussenstand om 21:00 uur

Team	Leden	Virtuele daily
The Fok! Flock	55	1
Furious Dutch Cows	35	3
eXtreme Stampers	32	4
Lucky Angel: Stampede Chicken	30	5
Joint Forces	27	6
Stampertjes	24	2
Bearhunters	23	7

[Verwijderd]

Blue_man schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 20:14:
Ik las met plezier de thread @ XS, we mogen natuurlijk niet overmoedig worden (ja hier spreekt mr. Zwartkijker) maar laat gewoon die spierballen rollen!

De olympische spelen draaien toch ook niet rond wie het meest over zijn prestatie praat?

Wie weet moeten we uit puur medelijden nog XS joinen omdat ze zo schaamteloos voorbijgestoken worden

Het probleem is dat wij jullie moeten voorbijsteken

[Gyske]

Gyske wil graag grazen bij Furious Dutch Cows

[AES]

Je hebt nog maar 110 minuten om je aan te sluiten bij een Stampede team,

anders moet je wachten tot na 7 april en kun je misschien niet bij het leukste team

more Chicken Powah

[m_p_g]

Aangezien FDC mi al meer dan genoeg leden heeft (natuurlijk zegt dat niet alles), zal ik het kleinste team op dit moment komen versterken : the Bearhunters.

[Elteor]

Stampede episode 5 - The Cows Have Gone Mad(Again)!
	De inschrijving voor de stampede teams is momenteel gesloten.

Gaarne hier verder met enige dienstmededelingen het vervolg van de Stampede....

[Omied]

Verwijderd schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 19:32:
Nog iets over het inschrijfformulier...

Een van de Fokschapen had zich aangemeld bij Rosetta zonder [dpc]FOKschaap voor zijn naam.
Dat heeft hij nu dus veranderd, maar nu staat hij dus 2 keer onder The Fok! Flock.

Een keer als ATOG2074 en één keer met de fokschaap naam ervoor...
Voor de punten maakt dat niet uit volgens mij, maar het staat wat raar ...

Kan em ook niet op 'no team' zetten omdat de naam ATOG 2074 niet meer voorkomt in het rijtje...

Ja, dit had ik zelf ook... (Inmiddels niet meer)
Ik kon mijn oude naam ook niet verwijderen, doordat de statsbakker zelf mij al had toegevoegd aan het lijstje voordat ik een WU had geflusht... Toen ik later onder mijn subteamnaam een WU flushte en mezelf toevoegde aan het lijstje bleef m'n oude naam ook staan (inmiddels trouwens wel weg).
Maar op zich is dat geen probleem lijkt mij, want de oude naam heeft toch geen output...

[Verwijderd]

Thnx voor die mooie noobtext Die gaat vanavond de hele kennisenkring rond en op al mn websites Let the stamping begin muahahaha

[TheZoo]

AES schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 19:02:
Ook het geliefde spelletje van sparen voor mini- of Megaflushes hoort niet bij een Stampede.

Ben ik volledig bekend mee, ik heb alleen een klein probleem: niet alle koeien flushen netjes ondanks dat ze op 'netwerkverbinding altijd beschikbaar' staan Nou zou dat niet zo erg zijn, ware het niet dat ik in het weekend niet altijd in de gelegenheid ben alle koeien te melken.
Iemand wat config tips?

[Verwijderd]

Gyske schreef op donderdag 30 maart 2006 @ 21:28:
Gyske wil graag grazen bij Furious Dutch Cows

-
-Heb je je nog ingeschreven bij de teams?
-Heb je onze website al gezien? http://furiousdc.7.forumer.com

Welkom!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!

[iisschots]

Elteor schreef op vrijdag 31 maart 2006 @ 00:08:

[afbeelding]
Stampede episode 5 - The Cows Have Gone Mad(Again)!
[afbeelding]	De inschrijving voor de stampede teams is momenteel gesloten.

Gaarne hier verder met enige dienstmededelingen het vervolg van de Stampede....

Graag niet meer in dit topic posten voor de duidelijkheid. Anders loop alles door elkaar.

[smoking2000]

Slotje nodig iisschots?

[iisschots]

smoking2000 schreef op vrijdag 31 maart 2006 @ 13:47:
Slotje nodig iisschots?

Ja, deze is aangevraagd

[Gyske]

Verwijderd schreef op vrijdag 31 maart 2006 @ 13:12:
[...]

-
-Heb je je nog ingeschreven bij de teams?
-Heb je onze website al gezien? http://furiousdc.7.forumer.com

Welkom!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!

Ben beetje knuppel geweest... Heb niet helemaal doorgelezen en dus niet via website aangemeld. Ik kom er dus denk ik 7 april pas bij

[Schapie]

iisschots schreef op vrijdag 31 maart 2006 @ 14:10:
[...]


Ja, deze is aangevraagd

Meest worden nuttige topics niet gesloten.
Maar ik weet niet of de got policy daar voor dpc van afwijkt ?
Want het topic van stampede #4 is ook nog gewoon open.

[F_J_K]

Nieuwe topic loopt.

---> [rml][ Stampede 5]Klaar voor de start ....[/rml] <---