Sorry lijkt misschien een dubbelpost maar die eerste is "erg brak", dus hier nog maar eens..
Hoi, nu de DPC dan ook eindelijk andere distributed computerprojecten ondersteunen (dwz op papier) is Folding@home misschien ook wel leuk, zo niet een van de leukste om ook te gaan ondersteunen.
Doel van Folding@home is het bepalen van de ruimtelijke structuur van een eiwit uit genetische code.
voor degene die biologie hebben gehad:
DNA -> m-RNA -> ribosomen + t-RNA -> keten van aminozuren -> "opvouwen" (folding) tot eiwit en dit laatste wordt dan berekend
Voor degene die geen biologie hebben gehad:
In onze genen ligt de broncode van ons zijn.
Deze genen bestaan uit DNA.
Op dit DNA ligt een code die correspondeerd met een bepaald eiwit.
Dit eiwit kan van alles zijn maar de functionaliteit van dit hangt samen met de ruimtelijke opbouw van dit eiwit.
Dat kan uiteenlopen van een lange streng tot een streng die behoorlijk "in de knoop zit" middels intramoleculaire bruggen (bv H-brug en zwavelbruggen).
Het uitlezen van de genetische code is onlangs voltooid, dus zou je kunnen redeneren: dan weten ze ook welke eiwitten er zijn en wat die doen en alles is zo goed als bekend.
Ja zo ongeveer wel maar het probleem is dus dat een eiwit zich in theorie wel op bv 10^12 verschillende manieren kan opvouwen.
Tot en met nu toe wordt de ruimtelijke opbouw herleid door het bestralen van een eiwit kristal met rontgen, dan kijken naar de difractiepatronen en twee jaar terugrekenen tot de structuur die dat patroon heeft veroorzaakt.
Bekend is volgens welke regels eiwitten zich kunnen opvouwen dus je zou het ook kunnen simuleren. Maar er zijn dus gruwelijk veel mogelijke "vouwen" en daar is dus fuckin' veel computerkracht voor nodig.
Does Distributed computing ring a bell?
http://www.stanford.edu/group/pandegroup/Cosm/
De "benefits" lopen uiteen tot het begrijpen van ziekten en het maken gericht maken van medicijnen daartegen. En nog meer wat ik zo snel niet kan bedenken.
Ik kan zelf m'n seti@home teampje natuurlijk niet verlaten maar ik ga m'n "k6-je voor d'rbij" toch wel ff mobiliseren.
Retenuttig non-profit project, tis maar een ideetje voor de DPC (tenminste, jullie seti team loopt niet echt)
Hoi, nu de DPC dan ook eindelijk andere distributed computerprojecten ondersteunen (dwz op papier) is Folding@home misschien ook wel leuk, zo niet een van de leukste om ook te gaan ondersteunen.
Doel van Folding@home is het bepalen van de ruimtelijke structuur van een eiwit uit genetische code.
voor degene die biologie hebben gehad:
DNA -> m-RNA -> ribosomen + t-RNA -> keten van aminozuren -> "opvouwen" (folding) tot eiwit en dit laatste wordt dan berekend
Voor degene die geen biologie hebben gehad:
In onze genen ligt de broncode van ons zijn.
Deze genen bestaan uit DNA.
Op dit DNA ligt een code die correspondeerd met een bepaald eiwit.
Dit eiwit kan van alles zijn maar de functionaliteit van dit hangt samen met de ruimtelijke opbouw van dit eiwit.
Dat kan uiteenlopen van een lange streng tot een streng die behoorlijk "in de knoop zit" middels intramoleculaire bruggen (bv H-brug en zwavelbruggen).
Het uitlezen van de genetische code is onlangs voltooid, dus zou je kunnen redeneren: dan weten ze ook welke eiwitten er zijn en wat die doen en alles is zo goed als bekend.
Ja zo ongeveer wel maar het probleem is dus dat een eiwit zich in theorie wel op bv 10^12 verschillende manieren kan opvouwen.
Tot en met nu toe wordt de ruimtelijke opbouw herleid door het bestralen van een eiwit kristal met rontgen, dan kijken naar de difractiepatronen en twee jaar terugrekenen tot de structuur die dat patroon heeft veroorzaakt.
Bekend is volgens welke regels eiwitten zich kunnen opvouwen dus je zou het ook kunnen simuleren. Maar er zijn dus gruwelijk veel mogelijke "vouwen" en daar is dus fuckin' veel computerkracht voor nodig.
Does Distributed computing ring a bell?
http://www.stanford.edu/group/pandegroup/Cosm/
De "benefits" lopen uiteen tot het begrijpen van ziekten en het maken gericht maken van medicijnen daartegen. En nog meer wat ik zo snel niet kan bedenken.
Ik kan zelf m'n seti@home teampje natuurlijk niet verlaten maar ik ga m'n "k6-je voor d'rbij" toch wel ff mobiliseren.
Retenuttig non-profit project, tis maar een ideetje voor de DPC (tenminste, jullie seti team loopt niet echt)
"Oh no! it's mega-maid! She's gone from suck to blow!"