Rosetta@BOINC : Aanzet FAQ

Pagina: 1
Acties:
  • 628 views sinds 30-01-2008
  • Reageer

Onderwerpen


  • Kristof
  • Registratie: Januari 2002
  • Laatst online: 12-03 14:08

Kristof

is een Belgisch product

Topicstarter
Gezien de positieve reacties op Rosetta@BOINC, heb ik het begin van een FAQ opgezet.
Ik heb getracht om de informatie met medische uitleg e.d. vanop de website zo goed mogelijk te vertalen en samen te vatten.

Hieronder vinden jullie wat er momenteel van geworden is.


Reacties zijn uiteraard welkom, alsook tips/aanvullingen/verbeteringen.
Gelieve dit topic wel enkel te gebruiken om een FAQ op te stellen, en dus de algemene vragen etc in het andere topic ( Rosetta@Home ) te houden.


Wat er nog gedaan moet worden:
* Layout
* Uiteraard alle delen verbeteren/uitbreiden
* Een stuk over de instellingen via het user panel, waar je je configuraties kan instellen.
* Screenshots + extra uitleg over het installeren van de algemene BOINC manager...
* Optimized clients
* ...

"You can get more with a kind word and a gun than you can with a kind word alone." - Al Capone


  • Kristof
  • Registratie: Januari 2002
  • Laatst online: 12-03 14:08

Kristof

is een Belgisch product

Topicstarter
Rosetta@BOINC FAQ
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/

=======================================
BOINC?
=======================================
'Berkeley Open Infrastructure for Network Computing' is een opensource platform waarop verschillende projecten (kunnen) draaien.
Denken we bijvoorbeeld ook aan het andere DPC project, namelijk SETI dat er ook op draait.

BOINC draait officieel op Windows, MacOSX, Linux en Solaris/SPARC.
Daar het opensource is, kan je voor de andere OSen zelf je code compileren, of via 3rd-party de voorgecompileerde codes downloaden (http://boinc.berkeley.edu/download_other.php)

Naast het feit dat het opensource is, zijn er nog andere voordelen van BOINC:
* Het framework wordt steeds doorontwikkeld
* Verschillende projecten maken er gebruik van, dus de kans dat er geen support meer voor geleverd zal worden, is bijna nihil
* Je kan gemakkelijk van project verwisselen, of zelfs meerdere projecten tegelijkertijd draaien (tegelijkertijd as in om de beurt (een) job(s) van de verschillende projecten)

Meer info op: http://boinc.berkeley.edu/

=======================================
WAT is Rosetta?
=======================================
Rosetta is ook een medisch onderzoeksproject dat proteïne structuren probeert te voorspellen en ontwerpen, en de interactie tussen proteïnes onderzoekt. Dit uiteraard met het oog op zo medicijnen en/of genezingsmethodes te ontwikkelen tegen ziektes zoals onder andere kanker, SARS, HIV/AIDS, malaria, ...
Op (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_research.php) vind je meer uitleg over de precieze werking.
Al deze onderzoeken gebeuren in samenwerking met de University of Washington.

Rosetta is een relatief nieuw project, maar heeft al wel iets opgeleverd. De core van het programma (die de voorspellingen en het ontwerp van de proteïne doet) wordt momenteel gebruikt in Robetta (http://robetta.bakerlab.org/). Dit is een publiekelijk beschikbare 'Protein Structure Prediction Server', welke momenteel gratis gebruikt wordt door enkele 100den academische onderzoekers verspreid over de wereld.

Meer info op: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_about.php

=======================================
Client
=======================================
De systeem vereisten zijn:
* Minstens 500 MHz
* 200 MB vrije HD ruimte (deze zal echter niet zoveel in gebruik nemen)
* 512 MB ram geheugen
* Internet connectie

De BOINC client kan gedownload worden op http://boinc.berkeley.edu/download.php
Screenshot van de client:
Afbeeldingslocatie: http://users.pandora.be/truyts/BOINC/manager.jpg

Uitleg over de verschillende tabs en schermen, vind je hier: http://boinc.berkeley.edu/manager.php


=======================================
Registratie/installatie
=======================================
Een account aanmaken kan op: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/create_account_form.php
waar je een naam kan ingeven, en waar je je uiteraard ook als team "Dutch Power Cows" invult.
Of nog sneller via de rechtstreekse url:
http://boinc.bakerlab.org...ccount_form.php?teamid=78
waar je je ineens opgeeft voor het team DPC.

Zie ook de naamgeving voor leden van subteams.

Via de webinterface op http://boinc.bakerlab.org/rosetta/home.php kan je de meeste configuraties afhandelen. (wanneer online, wanneer de client mag draaien etc)
Je hebt hier:
* Eerst de algemene settings
* Setting specifiek voor Rosetta project
* Binnen deze settings kan je dan ook nog profielen maken voor gebruik op laptop, thuis-pc, werk...


Dan de installatie:

1/ Eerst dient de algemene BOINC client geïnstalleerd te worden:
Tijdens de installatie heb je 3 opties:
* Single-user installation: De client zal enkel draaien als de user (die het geïnstalleerd heeft) ingelogd is. Als andere gebruikers van die pc inloggen, zal de client niet draaien.
* Shared installation: De client zal draaien als eender welke gebruiker ingelogd is.
* Service Installation: Zegt genoeg, denk ik. Als je de checkbox "run on startup" aanvinkt, zal de client starten, zelfs als er geen user ingelogd is. Je hebt hier ook de mogelijkheid om volledig verborgen te draaien, of om de manager toch op te laten starten.

Er zijn nog andere (geavanceerde) manieren, zoals via Active Directory laten installeren, maar daar deze doorgaans niet van toepassing zijn op de doorsnee gebruiker, verwijzen we u door naar:
http://boinc.berkeley.edu/win_install.php


2/ Na het installeren van de BOINC client, moet je nog wel opgeven dat je voor Rosetta zal crunchen.
Dit doe je door in het menu "Projects" op "ATTACH" te klikken, waarna hij de project url vraagt.
Afbeeldingslocatie: http://users.pandora.be/truyts/BOINC/attach2.jpg

Voor Rosetta is deze: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/
Daarna wordt je gebruikersnaam en passwoord gevraagd.
Afbeeldingslocatie: http://users.pandora.be/truyts/BOINC/attach3a.jpg

Indien je al een account hebt aangemaakt, kies je voor de 2de optie.
Afbeeldingslocatie: http://users.pandora.be/truyts/BOINC/attach3b.jpg

Nog even op next klikken, en je client is geïnstalleerd.


=======================================
Punten, Sparen en MegaFlushen
=======================================
Punten worden berekend aan de hand van de tijd die benodigd was om een job te berekenen, en een score die je processor krijgt.
Zie ook http://boinc.berkeley.edu/credit.php

De mogelijkheden van Sparen en MegaFlushen is bij BOINC projecten maar zeer beperkt aanwezig.
Jobs van Rosetta hebben (op dit moment) een geldigheidsperiode van 28 dagen.
Voorlopig meer info op: APClll in "BOINC client vragen/antwoorden"

=======================================
Offline gebruiken
=======================================
Het is spijtig genoeg niet mogelijk om BOINC op computers te draaien zonder internet verbinding. Dit komt doordat de jobs niet te inporteren en te exporteren zijn via bv. een usb stick.


=======================================
Statistieken
=======================================
Officiële statistieken: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/stats.php

DPC stats op:
http://stats.wilc0.com/
http://www.dutchpowercows.org/~dpch/dpch.pl?project=rosetta


Zoals bij de meeste DC-projecten, bestaan er ook bij BOINC geen subteams. Deze moeten dus door de statsbakkers verzorgd worden. Als je dus tot een subteam behoort, dien je je naam via een bepaalde regel op te stellen.
Uw naam wordt dan: subteam~nickname
Dus bijvoorbeeld: Cureseekers~Kristof
Op deze basis kan een statsbakker dan de subteams en hun respectievelijke leden eruithalen.


=======================================
Client Monitoren en andere tools
=======================================
Er zijn al enkele tooltjes ontwikkeld om de clients te monitoren
http://boinc.berkeley.edu/download_network.php

Maar ook weer doordat het opensource is, kan je zelf je tools ontwikkelen.
Alle informatie over je account/client wordt weggeschreven in xml-files, welke je kan uitlezen. Alle informatie (en beschrijving/lay-out) van deze files, kan je op de BOINC pagina (http://boinc.berkeley.edu/index.php) vinden.


=======================================
Problemen en Hints/tips
=======================================
1/ Melding 'Not enough free disk space' terwijl er nog genoeg vrij is:
Rosetta troubles...

2/ ...

[ Voor 14% gewijzigd door Kristof op 11-11-2005 12:58 ]

"You can get more with a kind word and a gun than you can with a kind word alone." - Al Capone


  • Mobster
  • Registratie: Februari 2000
  • Laatst online: 07-06-2016

Mobster

Los Alcoholicos

* Het is 3rd party
* proteïne en proteïnes (met een trema dus)
* onderandere zijn twee woorden
* MHz (hoofdletter H)
* Bij systeemeisen doe je alles in het nederlands behalve Free Disk Space. Even vertalen dus
* Bij Dan de installatie vergeet je een keer een A bij installtie
* hidden -> verborgen
* Active Directory (spatie dus)
* doorsnee met 2e's :)
* geïnstalleerd (met een trema dus)

Dat zijn alleen de spellingspuntjes :)

Toch maar eens een andere sig bedenken :P


  • Kristof
  • Registratie: Januari 2002
  • Laatst online: 12-03 14:08

Kristof

is een Belgisch product

Topicstarter
Bij deze allemaal aangepast :)
alvast bedankt om het ten minste te lezen :D

[ Voor 45% gewijzigd door Kristof op 10-11-2005 13:28 ]

"You can get more with a kind word and a gun than you can with a kind word alone." - Al Capone


Anoniem: 133572

Leuk verhaal. Ik heb al eens wat gehoord over BOINC. Ik ben een seti@home gebruiker (al jaren) en ik gebruik nog de seti@home client. Ik wil misschien wel eens wat met BOINC gaan proberen maar ik wil (ook) doorblijven gaan met mijn seti@home crunching. Kan dat? Ik bedoel kan ik met BOINC ook Seti@home verwerken en wat doet dat dan met mijn statistieken? Ik wil gewoon mijn seti@home statistieken blijven aanvullen. Het zou fijn zijn als iemand daar uitsluitsel over kan geven. Het lijkt me op zich wel leuk om naast seti ook wat andere dingen te crunchen.

edit: lijkt me wel handig voor de FAQ, er zullen vast meer seti mensen zijn met deze vraag.

[ Voor 8% gewijzigd door Anoniem: 133572 op 10-11-2005 13:23 ]


  • Kristof
  • Registratie: Januari 2002
  • Laatst online: 12-03 14:08

Kristof

is een Belgisch product

Topicstarter
Normaal staat dat in de S@H faq
http://www.dutchpowercows.org/doc.php?id=335#top
Maar eerlijk gezegd vind ik het ietwat onduidelijk. (ik draai dan ook geen seti)
Als ik het goed begrepen heb, blijf je je account behouden (je hoeft je niet opnieuw te registreren), maar begin je met de punten wel terug vanaf 0

"You can get more with a kind word and a gun than you can with a kind word alone." - Al Capone


  • SandStar
  • Registratie: Oktober 2002
  • Laatst online: 14:36

SandStar

DPC-Crew

Zandster

Er is sinds een tijdje een format gemaakt voor opstellen van project faqs.
Ik zal deze voor jou beschikbaar maken zodat je misschien via dat format kunt gaan werken.

Idee is dat alle projecten dan gelijk zijn qua faq opbouw.

  • Kristof
  • Registratie: Januari 2002
  • Laatst online: 12-03 14:08

Kristof

is een Belgisch product

Topicstarter
Oki: Je hebt mijn e-mailadres ;)

"You can get more with a kind word and a gun than you can with a kind word alone." - Al Capone


Anoniem: 133572

Kristof schreef op donderdag 10 november 2005 @ 13:28:
Als ik het goed begrepen heb, blijf je je account behouden (je hoeft je niet opnieuw te registreren), maar begin je met de punten wel terug vanaf 0
Dan ga ik dus niet naar BOINC

  • mcB
  • Registratie: Mei 2002
  • Laatst online: 10:15

mcB

Misschien dat je wat hebt aan het volgende:
If you participated in SETI@home Classic before 23 March 2005, we've created a SETI@home/BOINC account for you. It's linked to your Classic account so that it shows your work totals and signup date from Classic.
link: http://setiathome.berkeley.edu/sah_email_form.php

Strix (Skullflame)


  • rblok
  • Registratie: Juni 2002
  • Laatst online: 10:10
Om je direct op de Dutch Power Cows team aan te melden kan je ook de link http://boinc.bakerlab.org...ccount_form.php?teamid=78 gebruiken

:)

Walking on water and developing software from a specification are easy if both are frozen. - Edward V Berard


  • Crack
  • Registratie: Februari 2000
  • Laatst online: 15-06 12:59

Crack

...ehh.......Mooh?!?

Dat moet er zeker in staan.

Bij BOINC is het namelijk zo, dat de punten die je spaart voordat je joint wel in de rangschikking staan, maar niet bij het puntentotaal van DPC geteld worden. Het is dus zaak zo snel mogelijk te joinen.

Wereldrecord voor ChicaneLinacB90 Badges


  • Pim.
  • Registratie: Mei 2001
  • Laatst online: 14-05 09:00

Pim.

Aut viam inveniam, aut faciam

Erg goed initiatief van je kristof :)

"The trouble with quotes from the Internet is that you can never know if they are genuine." - Elvis Presley | Niet met me eens ? DM ME


  • rblok
  • Registratie: Juni 2002
  • Laatst online: 10:10
Idd een mooi initiatief.
Als het goed is lever ook ik vandaag mijn eerste puntjes in }:O

Is er eigenlijk al enige ervaring met een lokale monitoring tool???
De link die in de FAQ staat naar de bakerlab site is niet echt overzichtelijk :P

Walking on water and developing software from a specification are easy if both are frozen. - Edward V Berard


  • archetta
  • Registratie: Maart 2003
  • Laatst online: 14-05-2022
ziet er goed uit! mooi werk :)

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • rblok
  • Registratie: Juni 2002
  • Laatst online: 10:10
En natuurlijk een stats page

http://stats.wilc0.com/

Walking on water and developing software from a specification are easy if both are frozen. - Edward V Berard


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • RoyalFlusher
  • Registratie: April 2002
  • Laatst online: 28-05 15:45
Dan is het ook handig om uit te leggen hoe de subteamstats werken.
Het formaat is subteamnaam~lidnaam meen ik.

Division BrabanderT


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Mobster
  • Registratie: Februari 2000
  • Laatst online: 07-06-2016

Mobster

Los Alcoholicos

Is afhankelijk van de statsbakker natuurlijk :)

Kunnen we deze opzet gelijk beschouwen als een open sollicitatie voor PV-er? ;)

Toch maar eens een andere sig bedenken :P


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Xaverius
  • Registratie: Juni 2001
  • Laatst online: 09:03

Xaverius

Ultraloper - korte dan... 😎

RoyalFlusher schreef op vrijdag 11 november 2005 @ 11:03:
Dan is het ook handig om uit te leggen hoe de subteamstats werken.
Het formaat is subteamnaam~lidnaam meen ik.
Mobster schreef op vrijdag 11 november 2005 @ 11:56:
Is afhankelijk van de statsbakker natuurlijk :)
Kunnen we deze opzet gelijk beschouwen als een open sollicitatie voor PV-er? ;)
Inderdaad want in de stats van squeeze staan de subteams vermeld maar in die op WDO staan de subteamusers nog apart vermeld.

Overigens lijkt het erop dat de meeste animo op dit moment voor Rosetta is als nieuw project.
Goede kick-off Kristof :)

https://smashrun.com/hans.vandermeer/invite
Stop de verwelking!
COVID19 resultaat: 30% meer hardgelopen dan ooit, langste afstand van 52 -> 69km gebracht


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Kristof
  • Registratie: Januari 2002
  • Laatst online: 12-03 14:08

Kristof

is een Belgisch product

Topicstarter
Heb getracht de meeste hints aan te passen.in de bovenstaande tekst.
Met uitzondering van de monitoring tools. Deze heb ik zelf nog niet kunnen uittesten. Dus als iemand zich geroepen voelt... :D

[ Voor 8% gewijzigd door Kristof op 11-11-2005 12:59 ]

"You can get more with a kind word and a gun than you can with a kind word alone." - Al Capone


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Kristof
  • Registratie: Januari 2002
  • Laatst online: 12-03 14:08

Kristof

is een Belgisch product

Topicstarter
Even een oproep:

* Zijn er mensen die ervaring hebben met het installeren van BOINC onder Windows 95/98/ME (is er een verschil met de installatie onder w2k/XP en dan vooral wat service betreft?)

* Alsook voor installatie onder de andere OSen, zoals linux, MacOS, ...

Graag een reactie. Dan kan ik het opnemen in de FAQ!

"You can get more with a kind word and a gun than you can with a kind word alone." - Al Capone


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Gondor
  • Registratie: September 2003
  • Laatst online: 12:34
Zie http://boinc.berkeley.edu/bare_core.php

Installatie onder linux(unix) zonder X:
* Download client, bestand uitpakken.
* Ga naar de BOINC folder en koppel de client aan rosetta project met
"./boinc -attach_project http://boinc.bakerlab.org/rosetta [accountkey]"
Nu wordt werkbestanden en settings gedownload en je systeem wordt gebenchmarkt.

Als je alles over je scherm ziet rollen kan je na de benchmarkresultaten 'killall boinc' doen en met 'nohup ./boinc -return_results_immediately>>boinc.log 2>>error.log &' opnieuwe starten zodat je niet alle output op je scherm krijgt.

Bovenste kan je ook gebruiken als je X hebt.
kan spellfouten bevatten, ik heb het niet nagekeken.

"Peace cannot be kept by force. It can only be achieved by understanding"-Albert Einstein-


Acties:
  • 0 Henk 'm!

Anoniem: 86809

Voor Mac OS X (10.3 of hoger) zijn er de Standard GUI (BOINC Manager), Menubar (simple GUI) en de Core client (commandline) beschikbaar. De Standard GUI installeert zich zelf en werkt hetzelfde als de Windowsversie. Dus die Howto is hetzelfde. De Menubar heb ik niet geprobeerd en daar kan ik dus niets van zeggen. Downloads: http://boinc.berkeley.edu/download.php

maar... met deze standaard Boinc client software presteert een Mac maar matig/slecht. :(

Bij Team MacNN zijn Voor Mac OS 10.3.9 - 10.4.x geoptimaliseerde versies (Superbench clients) te downloaden die zorgen voor een kleine 300% prestatieverbetering. Ook in de smaken Boinc Manager, Menubar en Cli. Doen dus. :)

De geoptimaliseerde commandline client:
  • Na registratie bij Rosetta@home (Create an account) onvang je een mailtje met je Account Key
  • Download van Team MacNN de CLI 4.44 Client (boinc_4.44_ppcGxSuperbench) voor je G3, G4 of G5 processor.
  • Maak een Boinc folder en zet daar boinc_4.44_ppcGxSuperbench in.
  • Open een Terminal shell
  • Ga naar je Boinc folder en koppel de client aan het rosetta project met: "./boinc_4.44_ppcGxSuperbench -attach_project http://boinc.bakerlab.org/rosetta [Account Key]"
  • Verstuur een break nadat je systeem is gebenchmarkt.
  • Start boinc opnieuw op met: "./boinc_4.44_ppcGxSuperbench -return_results_immediately"
    (de optie -return_result_immediately is niet noodzakelijk maar zorgt ervoor dat je resultaten meteen gerapporteerd worden en dat is wel zo prettig als je zonder GUI werkt).
Ik heb nog een Celly met win98, dus daar heb ik de Boinc Manager ook maar op geïnstalleerd.
De enige optie is installeren als Single user. Service en Shared zijn grayed out, dus niet mogelijk.
Voor de rest is er geen verschil met WinXP.


Misschien is het ook handig om in het Windows-gedeelte ook een stukje over geoptimaliseerde Boinc clients op te nemen in de faq.

Geoptimaliseerde client

Als je projecten hebt op het BOINC platform,zoals Rosetta@home, heeft het nut om een cpu-geoptimaliseerde BOINC client te installeren.
Een geoptimaliseerde BOINC client heeft geen invloed op de snelheid van berekeningen... maar heeft wel effect op de benchmarks. En die zijn bepalend voor de geclaimde credits. Afhankelijk van je processor is de winst 125% tot 175% (bij mij).

De installatie is simpel:
Bepaal welk level SSE je processor gebruikt (bijv. met de freeware utility CPU-Z).
  • Download de bij jouw processor passende client bij truXoft.
  • Sluit boinc even af (en maak een backup van de boinc dir, voor de zekerheid)
  • Vervang boinc.exe in je boinc map door de geoptimaliseerde client
  • Start boinc opnieuw op. De manager bemerkt de nieuwe versie en start een benchmark.
  • De 'measured foating point en integer speed' is nu in overeenstemming je processor.
Ik heb geen ervaring een geoptimaliseerde linux client... iemand anders?

[ Voor 42% gewijzigd door Anoniem: 86809 op 13-11-2005 11:06 . Reden: Aanvulling Win98 + geoptimaliseerde client ]


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • flowerp
  • Registratie: September 2003
  • Laatst online: 20-05 21:31
Anoniem: 86809 schreef op zondag 13 november 2005 @ 00:56:

maar... met deze standaard Boinc client software presteert een Mac maar matig/slecht. :(
[...]
Een geoptimaliseerde BOINC client heeft geen invloed op de snelheid van berekeningen... maar heeft wel effect op de benchmarks.
Mischien moet dan in de faq komen dat cpu X slecht -lijkt- te presteren, maar dat dat alleen komt omdat ie verkeerd ge-benched wordt, niet omdat ie echt langzaam is. Dit lijkt een beetje op het pentium-m verhaal, die gewoon ALTIJD voor elke client een te lage score lijkt te krijgen.

Als het echt alleen maar een kwestie van de bench code is, dan hoop ik dat deze cpu's gewoon meegenomen worden in de code van de standaard clients.

Als ik die truXoft client pagina lees krijg ik er toch wel een beetje raar gevoel bij. De author hoopt dat ie met z'n modificaties geen algortimes of iets dergelijks heeft verstoord. Tsja... als je het met name voor het medische nut doet is het natuurlijk een beetje lullig als je een jaar lang hebt lopen te crunchen en dat dan blijkt dat al jou results waardeloos zijn? Of zou hier vanaf de server kant een bescherming voor zijn? Hoop het wel!

It's shocking to find how many people do not believe they can learn, and how many more believe learning to be difficult.


Acties:
  • 0 Henk 'm!

Anoniem: 86809

Doordat de standaard Boinc client geen rekening houdt met processor specifieke mogelijkheden krijg je met een aantal processoren een te lage waardering per cpu tijd. Door een cpu-geoptimaliseerde client te gebruiken corrigeer je die fout. Niet meer en niet minder.

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • flowerp
  • Registratie: September 2003
  • Laatst online: 20-05 21:31
Anoniem: 86809 schreef op zondag 13 november 2005 @ 22:39:
Doordat de standaard Boinc client geen rekening houdt met processor specifieke mogelijkheden krijg je met een aantal processoren een te lage waardering per cpu tijd. Door een cpu-geoptimaliseerde client te gebruiken corrigeer je die fout. Niet meer en niet minder.
Leuk, maar laat de standaard client daar dan WEL rekening mee houden. De benchmark code voor specifieke cpu's is er nu. Doe gewoon een backport naar de main-branch van Boinc, en iedereen is weer blij. Toch?

It's shocking to find how many people do not believe they can learn, and how many more believe learning to be difficult.


Acties:
  • 0 Henk 'm!

Anoniem: 86809

Yup...

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • enermax
  • Registratie: Oktober 2001
  • Laatst online: 22-06 09:53
Als hij het na het installeren niet doet. Rechtermuisknop op Icoontje in taakbalk Voer Altijd Uit. Staat volgens mij niet in Faq. Als het wel erin staat ik heb leeslexie B)

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Kristof
  • Registratie: Januari 2002
  • Laatst online: 12-03 14:08

Kristof

is een Belgisch product

Topicstarter
Als hij het na installatie niet doet, heb je in de settings op http://boinc.bakerlab.org/rosetta/home.php zitten prullen. Je hebt dan waarschijnlijk in 1 van de settings ergens restricties opgelegd tussen welke tijden hij mag draaien of dergelijke.

"You can get more with a kind word and a gun than you can with a kind word alone." - Al Capone


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • enermax
  • Registratie: Oktober 2001
  • Laatst online: 22-06 09:53
Kristof schreef op maandag 21 november 2005 @ 08:18:
Als hij het na installatie niet doet, heb je in de settings op http://boinc.bakerlab.org/rosetta/home.php zitten prullen. Je hebt dan waarschijnlijk in 1 van de settings ergens restricties opgelegd tussen welke tijden hij mag draaien of dergelijke.
Nee hoor heb gewoon deze guide gevolgt. Maar een mede teamlid wees op me op die tip, hij had hetzelfde probleem 2weekjes geleden bij het joinen.

Acties:
  • 0 Henk 'm!

Anoniem: 138731

Woei R@H is vanaf nu een officieel DPC project _/-\o_ iisschots in "Nieuw project: Rosetta@home"

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Kristof
  • Registratie: Januari 2002
  • Laatst online: 12-03 14:08

Kristof

is een Belgisch product

Topicstarter
Ik heb ondertussen de FaQ herschreven naar de DPC-template
en de voorlopige versie is te vinden op:
http://users.pandora.be/truyts/BOINC/rosetta.xml

"You can get more with a kind word and a gun than you can with a kind word alone." - Al Capone


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • KompjoeFriek
  • Registratie: Maart 2001
  • Laatst online: 11-06 04:49

KompjoeFriek

Statsidioot

Vannacht heb ik op mijn debian machiene zelf de boinc client gecompileerd, zal later how-to hier posten :)

(verschil is al meteen merkbaar)

[edit]
Ben begonnen met een berg packages te installeren volgens http://boinc.berkeley.edu/debian_linux_install.txt
kort samengevat:
code:
1
apt-get install g++ mesag-dev libglu1-mesa-dev libmysqlclient-dev libglut3-dev libgtk2.0-dev libwxgtk-dev autoconf automake1.8 libcurl-dev libjpeg-dev

In de map waar ik de code van CVS had uitgepakt voerde ik het volgende uit:
code:
1
2
3
4
./_autosetup
./configure --with-ssl=/boinc-map/openssl/
make
make install
De boinc-client bevind zich nu in /usr/bin

Mijn score is nou niet wat je zegt super op die machine (AMD1Ghz/128Mb) maar alle beetjes helpen :) Klein overzichtje van de benchmarks:
code:
1
2
3
4
Versie          | FPU Speed     | Integer Speed
-----------------------------------------------
Standard  5.2.7 | 501,8 MFIOps  | 0,812 GIOps
Optimized 5.3.1 | 595,9 MFIOps  | 1,038 GIOps
Dit is dus nog niet eens geoptimaliseerd voor de gebruikte CPU, maar alleen zelf compiled. Hoe je optimized zegt Z!oN in deze post :)

[ Voor 86% gewijzigd door KompjoeFriek op 30-11-2005 00:44 ]

WhatPulse! - Rosetta@Home - Docking@Home


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • ScSi
  • Registratie: Oktober 2003
  • Laatst online: 19-05 22:14

ScSi

Belg.

Nog wat aanvullingen

Unofficial BOINC-wiki: http://boinc-doc.net/boinc-wiki/index.php?title=Main_Page

Stats: http://www.boincstats.com/ (met mogelijkheid om een gif te creeëren van jouw stats; heel veel grafiekjes ook)

'mega'flushen: Ga naar je instellingen op rosetta website http://boinc.bakerlab.org/rosetta/home.php
Bij 'general preferences' staat 'Connect to network about every' die kun je meer maken, hiermee wordt je queue langer. Je moet wel nog bij Boinc even Rosetta updaten om nieuwe jobs binnen te halen. (en om geen jobs te versturen kun je de network activity op suspend zetten, rechterknop op Boinc logo in je taakbalk)
Eronymus in "[Rosetta@Home] hitparade van 9 december"

Optimized Client: [BOINC] Optimized Client !!

[ Voor 11% gewijzigd door ScSi op 10-12-2005 11:51 ]


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Defector
  • Registratie: December 2005
  • Niet online
la muis in je post verwijs je naar truxoft maar dat zijn verouderde clients.
hier zijn nieuwere en snellere boinc clients http://www.guntec.de/Crunch3r/boincx86.html

[ Voor 11% gewijzigd door Defector op 10-12-2005 11:59 . Reden: zaterdag morgen ]


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Sybr_E-N
  • Registratie: December 2001
  • Laatst online: 22-06 16:29
Ik kwam in mijn zoektocht naar de verschillende optimized boinc clients afgelopen week ook nog de volgende link tegen: FokWiki RAHhandleiding.
Daarnaast nog de volgende link voor statistieken Rosetta@home BOINC Team Statistics- Team - "BOINC Synergy", van onze vrolijke vrienden die we net ingehaald hebben.

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • ScSi
  • Registratie: Oktober 2003
  • Laatst online: 19-05 22:14

ScSi

Belg.

Omdat Kristof vroeg iets neer te pennen wat MF'en betreft, here it comes:
Het is geen exacte wetenschap, maar hier staat hoe LA hun MF heeft geregeld.
  1. Je zet je online preferences op een dag of 10. Die global_prefs.xml aanpassen had weinig zin, aangezien je bij elke Update de preferences van de website ophaalt.
  2. Je laat je bak een dag grazen en je zal per update normaal meer WU's binnenkrijgen.. Voor je je bak in spaarstand duwt, kan je nog even handmatig updaten. (tabblad Projects > Update)
  3. Je smijt je bak in spaarstand als volgt:
    Commands > 'Run always' (duh)
    Commands > 'Network Activity Suspended' (duh)
  4. Je wacht af en laat je WU's crunchen. Ik had zelf nog een manier om nieuwe WU's op te halen zonder er oude te versturen en dat was gewoon met dezelfde instellingen 1x per dag handmatig 'Update' klikken. Zo werden WU's opgehaald (sommige wel, sommige niet) zonder afgewerkte te versturen.
    De afgewerkte krijgen de status 'Uploading' en als je dan je Network Activity op 'Always Available' zet, zal de status naar Ready To Report gaan en zullen de WU's verstuurd worden bij de volgende (meestal handmatige 'Update')
Afbeeldingslocatie: http://img453.imageshack.us/img453/342/boinc9nu.jpg


Bij vragen/opmerkingen: SHOOT!

[ Voor 38% gewijzigd door ScSi op 23-12-2005 12:01 ]


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Xaverius
  • Registratie: Juni 2001
  • Laatst online: 09:03

Xaverius

Ultraloper - korte dan... 😎

Ja, je plaatje linkt hier niet :(

[ Voor 4% gewijzigd door Xaverius op 23-12-2005 11:00 ]

https://smashrun.com/hans.vandermeer/invite
Stop de verwelking!
COVID19 resultaat: 30% meer hardgelopen dan ooit, langste afstand van 52 -> 69km gebracht


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Kristof
  • Registratie: Januari 2002
  • Laatst online: 12-03 14:08

Kristof

is een Belgisch product

Topicstarter
Link naar het plaatje is http://img453.imageshack.us/img453/342/boinc9nu.jpg

Alvast bedankt SCSI _/-\o_

Heb idd nog een vraagje:
1/ Met je stap4, als je op update klikt, dan gaat hij toch jobs versturen die klaar zijn, niet?
2/ In je plaatje zie ik dat je aanmerkingen hebt gemaakt met groen, rood en blauw. Misschien even wat meer toelichten, want is me niet echt duidelijk wat je ermee bedoelt...

"You can get more with a kind word and a gun than you can with a kind word alone." - Al Capone


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • MetalfanBlackness
  • Registratie: Oktober 2001
  • Niet online

MetalfanBlackness

♥ PV & SB ♥

Solarboiler: Top Senz 200 Nero-3 ⣿⣿ Photovoltaics: 9x LG 320N1K-A5, SE 3000H


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • ScSi
  • Registratie: Oktober 2003
  • Laatst online: 19-05 22:14

ScSi

Belg.

Dan knip en plak je eens iets..
Die stap 4 verstuurt niets als je op 'Update' klikt (iig bij mij toch niet met clientversie 4.80) Die haalde nieuwe jobs op zonder der oude te versturen! Maar ik meen dat dat bij anderen dan weer niet lukte. Misschien moet je dat eens proberen met een 3tal afgewerkte wu's en bovenstaande instellingen.
Wat het plaatje betreft:
  • Blauw is om aan te tonen dat als je network activity op suspended staat, de status uploading is ipv ready to report
  • Rood is om aan te tonen dat als je network activity op suspended staat, je sommige jobs niet gedownload krijgt en andere wel (de 'ready to run')
  • Groen is om aan te tonen dat de wu's aan het crunchen zijn
EDIT: post er nog een gekke Belg op hetzelfde moment :)

[ Voor 7% gewijzigd door ScSi op 23-12-2005 12:06 ]


Acties:
  • 0 Henk 'm!

Anoniem: 143153

Kristof schreef op vrijdag 23 december 2005 @ 11:11:
Link naar het plaatje is http://img453.imageshack.us/img453/342/boinc9nu.jpg

Alvast bedankt SCSI _/-\o_

Heb idd nog een vraagje:
1/ Met je stap4, als je op update klikt, dan gaat hij toch jobs versturen die klaar zijn, niet?
2/ In je plaatje zie ik dat je aanmerkingen hebt gemaakt met groen, rood en blauw. Misschien even wat meer toelichten, want is me niet echt duidelijk wat je ermee bedoelt...
Waarschijnlijk wil hij met het plaatje duidelijk maken dat je nieuwe jobs kan downloaden zonder dat er oude geupload worden. Zo interpreteer ik het.

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • chickn
  • Registratie: September 2003
  • Laatst online: 27-11-2024
Ok :)

De "update" die je klikt, bedoel je daarmee de update op je preferencespagina?!

Ik vind namelijk een update-knop bij "view computers", dan op één van de computer-id's en daar dan onderaan een knop met update.. Bedoel je die?! :)

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • ScSi
  • Registratie: Oktober 2003
  • Laatst online: 19-05 22:14

ScSi

Belg.

Ik bedoel de updateknop in de BOINC-manager (lokaal op je pc dus) onder het tabblad 'Projects' en links 'Update' (dat boven 'suspend', 'no new work', 'reset project' en 'detach')

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • chickn
  • Registratie: September 2003
  • Laatst online: 27-11-2024
Ah, ok :) Die had ik nog niet weten te ontdekken, bedankt voor de zeer duidelijke uitleg... :)

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Megaflix
  • Registratie: Oktober 2003
  • Laatst online: 12-03 19:58
nee de Update knop in de Boinc Manager. Ook als je je Boinc Manager op Suspended hebt staan en je drukt dan die Update knop in dan haalt hij nieuwe WU's op, maar alleen als Boinc Manager denkt dat je ze allemaal af kan krijgen. Als je je instellingen op 10.0 dagen laat staan, dan doet hij dat vaak wel. Niet alle WU's die hij binnenhaalt kan hij ook Runnen, een aantal blijven op Downloading staan, maar bij mij was het ongeveer de helft van wat ik binnenhaalde dat hij ze ook kon draaien. Zorg wel dat je Network Activity suspended blijft!

En nee; hij upload niet de oude WU's. Die blijven netjes in je queue staan. Dus: Happy MF'ing.

Acties:
  • 0 Henk 'm!

Anoniem: 86809

Misschien is een aanvulling of een waarschuwing in de FAQ bij Win98(SE) / WinME op z'n plaats:

Er zijn nogal wat issues met de oudere Windowsversies en R@H/Boinc.
Sinds Rosetta 4.81 melden veel WU's op Win98(SE) / WinME machines geen cpu time (en claimen dus geen credits). Dat kwam eerder incidenteel ook voor, maar nu wordt het schijnbaar een echt probleem.
Van het Rosetta forum: hier, hier en hier.

Bij andere Boinc projecten is dat geen probleem vanwege het quorum bij het toekennen van credits. Daar krijg je het gemiddelde aantal credits per wu. Bij Rosetta krijg je echter je geclaimde credits en dat is dus zero, niets, nada!

En verder is er een conflict in settings tussen Boinc en R@H:
Voor Boinc zou de setting 'Leave application in memory' op 'no' gezet moeten worden. Voor Rosetta juist op 'yes'.
In het kort lijkt het er op dat als je Rosetta alleen draait, je de Rosetta setting (yes) kan aanhouden. Als je naast Rosetta ook andere projecten hebt, informeer je je dan eerst goed want bepaalde combinaties werken echt niet (uit deze thread van het Rosetta forum).

Eigenlijk voldoen deze OS-sen helemaal niet aan de systeemeisen van R@H.

[ Voor 9% gewijzigd door Anoniem: 86809 op 24-12-2005 03:09 ]

Pagina: 1