[Folding@Home] hitparade van 3 januari

[smoking2000]

Wat ruikt men daar? Zijn het de Folding@Home stats?

You can bet your snow covered cows it is



Met vandaag maar liefst 10 9 mijlpalen om uit te delen:



TCF heerst nog immer op #1, met chelloo.com op #2 en TJB heeft FEG van de #3 verstoten.



[DPC]ErroR is de laatste tijd goed bezig en flusht zichzelf vandaag naar Koe van de dag!



Overall zijn er weinig ontwikkelingen hoewel ook hier de dominantie van TCF steeds duidelijker wordt.



Dan tot slot het heugelijke nieuws dat TyridunPS3 de revolutie is komen versterken!



DPC Folding@Home hitparade van 3 januari 2008

Daily Top 30
Flushers: 106 / 2.863 (3,7 %)
pos		daily	member	total
1.	()	44.159	[DPC]_Team_ColdFusion	6.933.096	(1)
2.	()	24.024	chelloo.com	5.161.824	(3)
3.	(1)	15.392	TEAM_JOE_BAR	3.711.429	(5)
4.	(1)	11.415	[DPC]_Fatal_Error_Group	3.308.671	(7)
5.	(1)	6.286	Team_Pastis_51	3.091.903	(8)
6.	(4)	5.425	DeApen	414.971	(38)
7.	(2)	5.417	Schapie	1.981.281	(11)
8.	(1)	4.260	Bogaarts	497.145	(32)
9.	(1)	4.228	PS3	815.266	(20)
10.	(2)	3.977	[DPC]NGS	3.879.412	(4)
11.	(3)	3.496	RdamRobin	595.756	(28)
12.	(5)	3.398	BPE	203.699	(63)
13.	(6)	3.207	Team4Fun.nl	6.646.178	(2)
14.	(3)	2.739	Holy_Cow!	1.380.175	(16)
15.	(34)	2.429	PureAgony	232.433	(59)
16.	(3)	2.332	PeaceNlove	485.401	(34)
17.	(2)	2.046	gowron	2.813.268	(9)
18.	(1)	1.966	aardkwak	141.180	(90)
19.	(69)	1.760	[DPC]ErroR	28.641	(293)
20.	(12)	1.635	Pietertje	95.582	(129)
21.	(9)	1.520	Tamarinde	383.697	(39)
22.	(6)	1.129	Niixxss	494.677	(33)
23.	(66)	1.129	TommyGutless	30.521	(284)
24.	(11)	1.108	Harmk-PS3	102.745	(124)
25.	(44)	989	mzilla	169.721	(75)
26.	(49)	973	daniel24	7.597	(646)
27.	(46)	933	[PS3]Masticina	89.570	(137)
28.	(49)	843	Caseman-nl	100.513	(127)
29.	()	755	Anonymous	175.241	(72)
30.	(7)	725	Sonerveld	10.763	(547)
	More...

Overall Top 30
pos		total	member	daily
1.	()	6.933.096	[DPC]_Team_ColdFusion	44.159	(1)
2.	()	6.646.178	Team4Fun.nl	3.207	(13)
3.	()	5.161.824	chelloo.com	24.024	(2)
4.	()	3.879.412	[DPC]NGS	3.977	(10)
5.	()	3.711.429	TEAM_JOE_BAR	15.392	(3)
6.	()	3.558.333	Team_Elteor_Borislavj	491	(53)
7.	()	3.308.671	[DPC]_Fatal_Error_Group	11.415	(4)
8.	()	3.091.903	Team_Pastis_51	6.286	(5)
9.	()	2.813.268	gowron	2.046	(17)
10.	()	2.020.569	[DPC]Clan_Delft	686	(34)
11.	()	1.981.281	Schapie	5.417	(7)
12.	()	1.888.657	DPC_Los_Alcoholicos	0	(-)
13.	()	1.628.420	www.onweer-online.nl	500	(52)
14.	()	1.616.009	SandStar	0	(-)
15.	()	1.391.779	Forza_Mucca	392	(56)
16.	()	1.380.175	Holy_Cow!	2.739	(14)
17.	()	1.100.603	BananaTeam	510	(42)
18.	()	975.781	DPC_Division_Brabant	609	(39)
19.	()	895.362	1KEY	0	(-)
20.	()	815.266	PS3	4.228	(9)
21.	()	807.258	DPC_Team_Switch	0	(-)
22.	()	806.633	New_Folder	0	(-)
23.	()	801.733	DukeBox	0	(-)
24.	()	772.416	MaCCrunch	0	(-)
25.	()	754.246	Robbie_D	0	(-)
26.	()	712.478	STW	293	(80)
27.	()	708.677	Waddenteam	0	(-)
28.	()	595.756	RdamRobin	3.496	(11)
29.	()	561.312	DPC_The_Boldies	0	(-)
30.	()	551.112	hype-one	0	(-)
	More...

Teams Daily Top 15
pos		daily	team	total
1.	()	910.606	Maximum PC Magazine	421.497.230	(3)
15.	(2)	254.981	PlayStation.com Forums Team	50.686.764	(41)
16.	(4)	247.905	Ars Technica Team Egg Roll	188.648.656	(9)
17.	(4)	244.118	Overclock.net	78.698.883	(24)
18.	(2)	241.978	Team Engadget	94.124.253	(21)
19.	(4)	236.979	Team AnandTech	88.174.937	(22)
20.	(2)	197.697	PC Perspective Folding Frogs (734)	139.680.586	(13)
21.	(2)	192.402	OcUK	79.021.134	(23)
22.	(2)	188.001	Dutch Power Cows	98.464.333	(20)
23.	(2)	186.445	Team 2ch	60.635.118	(33)
24.	()	169.011	Team Icrontic.com	135.239.704	(16)
25.	(1)	165.674	NCIX.com Forum Folding Team	62.744.392	(32)
26.	(6)	165.553	Vietnam Global Team	51.375.122	(39)
27.	(1)	139.024	DSL Reports Team Helix	115.713.024	(17)
28.	(1)	133.822	Ukraine	41.162.043	(48)
29.	(4)	126.351	ADSLgr - Greek aDSL Users	50.380.232	(42)
	More...

Teams Overall Top 15
pos		total	team	daily
1.	()	601.226.848	Overclockers Australia	599.218	(4)
13.	()	139.680.586	PC Perspective Folding Frogs (734)	197.697	(20)
14.	()	138.368.946	TSC! Russia	401.476	(7)
15.	()	136.250.718	EOC Folding@Home Team	273.777	(10)
16.	()	135.239.704	Team Icrontic.com	169.011	(24)
17.	()	115.713.024	DSL Reports Team Helix	139.024	(27)
18.	()	111.815.446	ABXZone.com	124.765	(30)
19.	()	106.636.099	p2p-community	105.894	(38)
20.	()	98.464.333	Dutch Power Cows	188.001	(22)
21.	()	94.124.253	Team Engadget	241.978	(18)
22.	()	88.174.937	Team AnandTech	236.979	(19)
23.	()	79.021.134	OcUK	192.402	(21)
24.	()	78.698.883	Overclock.net	244.118	(17)
25.	()	78.275.557	Overclockers Club	101.086	(42)
26.	()	76.683.386	SilentPCReview Folding@Home	96.218	(45)
27.	()	75.049.764	Team Hack-a-Day	110.102	(35)
	More...

Megaflush Top 5
pos	Team	Flush	Date
1.	Team4Fun.nl	202.700	05-12-2005
2.	markvanmook	116.996	31-10-2006
3.	[DPC]_Team_ColdFusion	54.856	02-01-2008
4.	Schapie	29.669	31-10-2006
5.	chelloo.com	26.834	07-04-2007
More...

Mijlpalen

[DPC]_Team_ColdFusion	6.900.000
TEAM_JOE_BAR	3.700.000
[DPC]_Fatal_Error_Group	3.300.000
Caseman-nl	100.000
Caseman-nl	100.000
Peathah	20.000
Electrowolf	5.000
SayWhatAgain	1.000
username0schapie	1.000
Meekoh	500

When do you get them

Team	Average	Days
p2p-community	59.755	154

Nieuwe Leden

TyridunPS3

340

Folding@Home Links
Folding@Home webpage
Folding@Home forum
DPCH Suggestiepagina
DPC FAQ
Bron

[Mobster]

Welkom TyridunPS3. Jouw bakje(s) kunnen we hier goed gebruiken.

Die output van TCF is overigens behoorlijk bruut. Veel PS3-systemen jongens?

[smoking2000]

Er is ook nog nieuws vanuit Stanford:

quote: http://folding.typepad.com/news/2008/01/binding-of-a-li.html

Binding of a ligand (small molecule drug) to proteins

Today, I'm going to post a nice summary of one major facet of FAH, the study of protein-ligand binding. This issue is critical for computational drug design, and brings together many parts of what we do with FAH. This summary was written by Peter Kasson and I'm going to paste it verbatim, since I think he did a nice job with it.

---

We're often interested in comparing things--predicting a known difference is a good way to test our methods. Then, once we're pretty confident that things work, we want to predict ways to change the way proteins interact. Changing a system in a defined way is both a good tool for biological insight and the basis for a lot of medical treatments.

In this particular case, we're interested in the "selectivity" of ligand binding by a protein: the protein is known to bind one small molecule ("ligand") much better than another. So 3903/3905 is a pair of projects comparing the protein-small molecule interactions, one project for each small molecule. 3906/3907 are the essential "control" projects that tells us how different the small molecules are in the way that they interact with the water around them. When we combine these pairs of projects, we can then calculate the difference between the "bound" state in which the protein is interacting with the small molecule and the "unbound" state in which the protein and small molecule each just interact with the environment. There are experimental data on the difference between these two small molecules; if we get good results here, we'll go on to test a number of interactions that aren't experimentally known yet.

The trick is that some protein-small molecule interactions are quite easy to test experimentally and some are very hard. Using Folding@Home, they are all moderate in difficulty. So if we can validate our methods on the "easy" ones, we can then predict the "hard" ones. Usually only a small fraction of protein-small molecule interactions that one tests turn out to be important. For the ones we predict are really interesting, we can do the experiment. But Folding@Home allows us to skip the experiments that are both hard and likely not to be interesting. This sounds simple, but it can be very powerful in trying to understand the underlying biology.

We also hope that it can help us understand a number of diseases and drug interactions better. For instance, a number of diseases or "failures" of medical therapy are due to mutations in proteins (changes to their amino acid sequence). We would like to understand how these mutations affect the interactions between the protein and the drug. If we can understand that, we can help suggest ways to improve the drug therapy. This is obviously a large, hard problem, but we think that Folding@Home can play an important role here.

quote: http://folding.typepad.com/news/2008/01/new-gpu-core-up.html

Update on new GPU core

Several people have been curious about any news regarding a new GPU client/core. We hit a few snags and then hit the holiday break, but the team is back now. We have the new client running in our lab and we're doing some final Q&A on it. The new code is running on the latest ATI cards (2xxx and 3xxx) and getting pretty good performance so far. The performance is pretty good now (after some optimizations from Mark and Mike H.), so I'm optimistic. This does not look like a 6-month delay, more like a few week delay, but it's hard to tell -- you can't predict the unpredictable things which can come up.

[Bubbles]

Mobster schreef op vrijdag 04 januari 2008 @ 10:31:
Welkom TyridunPS3. Jouw bakje(s) kunnen we hier goed gebruiken.

Die output van TCF is overigens behoorlijk bruut. Veel PS3-systemen jongens?

Geen idee, maar SandStar heeft een aardig parkje dual- en quad-core bakken staan. Dat schiet ook wel behoorlijk op. 2 dagen terug had ie daarmee 25+K op zijn naam gezet.

[ Voor 8% gewijzigd door Bubbles op 04-01-2008 10:45 ]

[ColdFusion]

Ik geloof dat we 1 of 2 PS3's hebben. De rest zijn voornamelijk SMP's (oa de quads van Sandstar). En nu die nog overdreven bedeeld worden qua punten, maken wij er even goed misbruik van

[Anoniem: 100386]

Zeg mannen ik krijg een hele serie errors waar ik niets van snap; Er is een nieuwe core gedownload, en die kan schijnbaar niet gestart worden. Na 4 (of 5) pogingen gaat het hele gebeuren in "sleep for 1 day".

Ben momenteel niet thuis, dus ik kan niet de exacte error-beschrijving posten, dat zal ik vanavond doen. Maar is er iets bekend over "startproblemen" met een nieuwe SMP-core (core_1a dacht ik) ?

[JohFraEl]

Is het een Win-SMP of een Linux-SMP client? Volgens de Stanford SMP FAQ is Core a1 voor beiden. Zonder meer info kan ik alleen zeggen dat je wellicht de client een keer opnieuw moet downloaden en installen nadat je de huidige WU hebt weggeknikkerd. (kan nog wel eens helpen) Anders ff naspeuren in de SMP FAQ of navragen op het FAH-forum

Mijlpalers gefeli! TCF 6,9M, TJB 3,7M & FEG met de 3,3M De rest natuurlijk ook proficiat

Nieuwe deelnemer TyridunPS3 welkom bij de DPC vouwclub

Prettige loempiadag

[SandStar]

Anoniem: 100386 schreef op vrijdag 04 januari 2008 @ 11:25:
Zeg mannen ik krijg een hele serie errors waar ik niets van snap; Er is een nieuwe core gedownload, en die kan schijnbaar niet gestart worden. Na 4 (of 5) pogingen gaat het hele gebeuren in "sleep for 1 day".

Ben momenteel niet thuis, dus ik kan niet de exacte error-beschrijving posten, dat zal ik vanavond doen. Maar is er iets bekend over "startproblemen" met een nieuwe SMP-core (core_1a dacht ik) ?

schrijfrechten of stukke harde schijf willen nog wel eens oorzaak zijn.

Maar logfiles zouden wel handig zijn

[smoking2000]

Er is een bekent probleem met het extracten van de cores, dit gaat vaker fout, de oorzaak is nog niet achterhaalt daarentegen. Zie: http://foldingforum.org/viewtopic.php?t=150 (foldingforum is momenteel down door een webserver admin foobar, folding-community.org is daarentegen al veel langer down )

De manier om om deze core extraction errors uit te komen in de daar genoemde gevallen was om de betreffende WU te verwijderen uit de queue, en de betreffende FahCore_??.exe te verwijderen. De nieuwe gedownloade core werkt dan weer correct.

[Anoniem: 100386]

smoking2000 schreef op vrijdag 04 januari 2008 @ 12:34:
Er is een bekent probleem met het extracten van de cores, dit gaat vaker fout, de oorzaak is nog niet achterhaalt daarentegen. Zie: http://foldingforum.org/viewtopic.php?t=150 (foldingforum is momenteel down door een webserver admin foobar, folding-community.org is daarentegen al veel langer down )

De manier om om deze core extraction errors uit te komen in de daar genoemde gevallen was om de betreffende WU te verwijderen uit de queue, en de betreffende FahCore_??.exe te verwijderen. De nieuwe gedownloade core werkt dan weer correct.

Goed dat je dit schrijft:

Want daardoor herinner ik me dat ik gezien heb dat er een core is gedownload en dat er een extract heeft plaatsgevonden, gevolgd door een onsuccesvolle start. Uiteindelijk is dit 4 maal achter elkaar herhaald, en toen sloeg ie "op pauze". Dus het lijkt er inderdaad op dat ik te maken heb met het probleem waar jij het over hebt ...

Zal vanavond eventjes de queue legen en de core verwijderen om te zien of dat help om het probleem op te lossen

[ Voor 9% gewijzigd door Anoniem: 100386 op 04-01-2008 14:00 ]

[belstrekkie]

Wat is het toch stilletjes bij T4F... scroll me bijna m'n vinger uit de kom om onze puntjes te zien, zo laag staan we En geen flushes meer van Jerry.. is de stekker er dan helemaal uit??

[ColdFusion]

En dat nu de koeien van chelloo.com ook de jacht op jullie geopend hebben

[Anoniem: 100386]

Anoniem: 100386 schreef op vrijdag 04 januari 2008 @ 13:51:
[...]


Goed dat je dit schrijft:

Want daardoor herinner ik me dat ik gezien heb dat er een core is gedownload en dat er een extract heeft plaatsgevonden, gevolgd door een onsuccesvolle start. Uiteindelijk is dit 4 maal achter elkaar herhaald, en toen sloeg ie "op pauze". Dus het lijkt er inderdaad op dat ik te maken heb met het probleem waar jij het over hebt ...

Zal vanavond eventjes de queue legen en de core verwijderen om te zien of dat help om het probleem op te lossen

't Was dus iets anders ....

Mijn systeem staan natuurlijk zo veel mogelijk 24 / 7 aan ... maar het is ook zo ingericht dat ik eens in de zoveel tijd mijn password moet veranderen. En Dat moest dus nog gebeuren, maar omdat ik nog geen reboot/restart had gedaan was het mij zelf ook nog niet opgevallen dat ik mijn PW moest veranderen ... maar dat mpiec ofzo-appje dus wel.

Password in systeem veranderd, Install.bat opnieuw gedraaid en daarmee PW gesyncht en hij doet het weer