Folding@home ook iets voor DPC

Pagina: 1
Acties:
  • 470 views sinds 30-01-2008
  • Reageer

Onderwerpen


  • meibok
  • Registratie: Februari 2000
  • Laatst online: 16-10-2020

meibok

a-huh, huhuhuh, huh-huh

Topicstarter
Sorry lijkt misschien een dubbelpost maar die eerste is "erg brak", dus hier nog maar eens..

Hoi, nu de DPC dan ook eindelijk andere distributed computerprojecten ondersteunen (dwz op papier) is Folding@home misschien ook wel leuk, zo niet een van de leukste om ook te gaan ondersteunen.

Doel van Folding@home is het bepalen van de ruimtelijke structuur van een eiwit uit genetische code.

voor degene die biologie hebben gehad:
DNA -> m-RNA -> ribosomen + t-RNA -> keten van aminozuren -> "opvouwen" (folding) tot eiwit en dit laatste wordt dan berekend

Voor degene die geen biologie hebben gehad:
In onze genen ligt de broncode van ons zijn.
Deze genen bestaan uit DNA.
Op dit DNA ligt een code die correspondeerd met een bepaald eiwit.
Dit eiwit kan van alles zijn maar de functionaliteit van dit hangt samen met de ruimtelijke opbouw van dit eiwit.

Dat kan uiteenlopen van een lange streng tot een streng die behoorlijk "in de knoop zit" middels intramoleculaire bruggen (bv H-brug en zwavelbruggen).

Het uitlezen van de genetische code is onlangs voltooid, dus zou je kunnen redeneren: dan weten ze ook welke eiwitten er zijn en wat die doen en alles is zo goed als bekend.

Ja zo ongeveer wel maar het probleem is dus dat een eiwit zich in theorie wel op bv 10^12 verschillende manieren kan opvouwen.

Tot en met nu toe wordt de ruimtelijke opbouw herleid door het bestralen van een eiwit kristal met rontgen, dan kijken naar de difractiepatronen en twee jaar terugrekenen tot de structuur die dat patroon heeft veroorzaakt.

Bekend is volgens welke regels eiwitten zich kunnen opvouwen dus je zou het ook kunnen simuleren. Maar er zijn dus gruwelijk veel mogelijke "vouwen" en daar is dus fuckin' veel computerkracht voor nodig.

Does Distributed computing ring a bell?

http://www.stanford.edu/group/pandegroup/Cosm/

De "benefits" lopen uiteen tot het begrijpen van ziekten en het maken gericht maken van medicijnen daartegen. En nog meer wat ik zo snel niet kan bedenken.

Ik kan zelf m'n seti@home teampje natuurlijk niet verlaten maar ik ga m'n "k6-je voor d'rbij" toch wel ff mobiliseren.

Retenuttig non-profit project, tis maar een ideetje voor de DPC (tenminste, jullie seti team loopt niet echt)

"Oh no! it's mega-maid! She's gone from suck to blow!"


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Sequence
  • Registratie: Maart 2000
  • Laatst online: 27-05-2024

Sequence

Online marketing

ik ben zelf sinds vanmiddag aan het kijken of het wat is.. de client is hiero iig stabiel, maar helaas enkel als dos-box ;(

er is al een team aangemaakt door Dutchman:

Dutch_Power_Cows met id-nr. 1651007169 ( <-- ja lang nummer :?)

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • meibok
  • Registratie: Februari 2000
  • Laatst online: 16-10-2020

meibok

a-huh, huhuhuh, huh-huh

Topicstarter
Echt? ik kan ze niet vinden?
Kun je een link posten aub?
Niet dat ik nu direct van plan ben DPC lid te worden gezien alle gepasseerde afzeikacties tegen seti@homers, maar ik houd mezelf voor dat dat altijd maar "enkele" niet beterwetende figuren zijn geweest en DPC in het algemeen wel degelijk roelt.

"Oh no! it's mega-maid! She's gone from suck to blow!"


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Dutchman!
  • Registratie: Januari 2000
  • Laatst online: 18-09 16:55
uuuuuh sequence folding@home != genome@home, hoewel de projecten erg op elkaar lijken.

edit:
genome is trouwens hier te vinden: http://genomeathome.stanford.edu/

We spend our years as a tale that is told


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • DSmarty
  • Registratie: Februari 2000
  • Niet online
Op vrijdag 23 februari 2001 00:56 schreef meibok het volgende:
Echt? ik kan ze niet vinden?
Kun je een link posten aub?
Niet dat ik nu direct van plan ben DPC lid te worden gezien alle gepasseerde afzeikacties tegen seti@homers, maar ik houd mezelf voor dat dat altijd maar "enkele" niet beterwetende figuren zijn geweest en DPC in het algemeen wel degelijk roelt.
Dat gezever over SeTi@Home ging meer over het feit OF wij uberhaupt andere projecten gaan ondersteunen en omdat SeTi wetenschappelijk nogal omstreden is, een geheel andere situatie als Folding@home dus.
Wat mij betreft staan wij hier wel open voor.

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Sequence
  • Registratie: Maart 2000
  • Laatst online: 27-05-2024

Sequence

Online marketing

whoops, sorry dat ik effe niet zat op te letten ;)

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • meibok
  • Registratie: Februari 2000
  • Laatst online: 16-10-2020

meibok

a-huh, huhuhuh, huh-huh

Topicstarter
edit:

bij nader inzien,
off topics (/flame-wars)over de wetenschap en motivatie van seti@home zijn er al genoeg geweest.

"Oh no! it's mega-maid! She's gone from suck to blow!"


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • MOL
  • Registratie: Mei 2000
  • Laatst online: 26-11-2021

MOL

Eet je wel goed?

Tis een screensaver. Dan valt het project voor mij al af :( Als het gewoon idle time gebruikt zou ik een overstap zeker overwegen, overigens.

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • MarcyDarcy
  • Registratie: Juni 2000
  • Laatst online: 16-09 20:21
ik kan het fout hebben....maar volgens mij kan je kiezen of je de screensaver gebruikt of een soort van d.net client

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • stappel_
  • Registratie: Augustus 2000
  • Laatst online: 14-09 12:59
Op vrijdag 23 februari 2001 17:22 schreef MOL het volgende:
Tis een screensaver. Dan valt het project voor mij al af :( Als het gewoon idle time gebruikt zou ik een overstap zeker overwegen, overigens.
Even lezen en dan zult ge zien dat er ook een console versie is die op de achtergrond in idle time kan draaien.

Ubero: #2, Euler: #1, GOT: #1, Des: #1, Zeta: #1, Eon: #3, OGR-24: #3, OGR-25: #7,
LM: #7, AP: #5, DF: #19, D2OL: #37, SOB: #50, TSC: #63, RC5: #96


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • FReaKaNDeLL
  • Registratie: Oktober 2000
  • Niet online
Kewl dat DPC nog een project erbij doet, maar k vind dat ik met RC5, OGR & GF wel genoeg verdeelt ben :)

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Frenzy
  • Registratie: November 1999
  • Laatst online: 10-08 13:16
folding@home, klinkt als thuiswerk voor oma's en herintreders ;)

Acties:
  • 0 Henk 'm!

Verwijderd

met Genome@home staat TA trouwens boven de DPC! :(

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Dutchman!
  • Registratie: Januari 2000
  • Laatst online: 18-09 16:55
niet voor lang :)

We spend our years as a tale that is told


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • FReaKaNDeLL
  • Registratie: Oktober 2000
  • Niet online
dan mogen er wel meer als 1 WU binnen komen daaro
(foldingathome.stanford.edu/teamall.html kijk dan helemaal onderaan, op de 531e plaats :'()

Acties:
  • 0 Henk 'm!

Verwijderd

Jaja, we werken eraan (genome@home). Ik zit hier met een clubje moleculair biologen en aanverwanten, ben nu bezig met een eerste eiwitje. even kijken hoe het loopt. Punt is, we gaan eindelijk es lekker ( [DPC] Halbewoners) met RC5, en een aantal machines moeten hidden draaien. Aangezien de client in een DOS-box draait _ZUCHT_. Krijg een beetje dezelfde kouwe douche als met die brakke SETI-client.
Dus of we de volledige kudde over kunnen zetten ... denk het niet (4000 RC5-blokjes/dag).
Maar het project heeft wel wat. Zelf genen verzinnen en controleren door de betreffende eiwitjes te bouwen.

edit:

Oh nee, bekende sequenties testen op het geven van functionaliteit. Whatever. Zat ik toch nog met "Thuisvouwen" in me kop.

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • roytanck
  • Registratie: Oktober 1999
  • Laatst online: 21-07 08:16
En www.ud.com (hebben d.net overgenomen)? Daar doen ze ook grappige projecten, de client gebruikt bij mij maar 5MB ram (grote nadeel SETI)... Je kunt prijzen winnen (hoe harder je rekent hoe meer kans)... :)

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • harrie_1
  • Registratie: Februari 2000
  • Laatst online: 16-09 08:25

harrie_1

Dutchies NL - Dreanor Horde NL

Waar blijft de 1e hitparade?????
:P :P :P

Merkez


Acties:
  • 0 Henk 'm!

Verwijderd

Stats voor genome@home

Komt 'ie ! Houdt in de gaten dat deze stats meerdere malen per dag ververst worden. Overigens zijn er blijkbaar wat problemen met joinen, er zijn wel 10 teams "Knights who say NI !" met even zovele typvaute :D !
Verders nog even het gebruikelijke geronkel m.b.t. nieuwe leden natuurlijk ;) .

Stand binnen DPC [ Last updated on Wed Feb 28 06:12:32 PST 2001 ]:

Members of team Dutch_Power_Cows:

[DPC]_GEB 53.15 units 2 genes
[DPC]_Dutchman 44.91 units 2 genes
[eNeRGy] 24.44 units 1 genes
[DPC]_Halbewoners 17.11 units 1 genes

(YEAH ons gen is ook binnen ;) )

Totaalstats :


54 speech 146.21
55 The_Spaceknight 146.03
56 Dutch_Power_Cows 139.61
57 Nimno 135.94
58 all_your_base_are_belong_to_us

(Ja je gelooft het niet, die gekken zitten ineens overal)

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • wildhagen
  • Registratie: Juni 1999
  • Niet online

wildhagen

Blablabla

Nemesis, waar zie je de stats? Ik kan mezelf (wildhagen@iname.com) helemaal niet terugvinden :'(

En hoe join ik DPC in Folding@Home?

Virussen? Scan ze hier!


Acties:
  • 0 Henk 'm!

Verwijderd

edit:

Wacht ff, sorry, ik post nu voor genomeathome, voor folding weet ik het niet !


Teamstats :
http://genomeathome.stanford.edu/teamstats.html

DPC stats :
http://genomeathome.stanford.edu/teams/Dutch_Power_Cows.html

Joinen doe je door bij de install het DPC-teamnummer in te geven (daarom gaat het waarschijnlijk ook vaak fout, denk dat je even opnieuw moet downloaden en installeren, de client is vrij brak).
DPC Teamnummer : 1651007169 (Sequence bedankt ;) )

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • wildhagen
  • Registratie: Juni 1999
  • Niet online

wildhagen

Blablabla

Ah, OK.

Virussen? Scan ze hier!


Acties:
  • 0 Henk 'm!

Verwijderd

Lijkt me niet. Je vult nu bij folding@home het teamnummer voor genome@home in.
User Name: 1651007169
Heb je zelf ingevuld neem ik aan ?
Vervolgens vult dat kreng ... ahem, client, zelf een zinniger (?) naam in :
- Getting ID from AS: Successful.
- ID = 29AF1165F53AE24
Ben je nu WEL met genome@home bezig, doe dan de download even opnieuw en vul vanaf het begin meteen de juiste parameters (teamnummer)in ! Volgens mij kun je niet alle settings in je ghclient.cfg veranderen zoals in de rc5.ini.

Acties:
  • 0 Henk 'm!

Verwijderd

Op woensdag 28 februari 2001 16:30 schreef wildhagen het volgende:
Ah, OK.
;) OK zegt 'ie dan ...

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • wildhagen
  • Registratie: Juni 1999
  • Niet online

wildhagen

Blablabla

Op woensdag 28 februari 2001 16:41 schreef Nemesis het volgende:

[..]

;) OK zegt 'ie dan ...
Nee, ik was weer dom aan het doen (what else is new? ;)), het is nu OK!

Virussen? Scan ze hier!


Acties:
  • 0 Henk 'm!

Verwijderd

OK :D !

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • MeneerKrab
  • Registratie: Augustus 2000
  • Laatst online: 16-07 16:14
Wanneer krijg je nou eens stats te zien.
draai het hier ook al.
maar we zijn nog niet geregistreerd.
Het gaat hier om genome@home.
Als je dus gaat zoeken op gebruikersnaam, geeft hij aan dat we nog niet geregistreerd staan, of komt dat pas als je een gen hebt gestuurd???

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Dutchman!
  • Registratie: Januari 2000
  • Laatst online: 18-09 16:55
je moet je eerst registreren, en dan je nickname en teamnummer in de client invoeren dacht ik.

edit:
en je ziet jezelf natuurlijk pas in de stats als je een gen hebt ingestuurd :)

We spend our years as a tale that is told


Acties:
  • 0 Henk 'm!

Verwijderd

Zullen we dit ook ff gaan testen en misschien dat ik dit ook wel blijf doen het is een stuk nuttiger dan rc5.

Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • meibok
  • Registratie: Februari 2000
  • Laatst online: 16-10-2020

meibok

a-huh, huhuhuh, huh-huh

Topicstarter
Dat dacht ik ook. (No offense RC5 power cows)

"Oh no! it's mega-maid! She's gone from suck to blow!"


Acties:
  • 0 Henk 'm!

  • Sequence
  • Registratie: Maart 2000
  • Laatst online: 27-05-2024

Sequence

Online marketing

hoe meer zielen, hoe meer vreugde

hoe meer projecten, hoe meer #1 posities :D
Pagina: 1