[Rosetta@Home] hitparade van 9 mei

[Kristof]

Wie van erwtensoep houdt, heeft vanmorgen geluk. Als ik naar buiten kijk, zie ik niets anders dan dikke mist. Hopen dat dit zo snel mogelijk open trekt.
Vlug mijn blik van het raam weghalen, en zo snel mogelijk naar de stats kijken.

Mijn eerste oogopslag op de stats was: WTF hebben die schapen een mooie MF gedaan, dit moet een mooi resultaat geven in de overall score van DPC.
Spijtig genoeg is niets minder waar
Uwmoeder joint de gefokte schapen. <= Laat deze zin maar eens lezen aan iemand die niet met DPC bezig is

Ook vandaag zijn er weer een aantal palen uit te delen, met name 11. De grootste gaat deze keer naar de7geitjes.
Spijtig genoeg staat FreeDC weeral boven ons (met maar een minimale voorsprong, maar toch... zo halen we ze nooit in he)


Ook het project heeft wat te melden:

Application upgraded to 5.12. New version includes the ability to send out workunit descriptions and rescaled graphics for big proteins. For more information see this thread.

In "this thread" vinden we:

Rosetta 5.12 is up!

1. We've centered and rescaled the graphics for large proteins so that they don't spend a lot of the time out of the box.

2. We've made it possible to send out workunit descriptions with the graphics. These won't be sent out with previously queued workunits, but we hope to at least have some text for new workunits throughout the summer!

3. We made some science fixes that will allow us to combine the "jumping" (strand-break) protocol with full-atom refinement.

[Rosetta@Home] hitparade van 9 mei 2006

Subteams Daily Top 30
pos		daily	user	total		procent
1.	()	162.925,00	[DPC]FOKschaap	3.012.264,26	(2)	47,8 %
2.	( 1)	25.447,90	Cureseekers	3.306.290,97	(1)	7,5 %
3.	( 1)	17.469,00	Team_Elteor_Borislavj	1.741.797,25	(4)	5,1 %
4.	( 1)	13.799,70	Los Alcoholicos	2.450.286,26	(3)	4,0 %
5.	( 1)	7.215,40	[DPC] Team ColdFusion	635.887,66	(8)	2,1 %
6.	( 1)	6.955,41	Grutte Pier [Wa Oars]	1.634.854,62	(5)	2,0 %
7.	( 2)	5.023,64	[DPC]TeamHC	31.094,52	(83)	1,5 %
8.	()	4.360,70	TeamBVD	383.438,21	(10)	1,3 %
9.	( 3)	4.318,12	Dutch Power Chicken	281.786,65	(13)	1,3 %
10.	()	3.918,68	Team_Gaol	672.704,77	(7)	1,1 %
11.	( 9)	3.712,75	Fiestaclub.nl	215.813,43	(20)	1,1 %
12.	( 2)	3.468,28	DPC_Schotse_Hooglanders	75.327,18	(49)	1,0 %
13.	( 6)	2.882,52	borkescomputers	133.785,51	(30)	0,8 %
14.	( 1)	2.819,81	Tukkertje	295.247,38	(12)	0,8 %
15.	( 1)	2.381,44	Patman	144.933,31	(27)	0,7 %
16.	( 23)	2.213,56	AJSL	273.450,99	(16)	0,6 %
17.	( 6)	2.203,96	[DPC] Athmozz	20.472,79	(112)	0,6 %
18.	( 3)	2.171,21	Cosmic Cows	248.797,94	(17)	0,6 %
19.	( 2)	1.786,82	[DPC]Division_Brabant	212.026,77	(21)	0,5 %
20.	( 22)	1.726,72	Fauna	30.707,71	(84)	0,5 %
21.	( 1)	1.647,19	MolAnO	127.692,33	(32)	0,5 %
22.	( 5)	1.629,96	Mbc	221.441,50	(19)	0,5 %
23.	( 12)	1.607,23	Creative ID	22.213,87	(103)	0,5 %
24.	( 11)	1.525,77	Team Newton	66.753,13	(53)	0,4 %
25.	( 26)	1.372,21	MetalMike	118.124,77	(33)	0,4 %
26.	( 8)	1.350,71	[DPC] Puchelaar & TonioG	96.976,58	(37)	0,4 %
27.	( 3)	1.313,18	Basjes	25.986,92	(96)	0,4 %
28.	( 7)	1.293,63	JZ-power	275.471,50	(14)	0,4 %
29.	( 3)	1.217,77	trenza	140.143,19	(28)	0,4 %
30.	( 10)	1.167,17	Noizycows	379.138,75	(11)	0,3 %
More...

Subteams Overall Top 30
pos		overall	user	daily		procent
1.	()	3.306.290,97	Cureseekers	25.447,90	(2)	13,1 %
2.	()	3.012.264,26	[DPC]FOKschaap	162.925,00	(1)	12,0 %
3.	()	2.450.286,26	Los Alcoholicos	13.799,70	(4)	9,7 %
4.	()	1.741.797,25	Team_Elteor_Borislavj	17.469,00	(3)	6,9 %
5.	()	1.634.854,62	Grutte Pier [Wa Oars]	6.955,41	(6)	6,5 %
6.	()	708.662,23	[DPC]Team Switch	568,96	(60)	2,8 %
7.	()	672.704,77	Team_Gaol	3.918,68	(10)	2,7 %
8.	()	635.887,66	[DPC] Team ColdFusion	7.215,40	(5)	2,5 %
9.	()	615.056,29	BurnHard	141,75	(136)	2,4 %
10.	()	383.438,21	TeamBVD	4.360,70	(8)	1,5 %
11.	()	379.138,75	Noizycows	1.167,17	(30)	1,5 %
12.	()	295.247,38	Tukkertje	2.819,81	(14)	1,2 %
13.	()	281.786,65	Dutch Power Chicken	4.318,12	(9)	1,1 %
14.	( 1)	275.471,50	JZ-power	1.293,63	(28)	1,1 %
15.	( 1)	274.788,14	M_P_G	480,55	(66)	1,1 %
16.	()	273.450,99	AJSL	2.213,56	(16)	1,1 %
17.	()	248.797,94	Cosmic Cows	2.171,21	(18)	1,0 %
18.	()	243.641,05	[DPC]NGS	0,00	(232)	1,0 %
19.	()	221.441,50	Mbc	1.629,96	(22)	0,9 %
20.	()	215.813,43	Fiestaclub.nl	3.712,75	(11)	0,9 %
21.	()	212.026,77	[DPC]Division_Brabant	1.786,82	(19)	0,8 %
22.	()	197.525,52	Selwerd	0,00	(317)	0,8 %
23.	()	186.768,47	[DPC]Happy Hour	229,90	(104)	0,7 %
24.	()	169.997,18	samgiraf	859,65	(41)	0,7 %
25.	()	168.886,36	Louwrens	0,00	(522)	0,7 %
26.	()	150.598,54	[DPC] de7geitjes	886,97	(40)	0,6 %
27.	()	144.933,31	Patman	2.381,44	(15)	0,6 %
28.	()	140.143,19	trenza	1.217,77	(29)	0,6 %
29.	( 1)	135.809,38	Radiation_lan	717,86	(46)	0,5 %
30.	( 1)	133.785,51	borkescomputers	2.882,52	(13)	0,5 %
More...

Teams Daily Top 15
pos		daily	team	total		procent
1.	()	324.461,00	XtremeSystems	25.550.100,62	(2)	18,1 %
2.	( 1)	212.439,00	Free-DC	28.351.567,67	(1)	11,8 %
3.	( 1)	205.288,00	Dutch Power Cows	25.263.403,31	(3)	11,4 %
4.	()	93.932,80	TeAm AnandTech	13.265.694,51	(4)	5,2 %
5.	()	60.681,60	Phoenix Rising	5.010.058,94	(7)	3,4 %
6.	( 2)	47.373,60	Canada	4.330.747,59	(10)	2,6 %
7.	()	47.180,20	XPC	10.299.806,25	(5)	2,6 %
8.	( 2)	42.036,80	Hardware Upgrade - Seti@home	1.380.184,05	(23)	2,3 %
9.	()	27.932,10	Ars Technica	4.971.189,54	(8)	1,6 %
10.	( 2)	25.359,10	L'Alliance Francophone	2.576.509,74	(15)	1,4 %
11.	( 2)	20.880,60	US-Distributed	5.010.730,53	(6)	1,2 %
12.	( 2)	20.855,70	Team MacNN	2.195.883,31	(17)	1,2 %
13.	( 2)	20.439,80	Teddies	2.669.923,84	(14)	1,1 %
14.	()	18.668,50	BOINC Synergy	3.874.465,84	(11)	1,0 %
15.	()	18.348,30	Czech National Team	3.052.496,58	(13)	1,0 %
More...

Teams Overall Top 15
pos		overall	team	daily		procent
1.	()	28.351.567,67	Free-DC	212.439,00	(2)	12,9 %
2.	()	25.550.100,62	XtremeSystems	324.461,00	(1)	11,6 %
3.	()	25.263.403,31	Dutch Power Cows	205.288,00	(3)	11,5 %
4.	()	13.265.694,51	TeAm AnandTech	93.932,80	(4)	6,0 %
5.	()	10.299.806,25	XPC	47.180,20	(7)	4,7 %
6.	()	5.010.730,53	US-Distributed	20.880,60	(11)	2,3 %
7.	()	5.010.058,94	Phoenix Rising	60.681,60	(5)	2,3 %
8.	()	4.971.189,54	Ars Technica	27.932,10	(9)	2,3 %
9.	()	4.633.020,12	Housing and Food Services	14.628,10	(16)	2,1 %
10.	()	4.330.747,59	Canada	47.373,60	(6)	2,0 %
11.	()	3.874.465,84	BOINC Synergy	18.668,50	(14)	1,8 %
12.	()	3.278.412,03	Catalyst	860,77	(152)	1,5 %
13.	()	3.052.496,58	Czech National Team	18.348,30	(15)	1,4 %
14.	()	2.669.923,84	Teddies	20.439,80	(13)	1,2 %
15.	()	2.576.509,74	L'Alliance Francophone	25.359,10	(10)	1,2 %
More...

Mijlpalen
user	mijlpaal
[DPC] de7geitjes	150.000
Basjes	25.000
Red Metal	20.000
Chris	20.000
ZUID-CHEMIE	10.000
hubo	5.000
gertseba	5.000
ShamPoo	5.000
WPMProductions	2.000
R	1.000
Antonius	1.000

When do we reach the 26.000.000?
We will reach this goal in 3 days.

When do we get them...
days	team
121	Free-DC

When do they get us...
nobody

New members
nobody

Rosetta@home Links
Rosetta@home Homepage
Officiële stats
DPC Rosetta FAQ
DPCH Suggestiepagina
Bron

[Kristof]

Ook David Baker had iets te melden in zijn journal:

In anticipation of the soon to be coming CASP7 targets we have made a concerted effort to reduce memory use in Rosetta and I'm optimistic we can get below 100Mb for a reasonable size (150 amino acid) protein. Rhiju found that on his mac a run for a large protein used 150Mb when the graphics was off, but well over 300Mb with the graphics on. We are working to track down why the graphics are taking so much memory.

Two questions:
(1) What level of memory use are you seeing for rosetta@home (with graphics) on your computers?
(2) Should we disable the graphics in the next release to reduce memory use for larger proteins?
(at ~100Mb per work unit, there should be no problems on most machines).

[ Voor 98% gewijzigd door Kristof op 10-05-2006 07:37 ]

[Anoniem: 152769]

mijn paaltje
iedereen vergeet mij

[ Voor 63% gewijzigd door Anoniem: 152769 op 10-05-2006 08:51 ]

[archetta]

Anoniem: 152769 schreef op woensdag 10 mei 2006 @ 08:51:
mijn paaltje
iedereen vergeet mij

Gefeliciteerd Athmozz !!!

Is het zo weer wat beter??

Natuurlijk ook de andere mijlpalen gefeliciteerd, anders blijf ik straks bezig

[squeez]

Uwmoeder joint de schapen. Dat is leuk voor mijn subteampje, want we stijgen weer een plekje de onverall. Ik vrees alleen niet voor lange tijd. Het is maar een kwestie van tijd voor we de top30 uitgekickt worden...

Hé, mijn koetje staat alweer op de eerste 5.12 job te kouwen.

[ Voor 15% gewijzigd door squeez op 10-05-2006 11:40 ]

[Anoniem: 99022]

David is druk vandaag, hij meld alweer wat:

CASP7 is starting tomorrow, and we are excited both about testing the methods we have been developing over the past 9 months on proteins of unknown structure, and also testing some new ideas
that we think can really improve structure prediction for larger proteins. One of these ideas that seems very promising now is that we may be able to recognize even at the low resolution level, where computing is much faster, some topological features which distinguish native structures from random chain conformations.

One of the great things about CASP is that it inspires all the participants to come up with new ideas and approaches before and during the experiment. So in the next month you can expect both work units for casp targets with unknown structures, and work units for proteins of known structure where we are testing out very recent ideas.

[Nakebod]

Menschen, dieren en ander tuig
Ik ga minderen met R@h/DPC om een paar verschillende redenen.

Allereerst stop ik R@h op mijn normale werk pc. Dit is mijn pc met de meeste output, dus dat ga ik goed merken in de score.
En ook mijn HTPC gaat er ook mee stoppen, nu het warmer weer is geworden, gaat die CPU eng richting de 70 graden. Altijd al een heethoofd geweest, maar in de zomer gaat die niets meer doen aan R@h.

Blijven een paar andere pc's over, en die blijven gewoon doorwerken. Maar ik verwacht ongeveer 50% van mijn daily score in te leveren door 2 pc's van R@h te halen.

Betekend niet dat ik minder in de DPCH's ga komen
Ik verwacht dat ik nog wel minstens 1x per dag blijf spammen hier, en ook het nieuws op R@h/DPC vlak blijf ik gewoon volgen. En probeer uiteraard nog wel wat andere pc's erbij te krijgen

[Cpt00kirk]

dus nu wordt het wachten op de herfst en dan ben je weer vol terug?

ps. het valt me op dat er nogal wat tweakers zijn met koelingsproblemen tijdens de warmere periodes??? heb een AMD 3000+ @ 2.6 en een DUAL Xeon 3.2 @ 3.73 maar deze blijven gewoon koel met een goede koeler erop ( zalman vrijwel overal).

Xeon zit zelft in een el cheapo kast met slechte ventilatie (alleen de proc koelers en de voedingsvent!)


vind ik deze koelproblemen bij meerdere personen als enige vreemd of heb ik geluk met mijn systemen en geen problemen met de aanschafprijs van goede koelers?? wwet niet wat erop zit maar 70 graden is wel erg flink, vandaar de vraag

[ Voor 3% gewijzigd door Cpt00kirk op 10-05-2006 12:10 ]

[Kristof]

* Kristof schopt iedereen richting Tweaking & Cooling Algemeen

Nog enkele hele simpele en goedkope trucks om je pc koel te houden:
1/ (zet je pc eerst heel even uit) Open de kast, en blaas/zuig al het stof eruit. Vooral de fanguards en tussen de ribben van de cpukoeler stapelt zich vaak stof op.
2/ Zorg dat je pc verluchting heeft. Ik merk vaak dat mensen hun pc in een kast stoppen.
* Zorg dat er steeds genoeg verse lucht achter je pc kan. De voeding blaast warme lucht weg naar buiten toe. Zorg dat deze warme lucht weg kan.
* Ook hebben pc-kasten vaak een extra inlaat of uitlaat aan de zijkant. Zorg dat hier ook voldoende lucht bijkan. Zet dus je pc niet vlak tegen een kast of bureau.
3/ Een extra koeler kan vaak veel helpen. Schaf je een 120mm fan aan, en zorg dat deze op een lager toeretal draait. Vaak wordt er een fancontroller meegeleverd met een fan, of je kan het soms softwarematig regelen, ofwel kan je hem op 7V laten werken ipv 12V.
Hierdoor perk je het geluid in, terwijl je wel extra koeling hebt.

[Nakebod]

Waarschijnlijk wel rond die tijd ja
Maar alleen mijn HTPC heeft last van de warmte, die heb ik nooit onder de 45 gekregen, oud Athlon 1400je.
Deze pc, A64, 3200+, zit rond de 40/45 ofzo full load. Maar wil deze pc ook niet meer 24/7 laten draaien, en in de zomer C&Q @ 800 MHz, dus nog minder herrie/warmte.

[MetalMike]

Een tijdje geleden had iemand een bericht gepost met de mededeling dat de P4/Athlon64 SSE2 - 5.2.11-versie van de Guntec optimized client niet meer te downloaden was.

Ik was er ook naar op zoek en heb Crunch3r een mailtje gestuurd.
De link werkt dus inmiddels weer

Boinc 5.2.11 Windows SSE2

[itsalwaysme]

Cpt00kirk schreef op woensdag 10 mei 2006 @ 12:09:
[hele verhaal]

waarschijnlijk hoor je de mensen zonder koelproblemen niet, omdat het goed draait. het is vaker zo, als een paar mensen een probleem met iets hebben, en dat overal roepen. Lijkt het dat iedereen het probleem heeft..

[Megaflix]

Mensen die recent zijn ingehaald door de Fiestaclub.nl die kunnen weer gerust adem halen en vast beginnen met nieuw interieur aan te schaffen voor hun oude stekkie. Begonnen als gelegenheidsflushers bij de Stampede bleken ze regelmatig top-10 te halen, maar nu hebben ze een mooi onderdak gevonden bij Los Alcoholicos

[iH8]

Megaflix schreef op donderdag 11 mei 2006 @ 01:00:
vast beginnen met nieuw interieur aan te schaffen voor hun oude stekkie

[Anoniem: 145925]

Ongelofeloos

Met netwerkverbinding opgeschort heeft mijn linux bak geflusht

Had wat problemen met mijn internet verbinding, en nu heeft dat kreng al mijn jobs geflusht, veel te vroeg