Emboss in Opal2 deployen

[speedzor]

Goeiedag

Ik ben momenteel bezig met verscheidene BioInformatica programmas werkend te krijgen op een Ubuntu 11.04.
Op een lokale server heb ik TomCat 5.5 geinstalleerd, met daarop het programma Opal2.
Nu wil ik graag een programma genaamd Emboss "deployen" in Opal2 zodat het van daaruit aanroepbaar is.

Het probleem waar ik bij aanloop is dat ik niet compleet zeker ben hoe dit moet.
Via een tutorial powerpoint heb ik geprobeerd om de OpenBabel service toe te voegen aan opal en dit is ook grotendeels gelukt. Ik zie de service in het overzicht verschijnen (zie hieronder).

code:

And now... Some Services

    * AdminService (wsdl)
          o AdminService 
    * BabelServicePort (wsdl)
          o getAppMetadata
          o getAppConfig
          o getSystemInfo
          o launchJob
          o launchJobBlocking
          o queryStatus
          o getJobStatistics
          o getOutputs
          o getOutputAsBase64ByName
          o destroy 
    * Version (wsdl)
          o getVersion

Echter, wanneer ik dit programma wil gebruiken vanaf een andere computer, dan geeft hij permission denied foutmeldingen. Ik heb de ROOT map 777 permissies gegeven, maar omdat de host localhost is, zal dit waarschijnlijk de foutmelding veroorzaken.
Ik heb geprobeerd de host te veranderen dmv een alias in server.xml en toen dat niet lukte een tweede host aangemaakt en de DefaultHost ingesteld op het IP van deze computer, maar dat werkte ook niet. Ik kon wel naar http://ip:port surfen, maar van zodra ik dan naar de Opal2 directory ging en daar de Babel applicatie wou openen, dan zag ik dat hij nog steeds naar http://localhost:8080 linkte.
Ik heb de hele computer afgezocht naar configuratiefiles waar naar localhost gelinked wordt, talloze regels veranderd, maar toch wilt het niet werken.

Dus: Iemand enig idee waar mijn fout zit bij het installeren van Babel?
Bijkomend: Om de één of andere reden zat babel al in configs/babel_config.xml.
Het programma dat ik wil installeren, emboss, zit daar niet in.
Het lijkt me sterk dat nog niemand dit heeft gevraagd op het internet, maar ik lijkt het maar niet te vinden.
Heeft iemand hier misschien weet van?
Voor ikzelf ga beginnen prutsen met die configs, kunnen jullie me misschien verder helpen

Alvast bedankt
Speedzor

[CAPSLOCK2000]

Ik ben totaal niet bekend met Opal2 dus daar kan ik je niet mee helpen.
Wel kan ik je vertellen dat die 777 permissies zeker niet het probleem zijn. 777 is gevaarlijk, doe het niet, het is eigenlijk nooit nodig.

Kun je een beetje uitweiden over die foutmeldingen die je krijgt. Waar zie je die? In je browser? In je logs? Welke? Wat is de foutmelding _precies_?

los idee: staat de hostname + ip van je server in /etc/hosts (op die server zelf)?

[speedzor]

Bedankt voor de reactie, maar de plek waar ik momenteel werk (vakantiejob) heeft me een andere taak gegeven enkele dagen geleden waardoor ik dit topic even vergeten was

Ik heb het probleem niet kunnen oplossen maar goed, het was ook geen enorme noodzakelijkheid voor hen.

Toch bedankt voor de poging!