[FaD] hitparade van 5 augustus

[Pim.]

Hadden we twee dagen geleden nog 9 flushers, en gisteren nog 8 ....... je raad het al... vandaag nog maar 7 . Dat gaat op zich de verkeerde kant op. Wel gaat het aantal reacties in de draad evenredig tegengesteld mee.... dus dit wordt een drukke draad vandaag

Leuk om te zien is dat bijna 50% van alle flushers een mijlpal heeft ... gefeliciteerd

FaD user daily stats (5 August 2004) Flushing users: 7 / 44 = 16%
	pos	daily	user	total	overall
1.	()	26203	ColdRain	164463	(17)
2.	()	12778	PurpleBear	508373	(12)
3.	(4)	11871	DPC Team Switch	5507826	(1)
4.	(1)	4969	[DPC] BwO	24504	(31)
5.	(1)	4892	smitjes	2555669	(4)
6.	(2)	3208	[DPC] Team RC	91427	(22)
7.	(11)	1626	CubicQ	1958	(39)
	total:	65547	(m)
FaD user overall stats (5 August 2004)
	pos	total	user	daily	daily
1.	()	5507826	DPC Team Switch	11871	(3)
2.	()	4917313	Team Elteor Borislav	0	(-)
3.	()	4720803	Eddie	0	(-)
4.	()	2555669	smitjes	4892	(5)
5.	()	1490830	Stamgastje	0	(-)
6.	()	1231204	borislavj	0	(-)
7.	()	852748	Parivo	0	(-)
8.	()	780202	Akkermans	0	(-)
9.	()	710201	DukeBox	0	(-)
10.	()	627898	Zilverdael	0	(-)
more
	total:	26623800	(m)
FaD team daily stats (5 August 2004) Flushing teams: 70 / 125 = 56%
	pos	daily	team	total	overall
17.	(6)	87885	[H]ardOCP	66490884	(8)
18.	(3)	86883	Overclockers Australia	24984907	(16)
19.	(21)	83644	OverClockers.at	10143795	(32)
20.	(2)	76930	Nordlichter	17168524	(22)
21.	(9)	71999	Belarus	11063287	(30)
22.	(10)	65547	Dutch Power Cows	21902997	(19)
23.	(4)	63081	Hellenic Force	9712398	(33)
24.	(14)	55320	The Knights Who Say Ni!	4042535	(44)
25.	(4)	36226	Top Cats	24501375	(17)
26.	(24)	36191	Albert Schweitzer	12703099	(27)
more
	total:	7048185	(k)
FaD team overall stats (5 August 2004)
	pos	total	team	daily	daily
14.	()	28038887	Team Japan HIV	105295	(11)
15.	()	25216782	hardCOREware	190939	(8)
16.	()	24984907	Overclockers Australia	86883	(18)
17.	()	24501375	Top Cats	36226	(25)
18.	()	24024338	FreeDC	31888	(30)
19.	()	21902997	Dutch Power Cows	65547	(22)
20.	()	19526781	Rival DC Team	22029	(37)
21.	()	18401513	Christians	32316	(29)
22.	()	17168524	Nordlichter	76930	(20)
23.	()	16973019	2CPU	102087	(12)
more
	total:	1961341930	(k)

FaD team When do you get them stats (5 August 2004) Based on weekly average of 66.819 points per day
	team	day(s)	average output
	TechIMO	13,49	-2.166.926 points
	Top Cats	90,34	38.057 points
	FreeDC	661,68	63.613 points
FaD team When do they get you stats (5 August 2004) Based on weekly average of 66.819 points per day
	team	day(s)	average output
	Team Wanderlust	35,03	373.751 points
	mauisun.org	200,04	103.993 points
	2CPU	215,69	89.676 points
	Hellenic Force	288,62	109.056 points
	Belarus	35.423,89	67.125 points

FaD user Milestones and targets (5 August 2004) Ordered by size
	user	milestone	next target
	PurpleBear	500.000 points	600.000 points
	[DPC] Team RC	90.000 points	100.000 points
	[DPC] BwO	20.000 points	30.000 points

FaD Links
	- FaD Homepage
	- QiK FaD stats
	- FaD Stats FAQ
	- Official FAQ
	- Official Stats
	- Official forum
	- FaD news
	- FaD DPC Manual

GoT FaDstats engine 3.2 by Dukebox. Subteam stats hosted by QiK.nl

[Anoniem: 63996]

och druk of niet. onze fad-aap heeft iig weer wat power bij geschakeld

[Mobster]

Even voor de duidelijkheid hoor. Maar de huidige nummers 4 en 6 van DPC maken toch ook deel uit van TEB?

[SandStar]

Que passa?

code:

05-AUG-04 19:38 Created queue
05-AUG-04 19:38 Server v1.23c started as SERVER for member
05-AUG-04 19:39 Client 000 : r-win
05-AUG-04 19:39 No job allocated to : r-win
05-AUG-04 19:39 Connected to www.find-a-drug.net
05-AUG-04 19:39 Connected to www.findadrug.org
05-AUG-04 19:40 [SERVER] (10024)  Server already running.  Kill other copy first
06-AUG-04 01:33 Server v1.23c started as SERVER for member
06-AUG-04 01:33 Client 000 : r-win
06-AUG-04 01:33 No job allocated to : r-win
06-AUG-04 01:33 Connected to www.findadrug.org
06-AUG-04 01:33 Connected to www.treweren.com
06-AUG-04 09:07 Server v1.23c started as SERVER for member 
06-AUG-04 09:07 Client 000 : r-win
06-AUG-04 09:07 No job allocated to : r-win
06-AUG-04 09:07 [SADJOB] (10081) No jobs added (recent.lis does not exist)
06-AUG-04 09:08 No job allocated to : r-win
06-AUG-04 09:08 Connected to www.findadrug.org.uk
06-AUG-04 09:08 Connected to www.find-a-drug.net
06-AUG-04 09:10 [SERVER] (10024)  Server already running.  Kill other copy first
06-AUG-04 09:10 Failed on v124f.upd  with      404
06-AUG-04 09:10 Connected to www.findadrug.org.uk

[ColdRain]

SandStar schreef op 06 augustus 2004 @ 09:13:
Que passa?

Linux ?
Doe eens:
# killall server think
daarna check of alle instances van server en think effectief weg zijn.
Indien zo, dan:
# ./server -receive
Nu wat geduld, eventueel:
# tail -f server.log
Wat doet ie nu?

edit: Ik zie net dat je geen membernummer hebt:
05-AUG-04 19:38 Server v1.23c started as SERVER for member
Normaal staan daar het nummer van je client achter.

Heb je je wel geregistreerd?
# ./fadsetup -nickname SandStar -email [e-mail] -country Quatar -team 2047

[ Voor 30% gewijzigd door ColdRain op 06-08-2004 09:28 ]

[SandStar]

ColdRain schreef op 06 augustus 2004 @ 09:21:
[...]

Linux ?
Doe eens:
# killall server think
daarna check of alle instances van server en think effectief weg zijn.
Indien zo, dan:
# ./server -receive
Nu wat geduld, eventueel:
# tail -f server.log
Wat doet ie nu?

edit: Ik zie net dat je geen membernummer hebt:
05-AUG-04 19:38 Server v1.23c started as SERVER for member
Normaal staan daar het nummer van je client achter.

Heb je je wel geregistreerd?
# ./fadsetup -nickname SandStar -email [e-mail] -country Quatar -team 2047

Hmm ik heb niks gedaan en het beestje al sinds gisteravond laten runnen en 15min geleden heeft hij opeens het licht gezien en een update van "server" gedownload en daarna een job. Hij's nu keurig aan het crunchen.

Membernummer had ik weggehaald, 0,0 ervaring met deze client dus kwist niet of daar misbruik van kon worden gebruikt. Had al wel geregistreerd en kreeg daarna keurig mailtje binnen dat mn nick al eens was gebruikt met een ander e-mail adres. Geen idee wat er nu gaat gebeuren maar we zien het wel

[SandStar]

En nu doet ie weer niks

code:

 6-AUG-04 01:24 Waiting 60s for next job  
 6-AUG-04 01:25 Waiting 60s for next job  
 6-AUG-04 01:26 Waiting 60s for next job  
 6-AUG-04 01:27 Waiting 60s for next job  
 6-AUG-04 01:28 Waiting 60s for next job  
 6-AUG-04 01:29 Waiting 60s for next job  
 6-AUG-04 01:30 Waiting 60s for next job  
 6-AUG-04 01:33 Starting THINK v1.23c on r-win
CALL screen.srt
 6-AUG-04 01:33 Waiting 1s for next job  
 6-AUG-04 01:33 Waiting 2s for next job  
 6-AUG-04 01:33 Waiting 4s for next job  
 6-AUG-04 01:33 Waiting 8s for next job  
 6-AUG-04 09:07 Starting THINK v1.23c on r-win
CALL screen.srt
 6-AUG-04 09:07 Waiting 1s for next job  
 6-AUG-04 09:07 Waiting 2s for next job  
 6-AUG-04 09:07 Waiting 4s for next job  
 6-AUG-04 09:07 Waiting 8s for next job  
 6-AUG-04 09:08 Waiting 16s for next job  
 6-AUG-04 09:08 Waiting 60s for next job  
 6-AUG-04 09:09 Waiting 60s for next job  
 6-AUG-04 09:10 Waiting 60s for next job  
 6-AUG-04 09:11 THINK stopped for new version
 6-AUG-04 09:16 Starting THINK v1.24f on r-win
CALL screen.srt
 6-AUG-04 09:16 Starting : j1-1hyv-q3.log                  
 6-AUG-04 09:17 Found 1: m1794#3-77(2) 
 6-AUG-04 09:17 Found 2: m1794#3-75(1) 
 6-AUG-04 09:17 Found 3: m1794#3-57(2) 
 6-AUG-04 09:17 Found 4: m1794#3-50(1) 
 6-AUG-04 09:20 Found 5: m1794#3-43(2) 
 6-AUG-04 09:20 Found 6: m1794#3-31(1) 
 6-AUG-04 09:21 Found 7: m1794#3-27(2) 
 6-AUG-04 09:21 Found 8: m1794#3-25(2) 
 6-AUG-04 09:22 (208) 3D build failed for molecule m1794#4
(208) 3D build failed for molecule m1794#4
 6-AUG-04 09:29 Starting THINK v1.24f on r-win
CALL screen.srt
 6-AUG-04 09:29 Continuing : j1-1hyv-q3.log                  
 6-AUG-04 09:32 Starting THINK v1.24f on r-win
CALL screen.srt
 6-AUG-04 09:32 Continuing : j1-1hyv-q3.log                  
 6-AUG-04 09:32 (208) 3D build failed for molecule m1794#4
(208) 3D build failed for molecule m1794#4

[ColdRain]

SandStar schreef op 06 augustus 2004 @ 09:35:
Hmm ik heb niks gedaan en het beestje al sinds gisteravond laten runnen en 15min geleden heeft hij opeens het licht gezien en een update van "server" gedownload en daarna een job. Hij's nu keurig aan het crunchen.

Mooi zo
De FaD linux client is nog altijd in beta-fase. Dat betekent ondermeer dat je automatisch en willens-nillens meedoet aan het beta project. Gevolg daarvan is dat de server zich automagisch upgrade naar de laatste beta-versie, zijnde 1.24f.
Voor linux is er vziw nog geen tool zoals FadSpy. Je kan wel:
# ./server -list
doen. Of een
# tail -f r-win.tlg

Membernummer had ik weggehaald, 0,0 ervaring met deze client dus kwist niet of daar misbruik van kon worden gebruikt. Had al wel geregistreerd en kreeg daarna keurig mailtje binnen dat mn nick al eens was gebruikt met een ander e-mail adres. Geen idee wat er nu gaat gebeuren maar we zien het wel

Je krijgt bij FaD vermoedelijk een nickname als SandStar;1 of ;2 of ...

[ Voor 3% gewijzigd door ColdRain op 06-08-2004 09:49 ]

[ColdRain]

SandStar schreef op 06 augustus 2004 @ 09:40:
En nu doet ie weer niks

code:

6-AUG-04 09:29 Continuing : j1-1hyv-q3.log                  
 6-AUG-04 09:32 Starting THINK v1.24f on r-win
CALL screen.srt
 6-AUG-04 09:32 Continuing : j1-1hyv-q3.log                  
 6-AUG-04 09:32 (208) 3D build failed for molecule m1794#4
(208) 3D build failed for molecule m1794#4

Toch wel, die messages zijn volkomen normaal
Doe maar eens een top ...

Uitleg over wat er in die r-win.tlg staat: hier en hier

Pim. schreef op 06 augustus 2004 @ 06:17:
.... dus dit wordt een drukke draad vandaag

'k doe m'n best ...

[ Voor 32% gewijzigd door ColdRain op 06-08-2004 09:59 ]

[SandStar]

die berichten mogen dan normaal zijn, mn cpu gebruik liegt er niet om...
Client doet echt niks meer

Client maar weer opgestart... poging 3

[ Voor 18% gewijzigd door SandStar op 06-08-2004 10:19 ]

[ColdRain]

Post eens de output van server -list

[Anoniem: 87816]

Mobster schreef op 06 augustus 2004 @ 09:06:
Even voor de duidelijkheid hoor. Maar de huidige nummers 4 en 6 van DPC maken toch ook deel uit van TEB?

Smitjes niet hoor... ben geen aap! Borislavj wel en die zal binnenkort wel in TEB zitten
Hmmm maar nummer 3, Eddie ligt wel opeens uit het TEB team.... wat is er aan hand?!?

[ Voor 13% gewijzigd door Anoniem: 87816 op 06-08-2004 10:27 ]

[Mobster]

Excuses. Ik bedoelde 3 en 6

[BwO]

Ik denk dat Eddie uit TEB is gevallen nadat ie nieuwe nodes heeft toegevoegd. Dat de stats daar niet op bberekend zijn. Anyways ik heb weer een paal Morgen weer?

[Anoniem: 116250]

BwO schreef op 06 augustus 2004 @ 10:54:
Ik denk dat Eddie uit TEB is gevallen nadat ie nieuwe nodes heeft toegevoegd. Dat de stats daar niet op bberekend zijn. Anyways ik heb weer een paal Morgen weer?

Dan kan DUke dit toch wel oplossen???

[BwO]

Ik denk het wel ik gaf maar een suggestie wat het kon zijn, maar ik heb al lange tijd niets van duke gehoord, volgens mij is hij op vakantie

[Anoniem: 37750]

ik heb eergisteren nog een mailtje van hem gehad hoor. Hij was wel druk zei hij. Maar volgens mij niet op vakantie.

[Anoniem: 88813]

SandStar schreef op 06 augustus 2004 @ 09:40:
En nu doet ie weer niks

code:

(208) 3D build failed for molecule m1794#4

Die "3D build failed" heb ik ook regelmatig, maar bij mij (w2k) loopt 'ie gewonn door.

[ColdRain]

Enkele veelvoorkomende messages in hostname.tlg
(de voorbeelden hieronder komen uit mijn .tlg's)

6-AUG-04 22:07 Found 269: m15703#75-97(5)
Before the "#" is the molecule file and after the # (until the "-") is the molecule number in that file. After the "-" is the derivative number and finally in parenthesis is the number of conformations for that molecule which were sucessfully docked and scored less than -20 (reasonably well).

5-AUG-04 13:44 (208) 3D build failed for molecule m17226#82
It means we included molecules in the collect (sic) for which THINK cannot generate 3D coordinates. We understand the algorithmic limitation but as yet we have not revised it.

6-AUG-04 21:51 (323) Conformational generation time 24.109 exceeds limit
en
6-AUG-04 21:27 (236) Fit fails - max no of cycles exceeded for m17226#99-22(6)
There is a time limit per molecule of 60 minutes but no time limit on the job as a whole. Most molecules are completed well inside this limit (say 10,000 molecules in 10 hours = 3.6 seconds each on average). Occasionally a very flexible molecule is encountered which takes much longer than other molecules.
The timeout varies with the CPU rating so that we hope to do the same amount of processing before abandoning a molecule. On the "standard PC" with a rating 100 the timeout is 1 hour. This increases for slower PCs and decreases for faster PCs....

What is the difference between "fit fails" (236), and generation time exceeded (323)?
It is possible that a time out (323) occurs during the fitting but the fitting of a conformation in to the binding site only occurs some of the time. Most timeouts occur outside the fitting algorithm. If the fit fails to converge in less than the maximum number of cycles then error (236) is reported. Strictly speaking 236 is an algorithmic failure while 323 is merely impatience and a matter of using computer time effectively. It may help some members to understand that the fitting algorithm includes a numerical method for a matrix inversion which implicitly can be unstable eg if the matrix is nearly singular etc.

bronnen:
- FaD forum hier
- hoe werkt FaD, wat zit er (technisch) achter

[ Voor 3% gewijzigd door ColdRain op 06-08-2004 22:26 ]

[Anoniem: 88813]

thx ColdRain;
dit moet maar ook in de faq ... smitjes

[ Voor 45% gewijzigd door Anoniem: 88813 op 07-08-2004 07:35 ]

[Anoniem: 87816]

Anoniem: 88813 schreef op 07 augustus 2004 @ 07:34:
thx ColdRain;
dit moet maar ook in de faq ... smitjes

Ja maar ben ik nou de PV of niet? Ik hoor er niks meer over

[Mark83]

Niemand anders wilt ... maar officieel ben je het denk ik nog niet ... trap dat ene pv draadje even omhoog ofzo ... en als niemand anders binnen 24 uur wilt ben jij het ... ofzo

[ColdRain]

Anoniem: 87816 schreef op 07 augustus 2004 @ 09:15:
Ja maar ben ik nou de PV of niet? Ik hoor er niks meer over

check
Stuur MarkB ff 'n mailtje misschien?
Je zal immers hier en daar bepaalde rechten (html?) moeten krijgen.

[ Voor 12% gewijzigd door ColdRain op 07-08-2004 09:53 ]

[Wessie]

ColdRain schreef op 07 augustus 2004 @ 09:52:
[...]

check
Stuur MarkB ff 'n mailtje misschien?
Je zal immers hier en daar bepaalde rechten (html?) moeten krijgen.

Gaat MarkB er ineens over dan

[DukeBox]

als pv-er krijg je niet meer rechten.. alleen een regeltje achter je naam wat toch niemand opvalt.

[Pim.]

Anoniem: 87816 schreef op 07 augustus 2004 @ 09:15:
[...]


Ja maar ben ik nou de PV of niet? Ik hoor er niks meer over

Sorry voor het gebrek aan communicatie, we waren van plan je een mail te sturen zodra de poll voor de andere PV'ers klaar was. Dan kunnen we alles in één keer afronden .

Nogmaals excusses (gemeend)

Wessie schreef op 07 augustus 2004 @ 11:10:
[...]


Gaat MarkB er ineens over dan

HAHAHAHAHA nee, tuurlijk niet

[Anoniem: 87816]

Ik hoef geen extra rechten of zo... maar ik wil wel graag dat er een officiele FaD FAQ komt. Iedere keer dat er nieuwe DPCers met FaD starten zijn er wel vragen. Dus het zou mooi zijn als die info allemaal op een plaats beschreven wordt. Ik heb nog geen idee hoe en of ik die FAQ wel moet maken dus wacht ik nog maar even af

[Anoniem: 87816]

Pim. schreef op 07 augustus 2004 @ 11:37:
[...]


Sorry voor het gebrek aan communicatie, we waren van plan je een mail te sturen zodra de poll voor de andere PV'ers klaar was. Dan kunnen we alles in één keer afronden .

Ok dan wacht ik even af

[Wessie]

Pim. schreef op 07 augustus 2004 @ 11:37:

HAHAHAHAHA nee, tuurlijk niet

Ik snapte er ookal niets van.

[ColdRain]

't Was zeker niet mijn bedoeling verwarring te zaaien.

[Wessie]

ColdRain schreef op 07 augustus 2004 @ 12:52:
't Was zeker niet mijn bedoeling verwarring te zaaien.

Is je wel goed gelukt nu

[ColdRain]

Wessie schreef op 07 augustus 2004 @ 14:17:
Is je wel goed gelukt nu

Tja als men de link niet leest waarnaar ik verwees:

MarkB schreef op 31 juli 2004 @ 13:56:
En deze vacatureronde is nu ook gesloten. Feitelijk gezien geen reactie gekregen via de mail maar zie bovenstaande reactie van Pim. We bespreken het verder binnen de crew wat we met Smitjes aan moeten

[SandStar]

Anoniem: 87816 schreef op 07 augustus 2004 @ 11:39:
Ik hoef geen extra rechten of zo... maar ik wil wel graag dat er een officiele FaD FAQ komt. Iedere keer dat er nieuwe DPCers met FaD starten zijn er wel vragen. Dus het zou mooi zijn als die info allemaal op een plaats beschreven wordt. Ik heb nog geen idee hoe en of ik die FAQ wel moet maken dus wacht ik nog maar even af

Momenteel zit ik beetje te kloten hoe we het faq verhaal beetje structureel kunnen aanpakken, eind van de maand prognose. I'll be in touch