[Advies] TIF > 3D-model software

[Yo-L]

Hoi, voor een vriend van mij, die geneeskunde-onderzoek doet en niet veel ervaring heeft met computers wil ik graag wat advies vragen aan mensen die meer ervaring hebben met video en 3d-model software.

De kwestie is als volgt:
- Van een hoop hersenscans zijn een boel TIF's beschikbaar die na elkaar een model vormen van de hersenen

- Deze TIF's moeten, om een goed beeld te vormen op de website van het betreffende onderzoek, omgezet worden in een model waarop de gebruiker het geheel zelf (met de muis bv.) kan draaien, dus zeg maar een draaiend 3d-model

- Op dit moment hebben we vaste filmpjes, via een programma dat Blaze heet (free-evaluation, dus ook niet fijn); deze filmpjes zijn niet van bijzonder goeie kwaliteit, hoewel ik het vermoeden heb dat dit ook kan liggen aan de kwaliteiten van die vriend van mij (volgens mij kan VirtualDub dit ook trouwens)

Nu is mijn vraag:
- Heeft iemand ervaring met een programma dat in staat is om 3D-modellen (eventueel naar java of iets dergelijks, zoiets heb ik eerder op een website gezien) te produceren vanuit TIF-files die elk een ander perspectief voorstellen?

Hopelijk heeft iemand tips voor mij om een betere website te kunnen maken voor dit onderzoek, zodat mensen over de hele wereld dit kunnen volgen.

[Brothar]

Uiteraard is eerste vereiste: TIFF omzetten naar JPEG.
*.TIF gebruik je dan voor opslag/archief; *.JPG voor publicatie.

Het is misschien nog mooier om, als je een ATI Radeon grafische kaart hebt, eens te kijken naar de demo's en screensavers. En dan denk ik met name aan de screensaver die zeepbellen zwevend laat zien.
Je zou dan de hersen kunnen gaan opbouwen uit een aantal bollen, en daar de kleuren van de desbetreffende posities van de hersen-JPG's op kunnen "transformeren".

[Yo-L]

Brothar schreef op 16 August 2003 @ 23:00:
...

Hmm, dat snap ik niet; zorgt dit er ook voor dat 't makkelijk op een website gepubliceerd kan worden met controle vanuit de gebruiker over het te bekijken gedeelte?

[ Voor 52% gewijzigd door Yo-L op 16-08-2003 23:04 ]

[Yo-L]

Achteraf gezien moet dit bericht misschien wel naar Webdesign & Graphics ipv hier; aangezien het gaat om een vorm van media die op een website zal moeten worden geplaatst... Of niet?

[Arjan]

heb je misschien wat voorbeeldscans ?
dan kan ik eens kijken wat de mogelijkheden zijn

[Yo-L]

Groot schopje


Ik heb wat plaatjes weten te bemachtigen van de betreffende scans:

hier gaat het om; en mijn idee is dus om via muisbewegingen links/rechts-bewegingen te simuleren om het gescande heen; dit moet op een website geplaatst worden, dus liefst in java of flash of iets degelijks...

Iemand een idee waarmee dit zou kunnen?

Scans (verkleind en in JPG, 4 vlak na elkaar):

[Arjan]

Yo-L schreef op 12 december 2003 @ 15:24:
Groot schopje


Ik heb wat plaatjes weten te bemachtigen van de betreffende scans:

hier gaat het om; en mijn idee is dus om via muisbewegingen links/rechts-bewegingen te simuleren om het gescande heen; dit moet op een website geplaatst worden, dus liefst in java of flash of iets degelijks...

Iemand een idee waarmee dit zou kunnen?

Scans (verkleind en in JPG, 4 vlak na elkaar):
[afbeelding]
[afbeelding]
[afbeelding]
[afbeelding]

Ow dat bedoel je, ik dacht dat je het echt over 2d plaatjes had

Dit doe je gewoon in flash, met google is vast wel een tutorial te vinden voor als je niet zo behept bent met flash

[Abbadon]

Ik move 'm toch maar vanuit AV naar W&G

[Yo-L]

Even een followup; met dank voor 't advies flash te gebruiken (op zich wel logisch, maar niet bij nagedacht )

ik heb me verdiept in actionscript en flash dus, en dit is het voorlopige resultaat:

hiero

't Werkt nog niet helemaal naar behoren, maar we boeken vooruitgang
(overigens wel lastig, de file is nu 2 mb; maar de kwaliteit heb ik wel een stuk achteruit moeten schroeven, ik moet nog iets bedenken waardoor je in kunt zoomen op een betere kwaliteit plaatje)

[flashin]

wooaw mooi .. alleen ff proberen de knop wat langer 'vast' te laten houden.. Als je te snel beweegt gaat hij uit het hit-gebied..

wordt wel lastig met hogere kwaliteit/inzoomen, 2mb is al eigenlijk teveel..

[Arjan]

erg mooi inderdaad, maar ik zou proberen om de beweging te linken aan de x-as van de muis als de gebruiker in het scherm klikt en vasthoud, dat werkt wat intuitiever

[alienfruit]

Als het goed kun je wel 3d modellen maken van scans, ik neem aan dat je de scans hebt gemaakt bij sommige MRIs (noem je die dingen zo ) kun je ook een 3d model verkrijgen en opslaan. Ik zal het voor de zekerheid nog eens navragen voor je.

offtopic:
Wat voor onderzoek doe jij ?

[ Voor 72% gewijzigd door alienfruit op 17-12-2003 00:23 ]

[MissingDog]

Het moet ook mogelijk zijn om het zwarte weg te clippen met een bepaalde tolerantie (photoshop), vervolgens de 'slices' achter elkaar te plaatsen in een denkbeeldige kubus (3d pakket), waardoor je een 'volwaardig' 3d object krijgt....dit kan je vervolgens naar shockwave 3d exporten oid vanuit veel pakketten.

(eigen 3D engine in JAVA schrijven kan natuurlijk ook, maar gaat wat meer tijd kosten)

[ Voor 4% gewijzigd door MissingDog op 17-12-2003 00:26 ]

[Yo-L]

alienfruit schreef op 17 december 2003 @ 00:20:
Als het goed kun je wel 3d modellen maken van scans, ik neem aan dat je de scans hebt gemaakt bij sommige MRIs (noem je die dingen zo ) kun je ook een 3d model verkrijgen en opslaan. Ik zal het voor de zekerheid nog eens navragen voor je.

offtopic:
Wat voor onderzoek doe jij ?

Ikzelf doe geen onderzoek, 't is voor 'n vriend van me die geneeskunde studeert (6e jaars ofzo). Wat het precies voorstelt weet ik niet, moet ik nog navragen, maar ik zou voor hem uitzoeken of dit mogelijk was voor een website. Dit antwoord blijf ik je nog schuldig dus.

Ik zal es navragen of er ook een 3d-model beschikbaar is in dit geval, misschien maakt dat het allemaal wat makkelijker.

Met het pannen ben ik nog bezig, denk inderdaad dat ik het over de x-as ga doen ipv op deze manier, het werkt nog niet echt fijn zo...

[hobbit_be]

van 2d naar 3d met slices is een uitgebreid onderwerp.

toevallig heb ik vroeger als kunstproject er erg veel mee kunnen werken.

screens en video:
http://www.vertexcloud.com/geom_images.html

technische info:
http://www.onnos.com/geoprogram.html

shockwave 3D model interactie (zeer cpu intensief btw) (ook documentatie)
http://www.onnos.com/MILIA2002
(volg de link en make sure to have shockwave installed)

edit: en nu nog wat nuttige links

http://astronomy.swin.edu.au/~pbourke/opengl/glvol/
http://astronomy.swin.edu...odelling/cortex/impl.html
http://astronomy.swin.edu.au/~pbourke/modelling/cortex/

[ Voor 21% gewijzigd door hobbit_be op 17-12-2003 12:20 ]

[bredend]

Bij mij op de opleiding zijn een stel lui bezig om hetzelfde te doen als afstudeerproject. Verschil is dat zij de data direct van de MRI scanner krijgen, en met zelfgeschreven filters en renderengine de boel renderen. Ze deden ook iets met voxels; pixels maar dan in 3d.

Als je echt geinteresseerd ben moet je maar ff mailen naar iemand die aan de HvU bij de opleiding Mediatechnologie werkt

[Verwijderd]

Check eens toxi`s voxelspace raymarcher spul;
http://www.toxi.co.uk/p5/