[Rosetta@Home] hitparade van 13 maart

[Megaflix]

Eigenlijk wilde ik voor 2 uur alle stats toch wel online hebben, vroeger schenen ze namelijk ook heel erg vroeg er te staan allemaal. Toch lijkt het me niet te gaan lukken vandaag. Rosetta is de laatste die ik voor 2 uur online kan zetten volgens mij.

Vandaag een keer geen update in David Baker's Rosetta@home Journaal jammer genoeg. Dus geen dagelijks nieuws van het Rosetta-team. Misschien zijn ze nog aan het uitrusten van een druk weekend en moeten ze de resultaten nog analyseren. Een stampede zou natuurlijk uitkomst bieden. Niet omdat we Free-DC in kunnen halen, want die hebben een comfortabele voorsprong van zo'n 9 miljoen. En XS afstoppen zal ook niet zo gauw lukken, want ze produceren vandaag twee keer zoveel als wij en halen ons in over ongeveer 2 weken. Wel zou een stampede een goede impuls geven aan het project en David Baker de mogelijkheid geven om nog meer data te verzamelen in kortere tijd.

Cureseekers pakken weer een eerste plek vandaag, wat eigenlijk geen bijzonderheid meer lijkt te zijn. Wel bijzonder is dat ze als eerste subteam de 2 miljoen-paal binnenhalen. Van harte gefeliciteerd! Vandaag worden ze op de voet gevolgd door [DPC]FOKschaap die eens flink uithalen en bijna 16k uit de uiers persen. Dutch Power Chicken is geen kuikentje, maar een uit de kluiten gewassen kuiken en stijgt 168 plaatsen, om op plek 6 te stoppen. Daarmee gaat Dutch Power Chicken ook maar gelijk de top-15 binnen in de Overall-stats. De andere stijger in die lijst zijn de lawaaierige koeien van NoizyCows, die de 11e plek afnemen van JZ-Power en daarmee AJSL in het vizier krijgen.

DPC flusht er vandaag wel weer eens AnandTech uit, maar moet met lede ogen aanschouwen hoe XS er bijna 2 keer zo veel uit weet te halen. Wel opvallend is een relatief lage score van Free-DC, die 117k halen.

De mijlpaal van Cureseekers is al voorbijgekomen. Verder zijn er nog palen uit te delen aan Dutch Power Chicken, Cosmic Cows, [DPC] C0w Crunch3rz, Team_Bitstorm en IEFtm in diverse maten en soorten. De grootte van de palen mag je vandaag zelf opzoeken en bevinden zich aan de onderkant van deze stats.

Fijne dag verder, weltrusten voor als je deze stats leest voor het slapen gaan. Goeiemorgen zeg ik tegen de mensen die ze pas lezen nadat ze wakker zijn geworden met een krantje, een bak koffie en een warm croissantje.

[Rosetta@Home] hitparade van 13 maart 2006

Subteams Daily Top 30
pos		daily	user	total		procent
1.	()	17.829,60	Cureseekers	2.001.550,91	(1)	17,8 %
2.	( 2)	15.725,80	[DPC]FOKschaap	1.106.746,01	(3)	15,7 %
3.	( 1)	8.837,84	Los Alcoholicos	1.401.215,12	(2)	8,8 %
4.	( 1)	7.796,63	Grutte Pier [Wa Oars]	925.906,84	(4)	7,8 %
5.	( 3)	6.676,19	NoizyCows	180.552,68	(11)	6,7 %
6.	( 168)	5.236,23	Dutch Power Chicken	152.938,03	(15)	5,2 %
7.	( 2)	4.068,09	Team_Gaol	445.848,24	(6)	4,1 %
8.	( 2)	3.044,21	Team_Elteor_Borislavj	576.173,42	(5)	3,0 %
9.	( 3)	2.151,53	Cosmic Cows	150.582,35	(17)	2,1 %
10.	()	1.972,37	TeamBVD	119.635,95	(19)	2,0 %
11.	()	1.867,67	AJSL	183.064,58	(10)	1,9 %
12.	( 13)	1.601,77	Mbc	184.141,81	(9)	1,6 %
13.	( 6)	1.555,48	Tukkertje	151.644,16	(16)	1,6 %
14.	( 4)	1.441,89	uwmoeder	99.191,61	(21)	1,4 %
15.	( 2)	1.308,90	Selwerd	142.714,24	(18)	1,3 %
16.	( 16)	1.195,79	JZ-power	178.344,97	(12)	1,2 %
17.	( 3)	1.098,75	[DPC] de7geitjes	91.335,07	(22)	1,1 %
18.	( 5)	961,53	Biologics	51.195,91	(37)	1,0 %
19.	()	927,79	[DPC] C0w Crunch3rz	20.468,20	(56)	0,9 %
20.	( 11)	914,11	[DPC]Division_Brabant	47.917,43	(39)	0,9 %
21.	( 4)	830,80	MolAnO	48.011,03	(38)	0,8 %
22.	( 4)	780,49	Team e-Motive	57.654,48	(34)	0,8 %
23.	( 8)	690,98	Team WAFRED	53.182,40	(35)	0,7 %
24.	( 3)	661,01	Radiation_lan	101.622,30	(20)	0,7 %
25.	( 3)	638,44	jelle.k	65.048,35	(30)	0,6 %
26.	( 12)	603,95	trenza	82.341,46	(26)	0,6 %
27.	( 4)	585,08	[DPC] Team ColdFusion	62.001,01	(32)	0,6 %
28.	( 6)	445,29	Team_Bitstorm	20.074,87	(57)	0,4 %
29.	( 41)	442,75	Da_Bink	85.804,27	(24)	0,4 %
30.	( 14)	409,66	Dogooder	24.871,80	(50)	0,4 %
More...

Subteams Overall Top 30
pos		overall	user	daily		procent
1.	()	2.001.550,91	Cureseekers	17.829,60	(1)	17,4 %
2.	()	1.401.215,12	Los Alcoholicos	8.837,84	(3)	12,2 %
3.	()	1.106.746,01	[DPC]FOKschaap	15.725,80	(2)	9,6 %
4.	()	925.906,84	Grutte Pier [Wa Oars]	7.796,63	(4)	8,1 %
5.	()	576.173,42	Team_Elteor_Borislavj	3.044,21	(8)	5,0 %
6.	()	445.848,24	Team_Gaol	4.068,09	(7)	3,9 %
7.	()	376.841,34	BurnHard	0,00	(150)	3,3 %
8.	()	356.697,78	[DPC]Team Switch	109,02	(57)	3,1 %
9.	()	184.141,81	Mbc	1.601,77	(12)	1,6 %
10.	()	183.064,58	AJSL	1.867,67	(11)	1,6 %
11.	( 1)	180.552,68	NoizyCows	6.676,19	(5)	1,6 %
12.	( 1)	178.344,97	JZ-power	1.195,79	(16)	1,6 %
13.	()	170.682,19	[DPC]Happy Hour	180,78	(47)	1,5 %
14.	()	168.707,12	M_P_G	0,00	(141)	1,5 %
15.	( 2)	152.938,03	Dutch Power Chicken	5.236,23	(6)	1,3 %
16.	( 1)	151.644,16	Tukkertje	1.555,48	(13)	1,3 %
17.	( 1)	150.582,35	Cosmic Cows	2.151,53	(9)	1,3 %
18.	()	142.714,24	Selwerd	1.308,90	(15)	1,2 %
19.	()	119.635,95	TeamBVD	1.972,37	(10)	1,0 %
20.	()	101.622,30	Radiation_lan	661,01	(24)	0,9 %
21.	()	99.191,61	uwmoeder	1.441,89	(14)	0,9 %
22.	()	91.335,07	[DPC] de7geitjes	1.098,75	(17)	0,8 %
23.	()	87.235,12	Purplebear	143,92	(53)	0,8 %
24.	()	85.804,27	Da_Bink	442,75	(29)	0,7 %
25.	()	84.448,88	Team_Kwakende_kip	0,00	(191)	0,7 %
26.	()	82.341,46	trenza	603,95	(26)	0,7 %
27.	()	73.766,77	Brainy007	73,14	(68)	0,6 %
28.	()	68.349,58	DPC Frederik	90,84	(62)	0,6 %
29.	()	66.358,26	teamRC	0,00	(164)	0,6 %
30.	()	65.048,35	jelle.k	638,44	(25)	0,6 %
More...

Teams Daily Top 15
pos		daily	team	total		procent
1.	()	200.266,00	XtremeSystems	10.230.750,73	(3)	15,7 %
2.	()	117.295,00	Free-DC	20.459.505,05	(1)	9,2 %
3.	( 1)	101.140,00	Dutch Power Cows	11.695.313,00	(2)	7,9 %
4.	( 1)	96.799,20	TeAm AnandTech	7.868.264,88	(4)	7,6 %
5.	()	62.956,60	XPC	7.389.189,66	(5)	4,9 %
6.	()	39.482,00	Canada	2.743.437,14	(11)	3,1 %
7.	()	39.143,80	Phoenix Rising	2.254.889,12	(12)	3,1 %
8.	( 1)	28.775,80	ARS Technica - Team Vino Rose	3.544.662,64	(8)	2,3 %
9.	( 2)	23.272,40	Teddies	1.507.572,19	(15)	1,8 %
10.	()	23.115,00	Rechenkraft.net	1.436.085,62	(17)	1,8 %
11.	( 3)	22.190,80	US-Distributed	3.714.952,22	(7)	1,7 %
12.	()	20.364,80	The Clangers	1.235.181,80	(21)	1,6 %
13.	()	18.772,60	L'Alliance Francophone	1.353.773,79	(19)	1,5 %
14.	( 2)	18.259,80	Czech National Team	2.137.245,52	(13)	1,4 %
15.	( 1)	18.075,10	Housing and Food Services	3.945.272,50	(6)	1,4 %
More...

Teams Overall Top 15
pos		overall	team	daily		procent
1.	()	20.459.505,05	Free-DC	117.295,00	(2)	15,1 %
2.	()	11.695.313,00	Dutch Power Cows	101.140,00	(3)	8,6 %
3.	()	10.230.750,73	XtremeSystems	200.266,00	(1)	7,6 %
4.	()	7.868.264,88	TeAm AnandTech	96.799,20	(4)	5,8 %
5.	()	7.389.189,66	XPC	62.956,60	(5)	5,5 %
6.	()	3.945.272,50	Housing and Food Services	18.075,10	(15)	2,9 %
7.	()	3.714.952,22	US-Distributed	22.190,80	(11)	2,7 %
8.	()	3.544.662,64	ARS Technica - Team Vino Rose	28.775,80	(8)	2,6 %
9.	()	3.238.993,20	Catalyst	684,66	(130)	2,4 %
10.	()	3.011.620,85	BOINC Synergy	15.259,10	(16)	2,2 %
11.	()	2.743.437,14	Canada	39.482,00	(6)	2,0 %
12.	()	2.254.889,12	Phoenix Rising	39.143,80	(7)	1,7 %
13.	()	2.137.245,52	Czech National Team	18.259,80	(14)	1,6 %
14.	()	1.845.816,20	AMD Users	6.516,97	(27)	1,4 %
15.	()	1.507.572,19	Teddies	23.272,40	(9)	1,1 %
More...

Mijlpalen
user	mijlpaal
Cureseekers	2.000.000
Dutch Power Chicken	150.000
Cosmic Cows	150.000
[DPC] C0w Crunch3rz	20.000
Team_Bitstorm	20.000
IEFtm	5.000

When do we reach the 12.000.000?
We will reach this goal in 3 days.

When do we get them...
nobody

When do they get us...
days	team
16	XtremeSystems

New members
AES_koetje
paraiko

Rosetta@home Links
Rosetta@home Homepage
Officiële stats
DPC Rosetta FAQ
DPCH Suggestiepagina
Bron

[ Voor 10% gewijzigd door Megaflix op 14-03-2006 02:00 ]

[Wessie]

De top 10 (top 9) is nu wel heerlijk dichtbij!
Die gaan we pakken!!!!

[mcB]

En daar is ie dan eindelijk; de 2 miljoen mijlP A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A L
Thx for noticing en thx voor de felicitaties

Mensen vragen me wel eens,.. "Cureseekers, .. is het niet eenzaam aan de top?"
en dan zeg ik,.... "Ja,... het is eenzaam aan de top" _HT

Gelukkig doet DPC nu weer eens meer dan 100K. Het is niet veel meer, maar toch meer. Dat zorgt er ook voor dat CS nu slecht eens aandeel van minder dan 20% van het dagtotaal heeft gedaan. Als we nou eens afspreken dat wij hetzelfde blijven flushen en dat de rest van DPC hun best gaat doen om ons dagpercentage structureel terug te brengen naar 10%.

[squeez]

Jooo, dikke paal voor de Cureseekers!
Van harte gefeliciteerd mannen! (en mssn wel vrouwen)

Ook DPC doet het vandaag aardig, maar XS komt gevaarlijk dicht bij. Tijd om weer wat pctjes te infecteren.

[Nakebod]

Gister geen Journal, vandaag niet.. niet om 2 uur van8 that was

Several new things today:

We will be acknowledging the lucky individuals who find the lowest energy and lowest rmsd models on the main news page in addition to the top results page. We are looking into possibilities for certificates. I assume giving bonus credits for low rmsd and low energy structures would not be a popular idea.

Today's protein is 2tif, a protein which plays a critical role in the initiation of translation. Translation is the process by which information in the genetic code is read to create proteins with specific amino acid sequences. You can see on the top results page that the low energy model has the same overall shape as the actual structure. The major differences are in the red bit at the C terminal end of the protein.

David and Keith are setting up multiple load sharing web servers to reduce the load which has caused some of the slowdowns on the web site.

Rhiju is testing an approach he and I think should yield improved results on a number of the proteins you have become familiar with. He will give you a report in a few days.

Klinkt goed, een soort van certificaat voor je goede resultaten.
En ze werken ook aan een loadbalancer voor de website, is ook weer positief voor de bereikbaarheid.

En CS, veel plezier met de mega paal
Voorlopig zijn jullie nog wel de enige met de 2 miljoen.

[mind_]

CureSeekers

[Lord_Nemesis]

March 13, 2006
We will now be posting top predictions each day!

Today's protein: 1tif


Lowest Energy Structure predicted by: BurnHard (Team Dutch Power Cows)
Lowest RMSD Structure predicted by: Al83
For details and pictures of the predicted structures, see the top predictions page
Congratulations to today's winners!

Gefeli BurnHard!

[Verwijderd]

[quote]squeez schreef op dinsdag 14 maart 2006 @ 07:53:
Jooo, dikke paal voor de Cureseekers!
Van harte gefeliciteerd mannen! (en mssn wel vrouwen)
/quote]
Bedankt voor de felicitaties en ja hoor, vrouwen zijn hier bij ons ook aanwezig

[Megaflix]

BurnHard gefeliciteerd!

[Sempy]

14-3-2006 11:48:47||Suspending computation and network activity - running CPU benchmarks
14-3-2006 11:48:47|rosetta@home|Pausing result FA_RLXc9_hom023_1c9oA_359_137_0 (removed from memory)
14-3-2006 11:48:49|rosetta@home|Unrecoverable error for result FA_RLXc9_hom023_1c9oA_359_137_0 ( - exit code -164 (0xffffff5c))

Vergelijkbare foutmeldingen heb ik de laatste tijd diverse keren gekregen zodra de benchmark ging lopen. Voorheen gaf dit nooit problemen, maar de afgelopen 1,5 week al zo'n 250 punten misgelopen hierdoor.

Iemand een idee wat hier aan de hand kan zijn en of er wat aan te doen is?

[Megaflix]

als hij uit het geheugen gehaald wordt, dan moet je Leave applications in memory while preemted aanzetten toch? Instellingen van Boinc (general preferences)

[archetta]

Speciaal voor de Cureseekers:



2 meloen veel plezier ermee!

[AES]

Megaflix schreef op dinsdag 14 maart 2006 @ 13:19:
als hij uit het geheugen gehaald wordt, dan moet je Leave applications in memory while preemted aanzetten toch? Instellingen van Boinc (general preferences)

Volgens mij heb je helemaal gelijk met general preferences. Staat nu als voorkeur ingesteld.
Heb je al gestemd

[Verwijderd]

@ archetta, mmh lekker bedankt voor deze frisse hap.

[Sempy]

Megaflix schreef op dinsdag 14 maart 2006 @ 13:19:
als hij uit het geheugen gehaald wordt, dan moet je Leave applications in memory while preemted aanzetten toch? Instellingen van Boinc (general preferences)

Lijkt me een goede oplossing, bedankt !

[paraiko]

Ik ben alvast aan het oefenen geslagen met de boinc client, omdat het er wel erg op lijkt dat de stampede naar Rosetta gaat komen. Op mijn laptop (win) had ik boinc + Rosetta zo aan de praat.

Op mijn dual opteron bak (amd-64 debian 3.1, geen gui ) krijg ik (de geoptimaliseerde) boinc wel aan de praat, kan ik wel attachen aan het project, maar Rosetta geeft geen werk uit.

In de logfiles vind ik terug dat server mij meldt dat er geen rosseta client beschikbaar is voor x86-64 / gnu linux

Als ik op het rosetta forum / google zoek vind ik wat obscure draadjes uit 2005 die suggereren dat je een app_info.xml zou moeten maken, maar voor de rest is alleen maar te vinden hoe je dat doet voor een zelfgecompileerde seti@home science app.

Na een halve dag prutsen heb ik het eigenlijk wel een beetje gehad.
Is er hier iemand die al een X86-64 rosetta client heeft draaien en mij kan vertellen hoe ik dat ook voor elkaar kan krijgen??

(Het is op dit moment helaas geen optie om de bak over te zetten naar een 32-bit installatie.)

Alvast bedankt!

[Cpt00kirk]

wellicht heb je hier wat aan.. : http://www.free-dc.org/fo...highlight=opteron+rosetta

[BurnHard]

LordNemesis schreef op dinsdag 14 maart 2006 @ 10:18:
[...]

Gefeli BurnHard!

Dank je, dacht niet dat ik geflushed had maarja

[Nakebod]

paraiko schreef op dinsdag 14 maart 2006 @ 16:16:
Ik ben alvast aan het oefenen geslagen met de boinc client, omdat het er wel erg op lijkt dat de stampede naar Rosetta gaat komen. Op mijn laptop (win) had ik boinc + Rosetta zo aan de praat.

Op mijn dual opteron bak (amd-64 debian 3.1, geen gui ) krijg ik (de geoptimaliseerde) boinc wel aan de praat, kan ik wel attachen aan het project, maar Rosetta geeft geen werk uit.

In de logfiles vind ik terug dat server mij meldt dat er geen rosseta client beschikbaar is voor x86-64 / gnu linux

Als ik op het rosetta forum / google zoek vind ik wat obscure draadjes uit 2005 die suggereren dat je een app_info.xml zou moeten maken, maar voor de rest is alleen maar te vinden hoe je dat doet voor een zelfgecompileerde seti@home science app.

Na een halve dag prutsen heb ik het eigenlijk wel een beetje gehad.
Is er hier iemand die al een X86-64 rosetta client heeft draaien en mij kan vertellen hoe ik dat ook voor elkaar kan krijgen??

(Het is op dit moment helaas geen optie om de bak over te zetten naar een 32-bit installatie.)

Alvast bedankt!

Weet je zeker dat hij goed attached is?
Dus starten met /boinc -attach_project http://boinc.bakerlab.org/rosetta [accountkey]
En accountkey is niet je wachtwoord, maar een lange key, te verkrijgen op http://boinc.bakerlab.org/rosetta/get_passwd.php
Na benchmark BOINC killen met killall boinc
En daarna BOINC starten op de achtergrond, en met logfile: nohup ./boinc -return_results_immediately>>boinc.log 2>>error.log &

[mcB]

Bedankt voor de felicitaties allemaal!!

[JustMe]

whoei deze had ik even gemist, maar hij is fijn