[Folding@Home user stats] hitparade van 11 april

[JohnR]

Een score van net aan 10K is meestal wel genoeg voor een iets hogere plaats. Nu valt dat een beetje tegen maar misschien moeten we vandaag met het mooie weer de koeien eens loslaten. De weiden liggen er schitterend groen bij en volgens mij moet dat groene gras toch wel heilzaam werken op de productie. Pak dus allemaal je pakje vouwblaadjes en doe je best

Folding at Home hitparade van 11 april 2004

Top 30

1.	(1)	673	gowron	214.361	(1)
2.	(24)	416	SandStar0SandStar	25.817	(25)
3.	()	389	Team_Pastis_51	82.296	(5)
4.	(31)	388	Vroeg	76.315	(7)
5.	(9)	356	DontMindUsTeam	96.362	(3)
6.	(2)	323	MaCCrunch	15.519	(45)
7.	(6)	294	BananaTeam	4.924	(145)
8.	(11)	262	THiM	4.685	(151)
9.	(1)	180	STW0STW	33.488	(14)
10.	()	160	LANSensations	6.500	(121)
11.	(84)	153	Team_Trudy0VaagOH	11.553	(71)
12.	()	142	ties	138.799	(2)
13.	(30)	141	New_Folder0Project_X	9.581	(86)
14.	(1)	141	New_Folder0Skibbedikade	30.522	(20)
15.	(95)	141	Schapie	3.504	(184)
16.	()	123	Ronnie_Doorzon	10.650	(74)
17.	(10)	113	SandStar0tommy_tooten	21.452	(31)
18.	(27)	112	Zylon_Internet	24.547	(27)
19.	()	106	Crack	2.545	(240)
20.	()	104	SandStar0Sep	31.694	(18)
21.	(3)	96	Clan_Delft0Scourger	15.964	(42)
22.	(5)	94	Clan_Delft0Chibi_T	13.936	(57)
23.	(2)	93	Groazers0Zweetbek	14.969	(49)
24.	(49)	90	Groazers0JR1974	16.543	(40)
25.	(60)	87	Mrieke0Mrieke	1.220	(360)
26.	()	85	Patrick.Sinke	4.092	(171)
27.	(69)	85	New_Folder0Pim	14.885	(50)
28.	(23)	85	Fauna	6.805	(117)
29.	(36)	84	New_Folder0Martijntje	791	(429)
30.	(9)	84	Stressskip	244	(635)

Overall top 30

1.	()	214.361	gowron	673	(1)
2.	()	138.799	ties	142	(12)
3.	()	96.362	DontMindUsTeam	356	(5)
4.	()	88.134	DPC_Division_Brabant0Hakke	0
5.	()	82.296	Team_Pastis_51	389	(3)
6.	()	78.229	vincent	66	(75)
7.	()	76.315	Vroeg	388	(4)
8.	()	75.670	SandStar	0
9.	()	57.589	TEAM_JOE_BAR	0
10.	()	54.719	Halbewoners	0
11.	()	43.598	Anonymous	25	(95)
12.	()	42.622	akeij	70	(43)
13.	()	35.297	de_Gouden_Emmer	81	(38)
14.	()	33.488	STW0STW	180	(9)
15.	()	32.864	RampeStamp	0
16.	()	32.696	TeamAIB	70	(45)
17.	()	32.625	DPC_Team_Switch	0
18.	()	31.694	SandStar0Sep	104	(20)
19.	()	31.145	Aurora	40	(88)
20.	()	30.522	New_Folder0Skibbedikade	141	(14)
21.	()	30.251	Groazers	0
22.	()	27.894	New_Folder0Merlijntje	70	(61)
23.	()	27.346	Team_Trudy	70	(44)
24.	()	26.736	EvilFraude	0
25.	(1)	25.817	SandStar0SandStar	416	(2)
26.	(1)	25.635	Moosehead	36	(90)
27.	()	24.547	Zylon_Internet	112	(18)
28.	()	22.485	SandStar0Xeon	0
29.	()	22.133	tkemme	0
30.	()	21.498	KoeK	70	(46)

Top 15 teams

1.	()	89.223	[H]ardOCP	36.169.236	(1)
2.	()	86.372	Overclockers Australia	34.603.846	(2)
3.	()	82.857	www.overclockers.com	26.143.051	(3)
4.	(1)	41.818	2CPU.com Folding@Home	13.936.624	(5)
5.	(1)	41.466	Alliance Francophone	15.313.720	(4)
6.	()	33.067	Ars Technica Team Egg Roll	10.641.153	(7)
7.	()	30.262	Team MacOS X	3.894.902	(22)
8.	()	28.906	SAGoons	4.874.592	(17)
9.	()	27.429	Team Rage3D	12.587.235	(6)
10.	()	26.043	Team Short-Media	9.853.722	(9)
11.	()	23.725	Maximum PC Magazine	10.525.634	(8)
12.	(1)	23.599	Amdmb.com Folding Team	9.171.065	(10)
13.	(1)	22.866	SilentPCReview Folding@Home	3.852.302	(24)
14.	()	21.594	DSL Reports Team Helix	8.507.358	(11)
15.	(2)	19.650	The Tech Report	7.091.244	(13)
29.	(1)	10.009	Dutch Power Cows	3.491.789	(25)

Leden

Aantal leden	1.302
Verschil met vorige dag	0
Nieuwe leden	0
Retirements	0

Huh?? Niemand joinde gisteren DPC!!! Boehoehoehoeeeee.... :'(

[Verwijderd]

jehhh nieuw record... Plaats 9

sinds de pc's op mn stage weer meegrazen zit ik elke dag in de dag top30

[BizonKid]

THiM, plaats 8 zelfs.

Maar wat is nu het verschil tussen folding@home en distributed folding?

[Tootoo]

BizonKid schreef op 12 april 2004 @ 11:54:
THiM, plaats 8 zelfs.

Maar wat is nu het verschil tussen folding@home en distributed folding?

Het doel is eigenlijk hetzelfde (onderzoeken van eiwitten van het menselijk lichaam en het vouwen ed, je kent het verhaaltje wel ).

Het verschil zit hem in hoe het project gerund wordt: bij Folding@home krijg je een Workunit toegestuurd, deze wordt berekend (indien mogelijk met SSE / SSE2 / 3dnow), waarna deze wordt terug gestuurd. Hiervoor krijg je een aantal credits, afhangend van de grote. Ook afhangend van de grote ben je er wat langer / korter mee bezig, vaak minimaal toch 12 uur indien je een P4 / XP / AMD64 hebt.
Bij Distributed Folding berekenen ze met zijn allen 1 eiwitje tegelijkertijd. Hierbij genereert het programma zelf wat ie moet berekenen en gaat dan aan de slag. Je moet dan denken aan hele kleine stukjes natuurlijk. Ik heb een beetje het vermoeden dat het iets minder efficient gaat, zeker omdat er nog weleens kleine delen verloren gaan. Ook de servers zijn op dit moment iets minder stabiel. Het voordeel is misschien dat je met een lichtere machine sneller toch wel wat output produceert.

Ik hoop dat ik het een beetje goed heb neergezet, misschien ben ik nog wel wat vergeten. Dan is er wel iemand die me kan aanvullen denk ik

[Crack]

Een heel uitgebreide beschrijving van het verschil in benadering staat in dit pdf-bestand:

The first is the splitting of the system into smaller parts that can be processed
separately. However, the interactions between the subsystems
and the communication between the processors constitute a
serious problem when thousands of processors are to be used
simultaneously (see, e.g., www.research.ibm.com/bluegene ).
The second aspect is the splitting of the total simulation time into
shorter times that can be processed independently. This is a
difficult problem, ultimately because time is essentially serial.
Pande and coworkers (1, 2) have recently applied a new
approach to protein folding, the ‘‘distributed computing.’’ The
method is based on the idea that overcoming an energy barrier
is a stochastic process characterized by a distribution of crossing
times. In a first-order process of time constant , the number, N,
of simulations that go to completion in a time t is N
Nt , where N is the total number of simulations performed.
For example, if 105 s, then one in 1,000 simulations should
be completed within a time t 108 s (3).
A complication of the method is that escaping from a metastable
minimum in a multidimensional energy landscape may
involve several different transition states, corresponding to
different transition times (1, 3). Moreover, the spontaneous
search of the energy minimum may involve a succession of
metastable minima (1, 3). In its simplest implementation, the
distributed computing approach is capable of describing correctly
the folding process when: (i) the entire folding process follows first-order kinetics, i.e., there are no additional lag
phases, and (ii) the distribution of the folding times is such that
the fastest folding times are shorter than few tens of nanoseconds,
i.e., the time that can be simulated currently on a single processor.

DF gebruikt volgens mij dus een meer traditionele methode, terwijl F@H nieuwe wegen ingeslagen is. Hun benadering heeft echter wel als consequentie, dat er een deadline op de wu's zit. De resultaten worden immers weer gebruikt bij de volgende berekeningen.

[Verwijderd]

Tootoo schreef op 12 april 2004 @ 12:21:
[...]


Het doel is eigenlijk hetzelfde (onderzoeken van eiwitten van het menselijk lichaam en het vouwen ed, je kent het verhaaltje wel ).

Het verschil zit hem in hoe het project gerund wordt: bij Folding@home krijg je een Workunit toegestuurd, deze wordt berekend (indien mogelijk met SSE / SSE2 / 3dnow), waarna deze wordt terug gestuurd. Hiervoor krijg je een aantal credits, afhangend van de grote. Ook afhangend van de grote ben je er wat langer / korter mee bezig, vaak minimaal toch 12 uur indien je een P4 / XP / AMD64 hebt.
Bij Distributed Folding berekenen ze met zijn allen 1 eiwitje tegelijkertijd. Hierbij genereert het programma zelf wat ie moet berekenen en gaat dan aan de slag. Je moet dan denken aan hele kleine stukjes natuurlijk. Ik heb een beetje het vermoeden dat het iets minder efficient gaat, zeker omdat er nog weleens kleine delen verloren gaan. Ook de servers zijn op dit moment iets minder stabiel. Het voordeel is misschien dat je met een lichtere machine sneller toch wel wat output produceert.

Ik hoop dat ik het een beetje goed heb neergezet, misschien ben ik nog wel wat vergeten. Dan is er wel iemand die me kan aanvullen denk ik

En hoe doet de client het tegen over die van DF? Is FD client stabieler dan die van DF?
Ik wil best mee doen hier aan maar dan moet die wel als ik hem laat grazen ook gewoon blijven grazen en niet met de hand moet herstarten. Verder moet FD client naast UD draaien wat sinds mijn ECC2 avontuur nu mijn hoofd project is. Is er bekend hoe dat samen gaat met UD en of dat überhaut wel kan.
En de laatste vraag kan je bij FD de prioriteit instellen net zoals bij ECC2 en DF?

[Tootoo]

Verwijderd schreef op 12 april 2004 @ 16:29:
[...]
En hoe doet de client het tegen over die van DF? Is FD client stabieler dan die van DF?
Ik wil best mee doen hier aan maar dan moet die wel als ik hem laat grazen ook gewoon blijven grazen en niet met de hand moet herstarten. Verder moet FD client naast UD draaien wat sinds mijn ECC2 avontuur nu mijn hoofd project is. Is er bekend hoe dat samen gaat met UD en of dat überhaut wel kan.
En de laatste vraag kan je bij FD de prioriteit instellen net zoals bij ECC2 en DF?

De client is erg stabiel van F@H. Persoonlijk (correct me if i am wrong) denk ik stabieler dan die van DF. Deze genereert wat vaker fouten (in iedergeval, ik zie redelijk vaak proberen voorbij komen). Ook als er gebruik wordt gemaakt van SSE / SSE2 instructies, is F@H erg stabiel. Je kan deze als service installeren als je wilt, al heb je dan wel een third-party-tool nodig (SandStar weet hier wat meer van dan ik geloof ik). En anders: bij het opstarten van je pc, start f@h automatisch op en zie je een icoontje rechts onder in beeld. Ook kun je hem tegelijkertijd met een ander project gebruiken. In het configuratiescherm staat dat allemaal keurig aangegeven.

http://members.home.nl/tooten --> die bevat een korte handleiding van de installatie, bekijk hem eens zou ik zeggen. Dan zie je ook gelijk de opties waar ik het net over had.

[ Voor 4% gewijzigd door Tootoo op 12-04-2004 17:03 ]

[SandStar]

http://82.210.84.243/sid/ -> faq

Jeemig, kzie nu dat ik eindelijk weer een beetje output heb

[ Voor 60% gewijzigd door SandStar op 12-04-2004 17:45 ]

[BizonKid]

interessante faq, ik begrijp echter het volgende niet bij Systeemeisen:

"Elke WU wordt gebenchmarked op een 'dedicated' 500MHz Celeron zonder SSE/3DNow. Er wordt gekeken hoe lang het duurt voordat deze machine klaar is met een WU. Deze waarde wordt dan x2.5 gedaan. Dit betekent dus dat een gelijkwaardige machine 10 uur per dag kan crunchen en de WU op tijd in kan leveren. "

Vanwaar dan die 10 uur ineens? kan een stomme vraag zijn .

[JohnR]

BizonKid schreef op 12 april 2004 @ 18:00:
interessante faq, ik begrijp echter het volgende niet bij Systeemeisen:

"Elke WU wordt gebenchmarked op een 'dedicated' 500MHz Celeron zonder SSE/3DNow. Er wordt gekeken hoe lang het duurt voordat deze machine klaar is met een WU. Deze waarde wordt dan x2.5 gedaan. Dit betekent dus dat een gelijkwaardige machine 10 uur per dag kan crunchen en de WU op tijd in kan leveren. "

Vanwaar dan die 10 uur ineens? kan een stomme vraag zijn .

24 uur in 1 dag. Factor van 2.5 en 24/2.5 komt wel ongeveer op die 10 uur uit

[BizonKid]

het is omdat ik nu met een wel heel langzame WU bezig ben (p696_L939_K12M_Raleigh) , en mijn pc staat ook niet 24u per dag aan. Ik weet dan ook niet of ik de deadline ga halen, 164/400 frames zijn nu verwerkt sinds gisteren.

[Tootoo]

BizonKid schreef op 12 april 2004 @ 18:34:
het is omdat ik nu met een wel heel langzame WU bezig ben (p696_L939_K12M_Raleigh) , en mijn pc staat ook niet 24u per dag aan. Ik weet dan ook niet of ik de deadline ga halen, 164/400 frames zijn nu verwerkt sinds gisteren.

Je hebt 50 dagen de tijd voor dit ding, zie ook http://vspx27.stanford.edu/psummary.html

Dus dat komt wel goed dan Zie misschien even bij mijn handleiding en zorg er voor dat de forceSSE opties mee worden gegeven. Hierdoor krijg je zogenaamde Gromacs WUtjes meestal, die gaan wat sneller

[SandStar]

Tootoo schreef op 12 april 2004 @ 19:36:
[...]


Je hebt 50 dagen de tijd voor dit ding, zie ook http://vspx27.stanford.edu/psummary.html

Dus dat komt wel goed dan Zie misschien even bij mijn handleiding en zorg er voor dat de forceSSE opties mee worden gegeven. Hierdoor krijg je zogenaamde Gromacs WUtjes meestal, die gaan wat sneller

forceSSE is het niet laten stoppen van SSE instructies na een crash.
advmethods is het krijgen van geavanceerde units (vooral Gromacs)

[Tootoo]

SandStar schreef op 12 april 2004 @ 19:45:
[...]


forceSSE is het niet laten stoppen van SSE instructies na een crash.
advmethods is het krijgen van geavanceerde units (vooral Gromacs)

Correct me if i am wrong: maar door forceSSE worden SSE instructies enabled ipv 3dnow? Die krijg je anders standaard?

[SandStar]

Tinker core (Core_65)

Nix nada noppes aan optimalisaties

Gromacs core (Core_78)

Intel:

-forceasm = SSE instructies gaan niet uit na een crash

AMD:

-forceasm = Forceren gebruik van 3DNow
-forcesse = Forceren gebruik van SSE

Indien geen SSE of 3Dnow aanwezig zullen standaard instructies worden gebruikt.

Double Gromacs core (core_79)

Intel:

-forceasm = forceren gebruik van SSE2

AMD:

-forcesse = forceren gebruik van SSE2

Indien geen SSE2 aanwezig zullen standaard instructies worden gebruikt

[Tootoo]

SandStar schreef op 12 april 2004 @ 21:29:
Tinker core (Core_65)

Nix nada noppes aan optimalisaties

Gromacs core (Core_78)

Intel:

-forceasm = SSE instructies gaan niet uit na een crash

AMD:

-forceasm = Forceren gebruik van 3DNow
-forcesse = Forceren gebruik van SSE

Indien geen SSE of 3Dnow aanwezig zullen standaard instructies worden gebruikt.

Double Gromacs core (core_79)

Intel:

-forceasm = forceren gebruik van SSE2

AMD:

-forcesse = forceren gebruik van SSE2

Indien geen SSE2 aanwezig zullen standaard instructies worden gebruikt

Hebben we beide gelijk

[Verwijderd]

Een beetje laat, maar bedankt voor je antwoord Tootoo.

[Tootoo]

Verwijderd schreef op 13 april 2004 @ 20:08:
Een beetje laat, maar bedankt voor je antwoord Tootoo.

Graag gedaan Als je nog vragen hebt, dont be afraid to ask them