Ik zou zeker geen FIXMBR doen, zoals die waarschuwing zegt het kan fout gaan en uit ervaring spreek ik dat het 1/20 gevallen toch wel es fout durft gaan, doe dat liever als laatste redding.
Ik zou booten van de Windows CD, naar veilige modus gaan, de gehele "Documents and Settings" map kopiëren naar de 2e partitie/HDD/USB/.. en daar boven een nieuwe Windows installeren.
Zo behoud je wel nog al je programma's en belangrijkste data maar moet je alle programma's opnieuw installeren en ben je register instellingen kwijt, ook mails e.d.
Vandaar dat je een kopie neemt van de "Documents and Settings" map, want daar zitten de belangrijkste zaken (in Application Data mails e.d.).
Als je ruimte zat hebt evt gehele C:\ kopieren naar 2e partie/HDD/USB/...
Persoonlijk zou ik opteren om de HDD eruit te halen en die als slave bij een 2e PC te hangen, zo kun je allereerst veilig alles backuppen en dan kun je aan de slag met FIXMBR, en andere tools.
Is dat echt uitgesloten dan valt er weinig te doen, kans wagen met FIXMBR of de huidige Windows installatie overschrijven.