[Rosetta@Home] hitparade van 14 juli

[trenza]

Terwijl Kuuke zijn ontwaaktijd had uitgesteld en dus iedereen langer de kans had om de stats te posten, ontbreken de Rosetta@Home stats nog om 9:00. Maar waarom ik de stats dan niet eerder postte? Och huishoudelijke beslommeringen en je weer verwonderen dat Nederlands grootste grootgrutter er steeds beter in slaagt om met de prijzen ook de kwaliteit hard achteruit te laten gaan. Dus straks nog maar een andere supermarkt of kleine zelfstandige opzoeken.
Maar goed. De stats. Wat is daar over te vertellen?
Nou bijvoorbeeld dat [DPC]TeamHC met 300 punten verschil BurnHard verdrijft van de daily 3, of Sybr_E-N die 24 plaatsen stijgt en uitkomt op plaats 18.
En wat dacht je van Da_Bink die [DPC]Happy Hour verwijst naar de beste van de rest en hiermee de 30e plaats van de overall inneemt.

Nieuw in de rij van kandidaat flushers is Lutzer die ons team komt versterken. Van harte welkom.
Als we dan ook nog Lmax feliciteren met de 5.000 mijlpaal dan is het verhaaltje redelijk compleet en wordt het tijd voor de
[Rosetta@Home] hitparade van 14 juli 2006

Subteams Daily Top 30
pos		daily	user	total		procent
1.	()	29.516,50	[DPC]FOKschaap	4.661.810,79	(2)	17,4 %
2.	()	16.817,10	Cureseekers	4.735.707,53	(1)	9,9 %
3.	( 1)	10.478,20	[DPC]TeamHC	949.947,44	(8)	6,2 %
4.	( 1)	10.178,60	BurnHard	1.266.213,63	(7)	6,0 %
5.	()	6.746,81	Grutte Pier [Wa Oars]	2.289.392,09	(4)	4,0 %
6.	()	6.393,28	Los Alcoholicos	3.455.539,36	(3)	3,8 %
7.	()	5.715,73	[DPC] Team ColdFusion	1.348.985,86	(6)	3,4 %
8.	( 1)	4.649,02	borkescomputers	572.744,66	(13)	2,7 %
9.	( 1)	3.963,39	[DPC]Division_Brabant	411.097,24	(18)	2,3 %
10.	( 1)	3.833,37	TeamBVD	652.641,38	(12)	2,3 %
11.	( 1)	3.676,64	Creative ID	162.067,85	(36)	2,2 %
12.	( 2)	3.589,76	Team_Elteor_Borislavj	2.020.945,26	(5)	2,1 %
13.	( 4)	3.435,63	Patman	320.951,05	(23)	2,0 %
14.	( 1)	3.062,49	Cosmic Cows	437.269,02	(16)	1,8 %
15.	( 2)	2.551,52	Team_Gaol	917.207,02	(10)	1,5 %
16.	( 2)	2.514,28	Basjes	160.992,22	(37)	1,5 %
17.	( 2)	2.063,65	Mbc	349.496,55	(20)	1,2 %
18.	( 24)	2.042,34	Sybr_E-N	71.827,44	(69)	1,2 %
19.	( 1)	2.041,68	DaapGerrit	32.433,14	(113)	1,2 %
20.	( 8)	2.035,36	Grimburgoth	146.049,17	(40)	1,2 %
21.	( 4)	1.933,10	Markosoft	145.188,57	(41)	1,1 %
22.	( 1)	1.771,27	Lmax	5.027,25	(265)	1,0 %
23.	( 2)	1.762,88	MolAnO	266.773,44	(25)	1,0 %
24.	()	1.740,42	Da_Bink	194.609,86	(30)	1,0 %
25.	( 8)	1.640,08	B&B	136.882,17	(43)	1,0 %
26.	( 5)	1.452,84	MadMarky	118.532,56	(49)	0,9 %
27.	( 2)	1.311,06	NoizyCows	489.391,06	(14)	0,8 %
28.	( 14)	1.270,87	DPC_Schotse_Hooglanders	300.250,44	(24)	0,7 %
29.	( 1)	1.268,22	Chris	91.840,01	(57)	0,7 %
30.	( 2)	1.184,81	jfTK	68.522,90	(71)	0,7 %
More...

Subteams Overall Top 30
pos		overall	user	daily		procent
1.	()	4.735.707,53	Cureseekers	16.817,10	(2)	12,1 %
2.	()	4.661.810,79	[DPC]FOKschaap	29.516,50	(1)	11,9 %
3.	()	3.455.539,36	Los Alcoholicos	6.393,28	(6)	8,8 %
4.	()	2.289.392,09	Grutte Pier [Wa Oars]	6.746,81	(5)	5,8 %
5.	()	2.020.945,26	Team_Elteor_Borislavj	3.589,76	(12)	5,1 %
6.	()	1.348.985,86	[DPC] Team ColdFusion	5.715,73	(7)	3,4 %
7.	()	1.266.213,63	BurnHard	10.178,60	(4)	3,2 %
8.	()	949.947,44	[DPC]TeamHC	10.478,20	(3)	2,4 %
9.	()	930.872,86	MetalMike	754,43	(44)	2,4 %
10.	()	917.207,02	Team_Gaol	2.551,52	(15)	2,3 %
11.	()	755.728,40	[DPC]Team Switch	37,85	(125)	1,9 %
12.	()	652.641,38	TeamBVD	3.833,37	(10)	1,7 %
13.	()	572.744,66	borkescomputers	4.649,02	(8)	1,5 %
14.	()	489.391,06	NoizyCows	1.311,06	(27)	1,2 %
15.	()	459.393,46	Tukkertje	720,38	(45)	1,2 %
16.	()	437.269,02	Cosmic Cows	3.062,49	(14)	1,1 %
17.	()	427.542,74	Dutch Power Chicken	490,15	(52)	1,1 %
18.	()	411.097,24	[DPC]Division_Brabant	3.963,39	(9)	1,0 %
19.	()	376.434,71	AJSL	244,26	(67)	1,0 %
20.	()	349.496,55	Mbc	2.063,65	(17)	0,9 %
21.	()	344.136,22	JZ-power	986,10	(35)	0,9 %
22.	()	327.168,96	M_P_G	1.082,88	(32)	0,8 %
23.	()	320.951,05	Patman	3.435,63	(13)	0,8 %
24.	()	300.250,44	DPC_Schotse_Hooglanders	1.270,87	(28)	0,8 %
25.	()	266.773,44	MolAnO	1.762,88	(23)	0,7 %
26.	()	261.699,10	[DPC]NGS	0,00	(607)	0,7 %
27.	()	225.893,73	trenza	1.153,10	(31)	0,6 %
28.	()	205.330,80	[DPC] De7geitjes	299,08	(59)	0,5 %
29.	()	197.525,52	Selwerd	0,00	(396)	0,5 %
30.	( 1)	194.609,86	Da_Bink	1.740,42	(24)	0,5 %
More...

Teams Daily Top 15
pos		daily	team	total		procent
1.	()	494.409,00	XtremeSystems	52.705.529,51	(1)	19,4 %
2.	()	193.747,00	Free-DC	45.543.839,92	(2)	7,6 %
3.	()	170.046,00	Dutch Power Cows	39.392.478,31	(3)	6,7 %
4.	()	164.109,00	Maas Family	1.356.048,16	(33)	6,4 %
5.	()	100.279,00	TeAm AnandTech	20.147.810,64	(4)	3,9 %
6.	()	67.166,30	Team MacNN	5.000.347,09	(12)	2,6 %
7.	( 1)	63.929,40	Canada	7.962.772,21	(6)	2,5 %
8.	( 1)	50.019,80	SETI.USA	4.368.667,95	(15)	2,0 %
9.	()	42.625,00	US-Distributed	6.710.336,19	(8)	1,7 %
10.	( 2)	37.414,60	XPC	13.511.671,71	(5)	1,5 %
11.	( 1)	36.355,90	Ars Technica	7.232.308,43	(7)	1,4 %
12.	( 1)	34.889,30	Teddies	4.736.805,76	(13)	1,4 %
13.	()	30.931,10	Rechenkraft.net	3.450.483,51	(17)	1,2 %
14.	( 1)	28.075,80	BOINC Synergy	5.499.247,25	(11)	1,1 %
15.	( 1)	26.799,60	The Clangers	3.360.829,23	(19)	1,1 %
More...

Teams Overall Top 15
pos		overall	team	daily		procent
1.	()	52.705.529,51	XtremeSystems	494.409,00	(1)	14,2 %
2.	()	45.543.839,92	Free-DC	193.747,00	(2)	12,3 %
3.	()	39.392.478,31	Dutch Power Cows	170.046,00	(3)	10,6 %
4.	()	20.147.810,64	TeAm AnandTech	100.279,00	(5)	5,4 %
5.	()	13.511.671,71	XPC	37.414,60	(10)	3,7 %
6.	()	7.962.772,21	Canada	63.929,40	(7)	2,2 %
7.	()	7.232.308,43	Ars Technica	36.355,90	(11)	2,0 %
8.	()	6.710.336,19	US-Distributed	42.625,00	(9)	1,8 %
9.	()	6.522.580,25	Phoenix Rising	12.460,80	(30)	1,8 %
10.	()	5.652.617,17	Housing and Food Services	15.223,00	(27)	1,5 %
11.	()	5.499.247,25	BOINC Synergy	28.075,80	(14)	1,5 %
12.	()	5.000.347,09	Team MacNN	67.166,30	(6)	1,4 %
13.	()	4.736.805,76	Teddies	34.889,30	(12)	1,3 %
14.	()	4.643.575,20	Czech National Team	23.423,50	(17)	1,3 %
15.	()	4.368.667,95	SETI.USA	50.019,80	(8)	1,2 %
More...

Mijlpalen
user	mijlpaal
Lmax	5.000

When do we reach the 40.000.000?
We will reach this goal in 4 days.

When do we get them...
nobody

When do they get us...
days	team
45	BOINC.Italy - World Champions!!!

New members
Lutzer

Rosetta@home Links
Rosetta@home Homepage
Officiële stats
DPC Rosetta FAQ
DPCH Suggestiepagina
Bron

[devzero642]

"huishoudelijke beslommeringen" voor 9 uur 's ochtends op een zaterdag? Ik heb nooit iets van die ochtendmensen begrepen

Hulde voor da_bink voor het enige pijltje in de top 30

[Kristof]

Eerst en vooral wil ik de DPCH posters van de afgelopen tijd bedanken
Fijn dat er wat afwisseling is, dit biedt zeker een meerdwaarde. Daarom ook de oproep: Blijf dit verder doen, en andere mensen worden ook uitgenodigd hetzelfde te doen.

Ook een hartelijk welkom aan Lutzer, en welkom in de TOP30 voor Da_bink!

Er is ook nog nieuws over CASP7:

Dear predictors,

Today we have closed the facility for submitting targets for CASP7.
We are happy to announce that we have reached the goal of 100 targets
for prediction in CASP7. As former CASP participants remember, this had
been a goal since several CASPs.

All in all, we have received 154 submissions of which we selected 104
targets for CASP7, and as of today 98 of these have been released. This
means that we are left with 6 targets for next week. We plan to release
three targets on Monday, two on Tuesday and the last one on Wednesday.
To reduce possible overload in the last week, we are extending the
prediction season by 3 days. The deadline for the last CASP7 target will
be August 7.

At the end of the target release season we would like to thank all the
crystallographers and NMR spectroscopists who supported the experiment.
Especially big thanks go to the four structural genomic centers (JCSG,
MCSG, NESG and SGC) which provided the biggest share by submitting 20+
targets each. The full list of the people/centers submitting targets for
CASP7 will be published shortly at the CASP7 target submission page.

We also want to thank the PDB for arranging a special mechanism so that
the proteins deposited to the PDB with the "CASP" annotation were put on
hold for at least 4 weeks.

This week we had to cancel target T0377 as its structure had been
released by the PDB (2ivy). Second time this season a different
crystallography center independently solved and published the structure
submitted to CASP.

Complete list of targets (13) for oligomeric predictions:
T0295, T0300, T0305, T0308, T0310, T0332 (expired);
T0338, T0339, T0343, T0346, T0366, T0372, T0375 (valid for prediction).

Complete list of side chain refinement targets (6):
T0326, T0340, T0345, T0346, T0359, T0366

Targets for high accuracy assessment:
Not specified in advance, this will be determined by the assessors.

Targets for refinement:
TR288, TR308; additional targets are considered.

Targets to expire next week:
T0345, T0346 (Mon, July 17)
T0348, T0349 (Tue, July 18)
T0350, T0351 (Wed, July 19)
T0325, T0352 (Thu, July 20)
T0353, T0354 (Fri, July 21)
T0355 (Sat, July 22)
T0342 (Sun, July 23)

Soft deadlines:
T0344 (Mon, July 17)
T0347 (Tue, July 18)
T0352 (Wed, July 19)
T0353-355 (Thu, July 20)
T0356 (Fri, July 21)

Thanks for reading this far

--
Andriy Kryshtafovych,
for CASP organizers

[Kristof]

Er is ook nog een (nood)oproep van David Baker:
Op het forum vraagt hij:

We desperately need as much CPU power as possible for the next two weeks--there are more than 25 CASP targets due, including some that are our best shots at really high resolution models. Frustratingly, we won't be able to do anywhere near as much sampling as we had planned for these proteins as there are so many coming due near the same time, and thus can't really expect the accuracy we had hoped for. So if it is at all possible for you to
increase your rosetta@home cpu time for the next two weeks please do--it will make a huge difference for our collective efforts!

Via e-mail heeft hij de vertegenwoordigers van de top-teams ook nog speciaal een oproep gedaan:

Kristof,

as I posted this morning, we are desperately short of computing power
for the next 9 days or so due to the very large
number of CASP targets coming due. any suggestions on
things I could do to try to up production in the very short term?
(one possibility would be for people who like to contribute to multiple
projects to switch to 100% rosetta for the next 10 days
and then make up the lost time on the other projects in the following
10 days).
in any event, if you can encourage your team members that would be
great!

thanks,
David

We kunnen dus niet anders dan onze uiterste best hiervoor doen.
Ik weet dat sommigen last hebben van de warmte, maar probeer zoveel mogelijk aan te zwengelen. Mensen die meerdere projecten draaien, kan je voor een week niet even terug 100% rosetta draaien?
Moesten de mensen van subteams dit even intern in hun subteam ook kunnen doorgeven, zou het helemaal geweldig zijn...

[ Voor 4% gewijzigd door Kristof op 15-07-2006 14:34 ]

[Sybr_E-N]

Woei! Weer een top 30 notering erbij

Ik heb al mijn pc's aanstaan, niet helemaal 24/7 moet ook nog kunnen slapen.

[Verwijderd]

ik heb ook weer iets meer machines aan rosetta gezet, hopelijk helpt het en beetje.

[Crack]

Nog meer power op r@h? Ik had net besloten een tijdje TANPAKU te draaien.
Als je 't mij vraagt is DPC al royaal vertegenwoordigd op dit project.

[Verwijderd]

Weet iemand wat voor benchmarkscore je ongeveer haalt met een pentium D 805?
Moet een nieuwe PC bouwen en deze lijkt me wel vrij interessant

[Megaflix]

Ik kan wel een tijdje Rosetta gaan draaien. Stel ik mijn eigen doelen eventjes uit tot over een week of 2

[DeadLock]

Ik doe momenteel men uiterste best , en meer dan een 650-1000 daily zit er momenteel niet in. Maar ik doe enthousiast verder .

Wat me opvalt is de wel (heel) beperkte houdbaarheid van de wu's , de laatste die ik deze ochtend heb gekregen zijn maar tot de 22 juli goed. Ik heb een cache van 2 dagen staan , ik weet niet of dit iets uitmaakt ?

Hopelijk vindt David genoeg power om de CASP targets goed te kunnen completen , maar maakt het eigenlijk uit of deze CASP targets nu gedaan worden in tien dagen met veel power , of in 15 dagen met de 'gewone' power ? Ik weet natuurlijk ook wel dat sneller beter is voor het project , maar an sich maakt het toch niet uit ? Of vergis ik me ergens ?

[Kristof]

ja,
CASP geeft targets uit, en de verschillende projecten moeten de resultaten binnen een korte tijdsspanne terug inleveren

[Da_Bink]

Joehoe! Terug van weg geweest in de top-30!
En dat ik nog maar veel plaatsjes stijgen mag!