[Rosetta@Home] hitparade van 15 augustus

[Kristof]

Na een (voor de meeste Belgen) verlengd weekend, blijft er nog een korte week over. Z ook voor mij.
Vanmorgen eerst een aantal koffies om terug in het werkritme te komen, dan 1 oog opentrekken, en zien dat er nog geen Rosetta-stats te vinden waren. Na het zien van de daily result van DPC, toch maar het tweede oog ook opentrekken want...

In de stats hieronder zien we dat DPC voor het eerst sinds lange tijd terug met een mooie overschot over de 200k daily is gegaan. Proficiat aan iedereen die hieraan meegewerkt heeft!!!
Het resultaat is dat de overtake van FreeDC naar 170 dagen teruggebracht is.
Gaan we deze output minstens zo houden?

Vanuit het projectteam is er ook het nieuws dat er nieuwe WUs zullen worden vrijgegeven, waarvan je hier de deatils krijgt, wat ze zullen doen:

I've added three new jobs to the queue:
1di2__LARS_ABRELAX_SAVE_ALL_OUT_BARCODE_
1di2__CHEAT_ABRELAX_SAVE_ALL_OUT_BARCODE_
1di2__CONTROL_ABRELAX_SAVE_ALL_OUT_

All are "abrelax" runs (ab initio prediction followed by relaxation, as described below by Bin and Rhiju--graphically speaking, big wiggles followed by small wiggles). The protein is 1di2A. We've already generated a population of decoys for 1di2A, and now we're attempting to use what we've learned from that population to generate a much better population. It's frequently clear from an initial sampling run that certain decoy features are always good--they tend, if present, to give rise to low energy. If we can identify these features, then we can concentrate the next round of sampling on them. We've generally found that features which correlate with low energy in the initial sampling round tend to be present in the native.
Features can include both low-level ones (e.g. torsion angles or rotamers for specific residues) and high-level ones (e.g. beta strand pairings). In these jobs, we're only enriching for low-level features.

The job I'm most excited about is the LARS job; here we've used a sparse linear model to identify a few features that correlated very strongly with the Rosetta energy, and I've enriched for all of them in sampling. The CHEAT job fixes a single linchpin native feature that we hope will result in sampling much closer to the native; it will allow us to test a hypothesis we have about the joint distribution of features in Rosetta sampling. The CONTROL job fixes no features and will serve as a baseline.

Ik ga jullie geduld niet langer op de proef stellen... Je kan hier de volledige stats lezen. De rest van de commentaar mogen jullie geven

[Rosetta@Home] hitparade van 15 augustus 2006

Subteams Daily Top 30
pos		daily	user	total		procent
1.	()	30.652,70	[DPC]FOKschaap	5.572.398,21	(1)	13,2 %
2.	( 48)	23.900,70	BurnHard	1.622.909,29	(6)	10,3 %
3.	( 1)	21.982,60	Cureseekers	5.327.785,55	(2)	9,5 %
4.	( 1)	16.669,40	[DPC] Team ColdFusion	1.584.874,41	(7)	7,2 %
5.	( 1)	12.094,30	Grutte Pier [Wa Oars]	2.516.293,17	(4)	5,2 %
6.	( 1)	7.537,58	Los Alcoholicos	3.630.342,86	(3)	3,2 %
7.	( 20)	6.686,58	RiXarD	21.799,89	(145)	2,9 %
8.	( 2)	6.210,44	[DPC]TeamHC	1.184.266,59	(8)	2,7 %
9.	( 2)	5.739,92	Mbc	475.510,23	(19)	2,5 %
10.	( 7)	4.755,29	borkescomputers	672.251,78	(13)	2,0 %
11.	( 3)	4.406,41	TeamBVD	747.865,86	(12)	1,9 %
12.	( 3)	4.309,16	Basjes	235.774,69	(29)	1,9 %
13.	( 2)	3.870,99	Patman	418.886,75	(20)	1,7 %
14.	( 2)	3.774,03	Chris	143.764,38	(48)	1,6 %
15.	( 4)	3.757,16	Team_Gaol	1.013.618,27	(9)	1,6 %
16.	( 3)	3.629,38	Stonie -= BigBusy.net =-	34.988,28	(111)	1,6 %
17.	( 4)	3.393,70	Dutch Power Chicken	504.155,07	(16)	1,5 %
18.	()	3.094,58	Tukkertje	542.617,89	(14)	1,3 %
19.	()	3.008,24	DPC_Schotse_Hooglanders	414.606,10	(21)	1,3 %
20.	( 6)	2.968,33	[DPC]Division_Brabant	499.753,92	(17)	1,3 %
21.	( 1)	2.643,06	Lmax	78.866,13	(72)	1,1 %
22.	( 7)	2.600,27	MetalMike	963.171,55	(10)	1,1 %
23.	()	2.496,35	Cosmic Cows	479.985,16	(18)	1,1 %
24.	( 8)	2.338,26	Creative ID	234.703,25	(30)	1,0 %
25.	( 10)	2.297,93	paraiko	155.471,88	(44)	1,0 %
26.	( 2)	2.288,52	MolAnO	330.547,99	(25)	1,0 %
27.	( 49)	2.030,10	Frederik	151.138,08	(46)	0,9 %
28.	( 6)	1.994,24	Team_Elteor_Borislavj	2.084.395,56	(5)	0,9 %
29.	( 19)	1.968,55	Da_Bink	277.996,39	(26)	0,8 %
30.	( 4)	1.900,07	Fiestaclub.nl	198.838,49	(33)	0,8 %
More...

Subteams Overall Top 30
pos		overall	user	daily		procent
1.	()	5.572.398,21	[DPC]FOKschaap	30.652,70	(1)	12,5 %
2.	()	5.327.785,55	Cureseekers	21.982,60	(3)	12,0 %
3.	()	3.630.342,86	Los Alcoholicos	7.537,58	(6)	8,1 %
4.	()	2.516.293,17	Grutte Pier [Wa Oars]	12.094,30	(5)	5,6 %
5.	()	2.084.395,56	Team_Elteor_Borislavj	1.994,24	(28)	4,7 %
6.	()	1.622.909,29	BurnHard	23.900,70	(2)	3,6 %
7.	()	1.584.874,41	[DPC] Team ColdFusion	16.669,40	(4)	3,6 %
8.	()	1.184.266,59	[DPC]TeamHC	6.210,44	(8)	2,7 %
9.	()	1.013.618,27	Team_Gaol	3.757,16	(15)	2,3 %
10.	()	963.171,55	MetalMike	2.600,27	(22)	2,2 %
11.	()	758.848,19	[DPC]Team Switch	0,00	(507)	1,7 %
12.	()	747.865,86	TeamBVD	4.406,41	(11)	1,7 %
13.	()	672.251,78	borkescomputers	4.755,29	(10)	1,5 %
14.	()	542.617,89	Tukkertje	3.094,58	(18)	1,2 %
15.	()	525.974,10	NoizyCows	1.163,76	(38)	1,2 %
16.	()	504.155,07	Dutch Power Chicken	3.393,70	(17)	1,1 %
17.	()	499.753,92	[DPC]Division_Brabant	2.968,33	(20)	1,1 %
18.	()	479.985,16	Cosmic Cows	2.496,35	(23)	1,1 %
19.	()	475.510,23	Mbc	5.739,92	(9)	1,1 %
20.	()	418.886,75	Patman	3.870,99	(13)	0,9 %
21.	()	414.606,10	DPC_Schotse_Hooglanders	3.008,24	(19)	0,9 %
22.	()	381.325,53	AJSL	469,21	(55)	0,9 %
23.	()	366.043,15	JZ-power	1.120,39	(39)	0,8 %
24.	()	332.529,80	M_P_G	0,00	(199)	0,7 %
25.	()	330.547,99	MolAnO	2.288,52	(26)	0,7 %
26.	()	277.996,39	Da_Bink	1.968,55	(29)	0,6 %
27.	()	261.793,25	[DPC]NGS	0,00	(501)	0,6 %
28.	()	258.972,66	trenza	1.180,81	(37)	0,6 %
29.	( 1)	235.774,69	Basjes	4.309,16	(12)	0,5 %
30.	( 1)	234.703,25	Creative ID	2.338,26	(24)	0,5 %
More...

Teams Daily Top 15
pos		daily	team	total		procent
1.	()	617.791,00	XtremeSystems	69.524.282,22	(1)	19,3 %
2.	()	232.277,00	Dutch Power Cows	44.636.183,76	(3)	7,3 %
3.	()	163.563,00	Free-DC	50.594.446,06	(2)	5,1 %
4.	()	135.371,00	TeAm AnandTech	23.379.403,19	(4)	4,2 %
5.	()	135.154,00	SETI.USA	7.003.785,82	(10)	4,2 %
6.	()	103.490,00	ROMANIA ROSETTA@HOME	103.489,74	(248)	3,2 %
7.	()	99.480,10	Team MacNN	7.082.673,33	(9)	3,1 %
8.	()	60.705,10	Canada	9.521.071,10	(6)	1,9 %
9.	()	59.365,30	L'Alliance Francophone	5.181.705,30	(16)	1,9 %
10.	()	55.272,90	US-Distributed	8.146.729,84	(8)	1,7 %
11.	()	53.591,90	Ars Technica	8.575.113,67	(7)	1,7 %
12.	()	45.117,70	Czech National Team	5.567.587,51	(15)	1,4 %
13.	()	41.503,70	XPC	14.665.848,18	(5)	1,3 %
14.	()	38.764,60	Teddies	5.833.548,02	(14)	1,2 %
15.	()	35.823,60	BOINC Synergy	6.629.818,90	(12)	1,1 %
More...

Teams Overall Top 15
pos		overall	team	daily		procent
1.	()	69.524.282,22	XtremeSystems	617.791,00	(1)	15,5 %
2.	()	50.594.446,06	Free-DC	163.563,00	(3)	11,3 %
3.	()	44.636.183,76	Dutch Power Cows	232.277,00	(2)	9,9 %
4.	()	23.379.403,19	TeAm AnandTech	135.371,00	(4)	5,2 %
5.	()	14.665.848,18	XPC	41.503,70	(13)	3,3 %
6.	()	9.521.071,10	Canada	60.705,10	(8)	2,1 %
7.	()	8.575.113,67	Ars Technica	53.591,90	(11)	1,9 %
8.	()	8.146.729,84	US-Distributed	55.272,90	(10)	1,8 %
9.	()	7.082.673,33	Team MacNN	99.480,10	(7)	1,6 %
10.	()	7.003.785,82	SETI.USA	135.154,00	(5)	1,6 %
11.	()	6.816.116,09	Phoenix Rising	9.367,63	(54)	1,5 %
12.	()	6.629.818,90	BOINC Synergy	35.823,60	(15)	1,5 %
13.	()	6.150.366,50	Housing and Food Services	20.063,40	(25)	1,4 %
14.	()	5.833.548,02	Teddies	38.764,60	(14)	1,3 %
15.	()	5.567.587,51	Czech National Team	45.117,70	(12)	1,2 %
More...

Mijlpalen
user	mijlpaal
Frederik	150.000
RiXarD	20.000
William	1.000

When do we reach the 45.000.000?
We will reach this goal in 2 days.

When do we get them...
days	team
176	Free-DC

When do they get us...
nobody

New members
nobody

Rosetta@home Links
Rosetta@home Homepage
Officiële stats
DPC Rosetta FAQ
DPCH Suggestiepagina
Bron

[Verwijderd]

Woei! Mijlpaal

[BurnHard]

Verwijderd schreef op woensdag 16 augustus 2006 @ 10:11:
Woei! Mijlpaal

Morgen dan maar weer één

[ColdFusion]

16k al, onze output is al lekker gestegen. Jammer dat we alleen nog niet veel inlopen op Burnhard, maar dat komt nog wel

En DPC weer eens boven de 200k daily, dat is toch ook wel mooi

[BurnHard]

ColdFusion schreef op woensdag 16 augustus 2006 @ 10:25:
16k al, onze output is al lekker gestegen. Jammer dat we alleen nog niet veel inlopen op Burnhard, maar dat komt nog wel

En DPC weer eens boven de 200k daily, dat is toch ook wel mooi

Ik ga niet aan de 16k per dag komen denk ik, dus binnenkort zal het wel weer een wissel van de wacht worden

[Rixard]

De kudde is losgebroken! nu doorgaan met deze output.

[ColdFusion]

BurnHard schreef op woensdag 16 augustus 2006 @ 11:11:
Ik ga niet aan de 16k per dag komen denk ik, dus binnenkort zal het wel weer een wissel van de wacht worden

Ah kom op, er staat vast nog wel ergens een koetje uit z'n neus te vreten

[BurnHard]

ColdFusion schreef op woensdag 16 augustus 2006 @ 11:46:
[...]

Ah kom op, er staat vast nog wel ergens een koetje uit z'n neus te vreten

[Mobster]

Toch weer een aantal nieuwe namen zie ik. Zelf ben ik na 2 weken vakantie ook weer begonnen op het jagen van subteamgenootjes Dat zou een podiumplek binnen LA betekenen

[Verwijderd]

Ben ook maar weer begonnen een paar weken geleden (eigenlijk op het moment dat ik het ronduit beu was ) en nu een top-30 hebben is wel leuk. Misschien dat ik maar eens op zoek ga naar een subteam

[Kristof]

Verwijderd schreef op woensdag 16 augustus 2006 @ 12:34:
Ben ook maar weer begonnen een paar weken geleden (eigenlijk op het moment dat ik het ronduit beu was ) en nu een top-30 hebben is wel leuk. Misschien dat ik maar eens op zoek ga naar een subteam

Beu zijn? Hoe kan je dat nu beu zijn?
Alleen crunchen kan leuk zijn, en als je wat extra power hebt (cfr Burnhard), is het iets om fier op te zijn wat je in je eentje kan bereiken.
Binnen een subteam heb je natuurlijk wel enkele bijkomende voordelen. Zo kan je gezamelijk (dus als subteam) proberen zo hoog mogelijk te komen. Je hebt binnen je subteam nog een extra competitie. En je hebt natuurlijk de teamsfeer (dit laatste natuurlijk het meeste in 1 welbepaald, niet-nadergenoemd subteam )

[Verwijderd]

BurnHard schreef op woensdag 16 augustus 2006 @ 10:17:
[...]


Morgen dan maar weer één

Morgen haal ik waarschijnlijk net niet. Dan maar overmorgen

[Mobster]

WIlde ik net weer een vers bakkie installeren, zie ik dat versie 5.4.11 kan downloaden. We zaten toch al op 5.5.0???

[ColdFusion]

Kristof schreef op woensdag 16 augustus 2006 @ 12:45:
En je hebt natuurlijk de teamsfeer (dit laatste natuurlijk het meeste in 1 welbepaald, niet-nadergenoemd subteam )

Wat aardig dat je reclame maakt voor ons

[Verwijderd]

Kristof schreef op woensdag 16 augustus 2006 @ 12:45:
[...]

Beu zijn? Hoe kan je dat nu beu zijn?
Alleen crunchen kan leuk zijn, en als je wat extra power hebt (cfr Burnhard), is het iets om fier op te zijn wat je in je eentje kan bereiken.
Binnen een subteam heb je natuurlijk wel enkele bijkomende voordelen. Zo kan je gezamelijk (dus als subteam) proberen zo hoog mogelijk te komen. Je hebt binnen je subteam nog een extra competitie. En je hebt natuurlijk de teamsfeer (dit laatste natuurlijk het meeste in 1 welbepaald, niet-nadergenoemd subteam )

Dat beu komen gaat redelijk makkelijk, vooral als je een slechte dag hebt en je je begint te ergeren aan het marginale lawaai dat van onder en bovenop je bureau komt,...

[Sybr_E-N]

Mobster schreef op woensdag 16 augustus 2006 @ 15:55:
WIlde ik net weer een vers bakkie installeren, zie ik dat versie 5.4.11 kan downloaden. We zaten toch al op 5.5.0???

Is die 5.5.0 niet de versie van de optimized versie?

[Martijn13]

Sybr_E-N schreef op woensdag 16 augustus 2006 @ 16:36:
[...]


Is die 5.5.0 niet de versie van de optimized versie?

Helemaal correct