[Project Achtergrond] Malaria Control

Pagina: 1
Acties:

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Bio1ogics
  • Registratie: Juni 2004
  • Laatst online: 22:05
Introductie

Beste graskauwers,
Het leek me een aardig idee om zo af en toe eens een DC-project te pakken en eens wat dieper in te gaan op de achtergrond ervan, e.e.a. op een niveau wat mij te gedetailleerd lijkt voor de DPC-wiki (die trouwens een mooie entry heeft voor Malaria control. Grote dank @ Xaverius _/-\o_ ). Het is momenteel geen ‘officieel’ DPC project, maar het doet wel mee in de DC-vault en heeft momenteel 70 DPC’ers, waarvan er zo’n 6 actief crunchen. Momenteel staat DPC op plaats 60.
Ik ben van plan dit voor andere projecten ook te doen (zonder een vast schema btw :P ), en als je het leuk vindt om iets dergelijks te doen, be my guest. Dat het een lange en succesvolle reeks moge worden!


Waarom Malaria Control?

Ik werk al een tijdje op een universiteit en kom dan vaak bij wetenschappelijke praatjes. Een ervan ging over malaria als ziekte en de biologische werking van deze parasiet. Naast mijn wetenschappelijke belangstelling bleef een opmerking van de spreker me behoorlijk dwars zitten; Stomweg het feit het probleem zich voornamelijk NIET in de Westerse wereld voordoet, voorkomt grootschalige investeringen in onderzoek naar medicijnen en vaccinatie-mogelijkheden. Een korte blik op de verspreidingskaart laat duidelijk zien waar de problemen zijn.

Afbeeldingslocatie: http://www.kennislink.nl/upload/91155_962_1033732015282-malariamap3.jpg (klik voor wereldkaart)


De jaarlijkse incidentie van malaria wordt geschat op driehonderd tot vijfhonderd miljoen gevallen wereldwijd. Er overlijden naar schatting 1,5 tot 2,7 miljoen mensen per jaar aan malaria, het merendeel daarvan zijn Afrikaanse kinderen onder de vijf jaar. Bron

Ter vergelijk: In 2008 stierven er tussen de 1,7 en 2,4 miljoen mensen aan AIDS.
Precieze cijfers zijn moeilijk te vinden en ook lastig te vergelijken, maar neem van me aan dat er heul veul meer centjes in AIDS-research gestopt is in vergelijking met malaria.
Don’t get me wrong, van mij mag iedereen die ergens ziek van is, ervan genezen. Maar gezien bovenstaande, heb ik altijd een speciale interesse gehad voor het onderzoek naar malaria. Vandaar dat mijn eerste keuze voor dit Malaria Control project.


Plasmodium falciparum en epidemiologie

Die eerste 2, da's de moeilijke naam voor de malaria parasiet, die via een muggebeet in het lichaam terecht kan komen. Daar worden via een tussenstop in de lever, de rode bloedcellen ge-infecteerd. Dat is op zich al niet best, maar het gaat vooral mis omdat die bloedcellen in de zeer kleine bloedvaten van verschillende organen vastlopen (met name hersenen en nieren). Daar komt natuurlijk allerlei ellende van, die ik hier niet 1 voor 1 ga bespreken... Verhelderende plaatjes zijn bij de lokale goegles op te halen.


Jan Sneeuw

Wie? :? . Misschien beter bekend als John Snow. Geen paniek, het verband wordt zo duidelijk. John Snow is beroemd geworden door het hengsel van een waterpomp te verwijderen. 7(8)7

Deze Engelsman ontdekte de oorzaak van een cholera-epidemie in de Broad Street van het Londense Soho in 1854. Door het ondervragen van cholera-patiënten en het in kaart brengen van de ziektegevallen concludeerde hij dat het water uit de lokale pomp de infectiehaard van de ziekte moest zijn. Hij maakte een eind aan de epidemie door het hengsel van de pomp te halen, zodat mensen het besmette water niet meer konden drinken. En dit was dus nog in de tijd dat nog niemand wist dat cholera door een bacterie veroorzaakt werd. Da's best slim :Y

Hiermee is John Snow de grondlegger voor de epidemiologie (dit vereist oefening met uitspreken en het is ook een fijne voor scrabble).
Wikipedia: Epidemiologie zegt: “De epidemiologie houdt zich dus niet bezig met de diagnose en behandeling, maar probeert uit te zoeken wie er door een ziekte getroffen worden en welke factoren dat in de hand werken of juist niet (leeftijd, geslacht, besmettingsbronnen, voeding, etc.). Statistische analyses van vaak grote databestanden zijn daarbij een belangrijk hulpmiddel.”

Aha! De gemiddelde DPC’er ziet het nu wel aankomen. Om meer te weten te komen over de epidemiologie van malaria hebben The Swiss Tropical Institute en Africa@home, die weer uit diverse partners bestaat een DC-project opgezet, Malaria Control Net.


Het DC gedeelte

Belangrijkste input voor een epidemiologische studie is de zogenaamde ‘field-data’, waarmee allerlei zaken worden gecatologiseerd die ter plekke spelen. Denk bv aan de afstand tot een main road of een dorp, aanwezigheid van waterbron, welke en hoeveel dieren, gezinssamenstelling, weer-seizoen, eerdere besmettingen etc etc. Het is al een (wiskundige) kunst op zich om gecorreleerde data te vinden, gewichten te geven aan onderdelen en het bepalen welke data betrouwbaar genoeg is om mee te nemen.

Vervolgens is het mogelijk om een model te bouwen, en te bepalen of en hoe goed de actuele data ‘fits the model’. Wat Malaria Control probeert, is het nagaan van de morbiteit, verspreiding en mortaliteit van malaria in een gesimuleerde bevolking, waarbij de field-data als achtergrond wordt gebruikt om die bevolking zo ‘levensecht’ mogelijk te maken. Denk aan SIMS, maar dan beter. Vervolgens wordt een malaria-epidemie gesimuleerd met diverse mogelijke scenarios. Mogelijke onderdelen zijn demografisch, zoals het medische systeem in een land, de maatregelen die de regering normaal gesproken neemt, de seizoensgebonden manier waarop malaria kan worden overgedragen. De kern van de software houdt rekening met de verschillende stadia van de malaria-overdracht cyclus. Elk onderdeel van de modellen wordt ontwikkeld door het vergelijken van de voorspellingen van een heel scala aan scenarios uit heel Afrika met de echte malaria field data.

Uiteindelijk kunnen dus de bekende uitbraken vergeleken worden met gesimuleerde, maar mogelijk ook andersom! Dat betekent dat men bij een uitbraak al diverse mogelijke scenarios kan berekenen die de besmettingen kunnen beperken, of hoe zo efficiënt mogelijk medicijnen in te zetten, de hoeveelheid ervan, dosis, etc.


Conclusie

Net als vele andere projecten heeft Malaria Control ook een duidelijk maatschappelijk nut, en kan potentieel het leven van veel mensen op zijn minst verbeteren. Waarom mijns inziens dit project een extra duwtje aandacht kan gebruiken, is vanwege het feit dat de meeste mensen die er aan lijden niet bij machte zijn om er veel tijd, onderzoek en stomweg geld in te steken om aan oplossingen te werken.
Geïnteresseerden kunnen in de wiki de aanwijzingen vinden om dit project te steunen.


offtopic:
er komt mogelijk nog een uitsmijter aan, maar dat wordt vanzelf duidelijk. Serieus

"Results! Why, man, I have gotten a lot of results. I know several thousand things that won't work." Thomas Edison


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • KuuKe
  • Registratie: Juli 2001
  • Niet online

KuuKe

Moderator DPC

professioneel gifmenger

* KuuKe aait zijn naamgenoot: mooi stukkie werk man!

Kuuke's Sterrenbeelden | 英俊的兔子


Acties:
  • 0 Henk 'm!

Anoniem: 57158

Goed initiatief :D

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • iisschots
  • Registratie: November 2002
  • Laatst online: 31-05 15:04
En inmiddels ook op WDO: http://www.dutchpowercows.org/doc.php?id=536

Een erg mooi stuk, dit maakt de reden van projecten mee duidelijk :)

Hackerspace in Friesland | www.frack.nl | Bezig met opzetten, help mee!


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • DigiK-oz
  • Registratie: December 2001
  • Laatst online: 06-06 20:34
Mooi duidelijk verhaal _/-\o_

Mag misschien wel iets prominenter op de homepage van WDO gelinkt worden, dit verhaal geeft eventuele passanten daar in één klap duidelijkheid over waarom we aan DC meedoen!

Whatever


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Xaverius
  • Registratie: Juni 2001
  • Laatst online: 06-06 21:13

Xaverius

Ultraloper - korte dan... 😎

Mooi verhaal Bio1ogics, daar ben je goed bezig mee geweest.
Teveel eer, ik heb gewoon wat interessante informatie van de organisatie in het nederlands gezet en gestructureerd voor de wiki. :)

Wellicht dat het allemaal nog beter kan, de wiki kan aangevuld/aangepast worden door mensen met betere/meer informatie. Dus... ;)

https://smashrun.com/hans.vandermeer/invite
Stop de verwelking!
COVID19 resultaat: 30% meer hardgelopen dan ooit, langste afstand van 52 -> 69km gebracht


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • iisschots
  • Registratie: November 2002
  • Laatst online: 31-05 15:04
Ik heb het een wat prominentere plaats gegeven op WDO. Het zal nu meer opvallen :)

Hackerspace in Friesland | www.frack.nl | Bezig met opzetten, help mee!


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Killerbert
  • Registratie: September 2007
  • Laatst online: 13-05 12:24
Dit is een duidelijk verhaal :)

mooi project :Y

Op een dag drink je geen bier meer maar drink je Grolsch... My specs


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Cow_tipping
  • Registratie: Oktober 2001
  • Laatst online: 18-05 19:43

Cow_tipping

On the run for D.B.!

Het valt hier ook prima op.
Goed idee Biologics! Leuk verhaal om te lezen op deze manier en zeker een manier om mensen over te halen om de medische projecten te helpen.
Lijkt me ook een prima verhaal om buiten de /5 community te publiceren.

“The first principle is that you must not fool yourself, and you are the easiest person to fool.“


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Bio1ogics
  • Registratie: Juni 2004
  • Laatst online: 22:05
Dank voor de hulde O+

Niet dat ik er nu al tijd voor heb, maar ik wil de volgende keer een meer wiskundig project eens doorlichten.
* Bio1ogics gaat zijn Pythagoras dan maar weer eens afstoffen

"Results! Why, man, I have gotten a lot of results. I know several thousand things that won't work." Thomas Edison


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • metalmania_666
  • Registratie: Mei 2002
  • Laatst online: 03-06 22:25
Dat heb je mooi geschreven Bio1ogics

Ik ga maar eens mijn bijdrage leveren door de software te downloaden EN te gebruiken natuurlijk

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Bartske
  • Registratie: November 2007
  • Laatst online: 21:09
Even nog een aanvulling op de kop Plasmodium falciparum en epidemiologie.

Plasmodium falciparum is de naam van de bekenste malaria parasiet, er zijn er echter 4 (gevaarlijk voor de mens). Dit zijn alle soorten:

* Plasmodium vivax
* Plasmodium ovale
* Plasmodium malariae
* Plasmodium falciparum

Falciparum de bekenste (en gevaarlijkste). Vivax de meest voorkomende (en tevens 'goedaardig').

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Bio1ogics
  • Registratie: Juni 2004
  • Laatst online: 22:05
Bartske schreef op maandag 14 december 2009 @ 20:40:
Even nog een aanvulling op de kop Plasmodium falciparum en epidemiologie.

Plasmodium falciparum is de naam van de bekenste malaria parasiet, er zijn er echter 4 (gevaarlijk voor de mens). Dit zijn alle soorten:

* Plasmodium vivax
* Plasmodium ovale
* Plasmodium malariae
* Plasmodium falciparum

Falciparum de bekenste (en gevaarlijkste). Vivax de meest voorkomende (en tevens 'goedaardig').
Dank voor de aanvulling; had het ook gelezen, maar was in tweestrijd of ik het in mijn verhaaltje zou meenemen.
Jouw uitleg (de gevaarlijkste) gaf de doorslag om alleen die te benoemen.

"Results! Why, man, I have gotten a lot of results. I know several thousand things that won't work." Thomas Edison


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Christian_Ku
  • Registratie: Maart 2005
  • Laatst online: 05-06 13:24
Bartske schreef op maandag 14 december 2009 @ 20:40:
Vivax de meest voorkomende (en tevens 'goedaardig').
Sorry?

Neem aan dat de TS dit specifieke stukje niet opneemt in zijn topic start.

Vivax en Falciparum vertegenwoordigen ca. 95% van de malaria gevallen in de wereld. Ondanks dat vivax inderdaad een mildere vorm is gaan er nog steeds vele mensen aan dood. Noem het maar goedaardig. Het komt voornamelijk voor in Z.O.-Azie en latijns Amerika en kleine delen van Afrika. Wikipedia geeft helaas een beetje ambivalente uitleg mbt de dodelijkheid van deze parasiet, wel is duidelijk dat het de nummer 2 is en dus zeker niet 'goedaardig'.

P. falciparum
P. Vivax
P. Ovale
P. malariae

Criticism is prejudice made plausible.


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Bartske
  • Registratie: November 2007
  • Laatst online: 21:09
Christian_Ku schreef op dinsdag 15 december 2009 @ 11:40:
[...]


Sorry?

Neem aan dat de TS dit specifieke stukje niet opneemt in zijn topic start.

Vivax en Falciparum vertegenwoordigen ca. 95% van de malaria gevallen in de wereld. Ondanks dat vivax inderdaad een mildere vorm is gaan er nog steeds vele mensen aan dood. Noem het maar goedaardig. Het komt voornamelijk voor in Z.O.-Azie en latijns Amerika en kleine delen van Afrika. Wikipedia geeft helaas een beetje ambivalente uitleg mbt de dodelijkheid van deze parasiet, wel is duidelijk dat het de nummer 2 is en dus zeker niet 'goedaardig'.

P. falciparum
P. Vivax
P. Ovale
P. malariae
Jah, het woord 'goedaardig' is wat te overdreven denk ik, aangezien er wel degelijk slachtoffers vallen. Maar feit blijft dat de falciparum vele malen gevaarlijker is een een infectie daarmee een stuk sneller ernstige symptomen met zich mee brengt. Om het goedaardig te noemen is inderdaad toch net iets te soft, aangezien er wel degelijk slachtoffers bij vallen.

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Pixeltje
  • Registratie: November 2005
  • Laatst online: 22:14

Pixeltje

Woo-woohoo!

Xaverius schreef op dinsdag 15 december 2009 @ 17:44:
Jongens, kan het even on-topic. Het zou hier over de achtergrond van malaria en Malariacontrol.net moeten gaan. Slowchat kan graag ergens anders. :)

[...]
Point taken, excuus;)

In dat licht zal ik mijn keuze om mee te doen even onderbouwen:

De cijfers die in de startpost genoemd worden, met betrekking tot sterftecijfers etc, verbazen me. Ik dacht dat Malaria lang en breed teruggebracht was tot een 'relatief klein' probleem. Over Aids hoor je veel meer, daar wordt constant voor gecollecteerd en op andere manieren aandacht aan besteed. Over Malaria hoor je vrijwel niets, dus toen ik die cijfers zag schrok ik best wel.

Heb daarom 2 computers aan het werk gezet (100% CPU), de stroomrekening hier is goed te betalen, en als ik op deze manier bij kan dragen aan de voorspelling van de ziekte, of het voorkomen ervan, is me dat best een hogere energierekening waard:)

And I begged Angel of the Lord what are these tortured screams? And the angel said unto me; These are the cries of the carrots, the cries of the carrots! You see, Reverend Maynard, Tomorrow is harvest day and to them it is the holocaust


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • KuuKe
  • Registratie: Juli 2001
  • Niet online

KuuKe

Moderator DPC

professioneel gifmenger

Modbreak:Voor vragen over hoe de de client goed instelt en hoe je mee kan doen met de Dutch Power Cows wil ik jullie verwijzen naar dit topic.

Meldingen dat je mee gaat doen zijn van harte welkom maar doe die s.v.p. niet in dit topic maar ga hier voor naar de stats-topic

S.v.p. dit topic alleen gebruiken voor het praten over malaria zelf.

Kuuke's Sterrenbeelden | 英俊的兔子


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • iisschots
  • Registratie: November 2002
  • Laatst online: 31-05 15:04
Nav kuuke zijn post heb ik even opruiming gehouden. De reacties zijn hier te vinden: [offtopic] Malaria Control

Lees kuuke zijn post even waar jullie terecht kunnen voor vragen over de instalatie of wanneer je gezellig kletsen over het project.

Hackerspace in Friesland | www.frack.nl | Bezig met opzetten, help mee!


  • Bio1ogics
  • Registratie: Juni 2004
  • Laatst online: 22:05
Pixeltje schreef op dinsdag 15 december 2009 @ 18:12:
[...]


Point taken, excuus;)

In dat licht zal ik mijn keuze om mee te doen even onderbouwen:

De cijfers die in de startpost genoemd worden, met betrekking tot sterftecijfers etc, verbazen me. Ik dacht dat Malaria lang en breed teruggebracht was tot een 'relatief klein' probleem. Over Aids hoor je veel meer, daar wordt constant voor gecollecteerd en op andere manieren aandacht aan besteed. Over Malaria hoor je vrijwel niets, dus toen ik die cijfers zag schrok ik best wel.

Heb daarom 2 computers aan het werk gezet (100% CPU), de stroomrekening hier is goed te betalen, en als ik op deze manier bij kan dragen aan de voorspelling van de ziekte, of het voorkomen ervan, is me dat best een hogere energierekening waard:)
Dat was voor mij ook de eye-opener; dat er feitelijk zoveel mensen geinfecteerd zijn en raken, zonder dat er een enorme publieke 'awareness' (houdt zich aanbevolen voor een goed Nederlands alternatief) voor malaria is.
Op de 3FM-serious request site melden ze dat er 247 miljoen besmettingen waren in 2006. Ik weet de bron niet van dat aantal, maar ik vind dat echt f*cking veel.

en ach die stroomrekening; in deze koude tijden komt die extra PC-warmte goed uit!

"Results! Why, man, I have gotten a lot of results. I know several thousand things that won't work." Thomas Edison


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Marcelloz
  • Registratie: Juli 2002
  • Laatst online: 06-06 21:41

Marcelloz

IT dude with a beard

Pixeltje schreef op dinsdag 15 december 2009 @ 18:12:
[...]

...

Heb daarom 2 computers aan het werk gezet (100% CPU), de stroomrekening hier is goed te betalen, en als ik op deze manier bij kan dragen aan de voorspelling van de ziekte, of het voorkomen ervan, is me dat best een hogere energierekening waard:)
Hier met een Watt meter even nagemeten op 3 computers, maar boinc draaien kost 20% meer stroom. Dus 120Watt ipv 100Watt en 300Watt ipv 250Watt. Valt me erg mee.

Verder volgend jaar gemiddeld 23% prijsdaling in stroomprijs, dus na 1 januari merk je er niks van in je portemonnee :)

There are better things in life than alcohol, but alcohol makes up for not having them.


  • Cow_tipping
  • Registratie: Oktober 2001
  • Laatst online: 18-05 19:43

Cow_tipping

On the run for D.B.!

Sorry, kon het niet laten.

Afbeeldingslocatie: http://i1.kym-cdn.com/photos/images/facebook/000/527/985/04f.gif

“The first principle is that you must not fool yourself, and you are the easiest person to fool.“


Anoniem: 321707

Aha thread necromancing (of oude koeien...). ;)

Maar goed dit project loopt al jaren, vraagje voor de insiders: Welke concrete resultaten heeft het opgeleverd?

  • Witlof
  • Registratie: Mei 2000
  • Laatst online: 20:10
Nou, wij hebben dik 10M aan punten en staan bovenaan de DPC overall lijst :P
Pagina: 1